Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JVL5

Protein Details
Accession B6JVL5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-210AVNASATKKKKKRKLSVQEGVGKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-200KKKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 12.166, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018622  DNA_damage_chkpnt_Lcd1  
Gene Ontology GO:0070310  C:ATR-ATRIP complex  
GO:0140445  C:chromosome, telomeric repeat region  
GO:0031573  P:mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling  
GO:0070198  P:protein localization to chromosome, telomeric region  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
Pfam View protein in Pfam  
PF09798  LCD1  
Amino Acid Sequences MDVDIDSESEELFEGIDLDELEQQAQSQVQKQNHARESIDSIEELPFQPASVSDKQSFKVQELEKQLLIRSGENSILRSNLQKQSEQHNRTIEALNAHVKSVQEEYQSKIRNLEQEIERVKTESCFFEKEAQDATLNLKKLQKLNQQGKNESNTQKNTSTDIFQDPAAAFHSNVDDWDPLPEQIKVAVNASATKKKKKRKLSVQEGVGKSSSSVPRQNDDPQHEATIDLLCEQLVQLEQQNGIWLVSRGLGEIYGGLLTELSALEDEEGQARVSMLTKLIYDPVAFDTVNTYVQSLIQLIEEIFVVALKKSYWSAAGTILTLSLAIMTMEPDMVENILQSKIPSLANDCACTLVREKEVHQVAFERCINFLCTCLYNSSALTSNTQLQSQVSPMLFERCIDFQQPTHVIKLGLRILMSSIKPSAIACVPLVNPPENDQRLVYGIFSTLSRILADEKRAAKNHLEFLSIHDMVLQLLLHFYKQTKPIGLDVLQACSPLVPSFALATCWYLQLIQQGFQPTESYAQNLVNLLRITYLVAPSDLSTRLVNSGHGLLQRYVAAVASCTYGDLEYMSFQRSAKEVSTLSAEILELCVSPEELDSLYTLFDQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.07
4 0.07
5 0.08
6 0.1
7 0.1
8 0.11
9 0.1
10 0.1
11 0.11
12 0.13
13 0.15
14 0.2
15 0.27
16 0.31
17 0.41
18 0.47
19 0.56
20 0.58
21 0.6
22 0.54
23 0.5
24 0.51
25 0.45
26 0.4
27 0.3
28 0.27
29 0.24
30 0.24
31 0.21
32 0.18
33 0.14
34 0.13
35 0.12
36 0.12
37 0.17
38 0.21
39 0.26
40 0.29
41 0.32
42 0.34
43 0.41
44 0.41
45 0.37
46 0.4
47 0.37
48 0.39
49 0.43
50 0.46
51 0.41
52 0.41
53 0.4
54 0.36
55 0.35
56 0.29
57 0.24
58 0.22
59 0.24
60 0.24
61 0.25
62 0.22
63 0.22
64 0.21
65 0.25
66 0.3
67 0.32
68 0.34
69 0.37
70 0.39
71 0.48
72 0.58
73 0.57
74 0.56
75 0.54
76 0.52
77 0.51
78 0.5
79 0.41
80 0.33
81 0.32
82 0.32
83 0.28
84 0.26
85 0.25
86 0.23
87 0.22
88 0.23
89 0.22
90 0.22
91 0.23
92 0.27
93 0.34
94 0.38
95 0.37
96 0.38
97 0.38
98 0.37
99 0.38
100 0.42
101 0.36
102 0.4
103 0.43
104 0.41
105 0.38
106 0.34
107 0.31
108 0.26
109 0.26
110 0.22
111 0.22
112 0.23
113 0.25
114 0.32
115 0.32
116 0.31
117 0.31
118 0.28
119 0.25
120 0.23
121 0.27
122 0.23
123 0.23
124 0.25
125 0.26
126 0.29
127 0.33
128 0.41
129 0.44
130 0.5
131 0.59
132 0.64
133 0.67
134 0.69
135 0.69
136 0.65
137 0.64
138 0.6
139 0.58
140 0.54
141 0.51
142 0.49
143 0.45
144 0.44
145 0.38
146 0.34
147 0.3
148 0.28
149 0.24
150 0.21
151 0.22
152 0.18
153 0.17
154 0.17
155 0.15
156 0.11
157 0.11
158 0.13
159 0.1
160 0.11
161 0.12
162 0.1
163 0.09
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.13
168 0.13
169 0.11
170 0.13
171 0.15
172 0.13
173 0.13
174 0.14
175 0.13
176 0.17
177 0.21
178 0.27
179 0.3
180 0.39
181 0.46
182 0.55
