Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JYM0

Protein Details
Accession B6JYM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
478-500VNEKLHRNLRKVKGRSQKQLICMHydrophilic
520-542LCNACGLRWAKQQKRLKRAAKNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
534-538RLKRA
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13.5, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0071483  P:cellular response to blue light  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MPSSNANSSVNPLLDQSETFVSTADASTDILPPSEDPFLDAVEQGMLETVNTVASGSESAPLNPTVAGMAGNSSLVTDLPKQLQSNALIDPLGEGLLSEPASALLRSELPTDNGISFPATSAMFEVNANDVAPLSLASDTLVDSGGLPTISPTSMTASNALCDALSTVAGVSDTADSAYSTSSGRTTESVSGFPFFVDTQGAANTDEDLPQQCFGGRSQSLFSAFFPSANLPVTHHSNESSSSEHSLARPSNFFLRRRNWMQWTPSDSSLYRRSRCLCQVAFYHWLECRNVLCCYSRFPLTPWSPLDWCESEFQQLAVFLMAKKWTSSCRKGFNEAFNESFGDPDTPFQLVYRIRNQRGEPQTVESVGKFHLLRQISALSISGETTPINLASKQSTSSLPSEVLANVEFDNYETLNQQGFTGDYASEFAPSNVLQRPNDSAQAPVSASSVQTHSNVHESFKANRNIGTVNDKVDLHSVNEKLHRNLRKVKGRSQKQLICMECGTSESPEWRKGPTGPKMLCNACGLRWAKQQKRLKRAAKNS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.18
4 0.17
5 0.17
6 0.16
7 0.15
8 0.14
9 0.13
10 0.13
11 0.11
12 0.09
13 0.09
14 0.11
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.13
19 0.13
20 0.15
21 0.16
22 0.15
23 0.14
24 0.15
25 0.16
26 0.16
27 0.15
28 0.12
29 0.1
30 0.1
31 0.08
32 0.08
33 0.06
34 0.05
35 0.06
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.07
43 0.06
44 0.1
45 0.11
46 0.11
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.06
56 0.07
57 0.06
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.08
64 0.09
65 0.13
66 0.16
67 0.2
68 0.2
69 0.21
70 0.26
71 0.26
72 0.26
73 0.24
74 0.21
75 0.18
76 0.17
77 0.16
78 0.12
79 0.09
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.09
93 0.1
94 0.13
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.17
99 0.17
100 0.15
101 0.15
102 0.13
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.09
141 0.11
142 0.12
143 0.14
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.11
174 0.15
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.17
179 0.16
180 0.15
181 0.14
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.14
203 0.13
204 0.14
205 0.14
206 0.16
207 0.17
208 0.17
209 0.17
210 0.15
211 0.15
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.12
216 0.13
217 0.12
218 0.09
219 0.12
220 0.16
221 0.16
222 0.16
223 0.16
224 0.15
225 0.17
226 0.17
227 0.16
228 0.13
229 0.14
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.16
237 0.15
238 0.22
239 0.27
240 0.3
241 0.33
242 0.35
243 0.41
244 0.45
245 0.49
246 0.47
247 0.47
248 0.48
249 0.46
250 0.47
251 0.43
252 0.39
253 0.36
254 0.3
255 0.3
256 0.35
257 0.36
258 0.32
259 0.32
260 0.34
261 0.36
262 0.4
263 0.42
264 0.33
265 0.31
266 0.31
267 0.31
268 0.34
269 0.3
270 0.28
271 0.22
272 0.24
273 0.21
274 0.2
275 0.17
276 0.14
277 0.15
278 0.14
279 0.15
280 0.14
281 0.18
282 0.19
283 0.2
284 0.18
285 0.19
286 0.26
287 0.26
288 0.3
289 0.28
290 0.29
291 0.27
292 0.28
293 0.3
294 0.23
295 0.22
296 0.19
297 0.17
298 0.16
299 0.16
300 0.15
301 0.11
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.05
307 0.07
308 0.08
309 0.07
310 0.08
311 0.09
312 0.16
313 0.23
314 0.31
315 0.35
316 0.43
317 0.46
318 0.53
319 0.56
320 0.56
321 0.54
322 0.5
323 0.45
324 0.37
325 0.35
326 0.28
327 0.24
328 0.17
329 0.13
330 0.1
331 0.09
332 0.1
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.13
337 0.14
338 0.19
339 0.27
340 0.34
341 0.37
342 0.42
343 0.44
344 0.48
345 0.51
346 0.52
347 0.45
348 0.4
349 0.39
350 0.35
351 0.35
352 0.25
353 0.21
354 0.16
355 0.18
356 0.14
357 0.13
358 0.18
359 0.18
360 0.18
361 0.19
362 0.19
363 0.16
364 0.16
365 0.15
366 0.1
367 0.09
368 0.1
369 0.08
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.1
378 0.11
379 0.12
380 0.13
381 0.15
382 0.15
383 0.17
384 0.18
385 0.19
386 0.17
387 0.16
388 0.16
389 0.15
390 0.14
391 0.11
392 0.11
393 0.09
394 0.09
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.08
410 0.07
411 0.09
412 0.09
413 0.1
414 0.1
415 0.09
416 0.1
417 0.1
418 0.13
419 0.17
420 0.21
421 0.21
422 0.23
423 0.28
424 0.29
425 0.33
426 0.3
427 0.27
428 0.23
429 0.25
430 0.23
431 0.18
432 0.16
433 0.13
434 0.13
435 0.13
436 0.13
437 0.13
438 0.14
439 0.15
440 0.16
441 0.21
442 0.22
443 0.22
444 0.26
445 0.28
446 0.33
447 0.4
448 0.45
449 