183 0.64
184 0.7
185 0.77
186 0.8
187 0.87
188 0.88
189 0.88
190 0.86
191 0.86
192 0.76
193 0.67
194 0.56
195 0.45
196 0.34
197 0.31
198 0.26
199 0.22
200 0.26
201 0.26
202 0.28
203 0.32
204 0.38
205 0.39
206 0.41
207 0.4
208 0.36
209 0.35
210 0.33
211 0.29
212 0.24
213 0.18
214 0.12
215 0.09
216 0.07
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.03
292 0.04
293 0.03
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.06
309 0.05
310 0.03
311 0.03
312 0.02
313 0.02
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.11
332 0.15
333 0.16
334 0.17
335 0.16
336 0.16
337 0.16
338 0.17
339 0.15
340 0.13
341 0.15
342 0.16
343 0.17
344 0.23
345 0.26
346 0.25
347 0.23
348 0.25
349 0.23
350 0.27
351 0.28
352 0.21
353 0.18
354 0.19
355 0.2
356 0.16
357 0.16
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.13
362 0.13
363 0.12
364 0.12
365 0.13
366 0.14
367 0.13
368 0.14
369 0.14
370 0.17
371 0.17
372 0.18
373 0.16
374 0.14
375 0.14
376 0.14
377 0.16
378 0.11
379 0.11
380 0.12
381 0.14
382 0.14
383 0.13
384 0.14
385 0.13
386 0.14
387 0.15
388 0.15
389 0.13
390 0.18
391 0.23
392 0.22
393 0.22
394 0.22
395 0.22
396 0.21
397 0.26
398 0.22
399 0.18
400 0.16
401 0.15
402 0.15
403 0.18
404 0.18
405 0.14
406 0.13
407 0.12
408 0.12
409 0.12
410 0.14
411 0.11
412 0.12
413 0.1
414 0.12
415 0.13
416 0.16
417 0.18
418 0.17
419 0.17
420 0.2
421 0.28
422 0.27
423 0.27
424 0.24
425 0.23
426 0.23
427 0.22
428 0.19
429 0.11
430 0.1
431 0.09
432 0.09
433 0.1
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.13
439 0.16
440 0.19
441 0.23
442 0.27
443 0.33
444 0.35
445 0.37
446 0.38
447 0.39
448 0.43
449 0.38
450 0.35
451 0.3
452 0.33
453 0.38
454 0.32
455 0.28
456 0.21
457 0.2
458 0.18
459 0.18
460 0.13
461 0.05
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.09
467 0.13
468 0.18
469 0.21
470 0.23
471 0.25
472 0.27
473 0.3
474 0.3
475 0.31
476 0.28
477 0.28
478 0.25
479 0.23
480 0.21
481 0.16
482 0.16
483 0.1
484 0.1
485 0.07
486 0.07
487 0.09
488 0.1
489 0.11
490 0.11
491 0.13
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.11
496 0.12
497 0.17
498 0.18
499 0.17
500 0.19
501 0.23
502 0.23
503 0.23
504 0.23
505 0.17
506 0.2
507 0.19
508 0.18
509 0.17
510 0.18
511 0.18
512 0.19
513 0.18
514 0.19
515 0.18
516 0.16
517 0.14
518 0.13
519 0.14
520 0.14
521 0.15
522 0.11
523 0.11
524 0.12
525 0.12
526 0.15
527 0.14
528 0.14
529 0.13
530 0.14
531 0.16
532 0.16
533 0.16
534 0.16
535 0.17
536 0.18
537 0.21
538 0.23
539 0.2
540 0.21
541 0.21
542 0.19
543 0.17
544 0.15
545 0.12
546 0.1
547 0.1
548 0.1
549 0.09
550 0.09
551 0.1
552 0.09
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.1
557 0.12
558 0.14
559 0.15
560 0.15
561 0.17
562 0.18
563 0.21
564 0.19
565 0.23
566 0.21
567 0.21
568 0.26
569 0.25
570 0.23
571 0.2
572 0.19
573 0.14
574 0.14
575 0.13
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.09
581 0.09
582 0.09
583 0.09
584 0.1
585 0.1
586 0.09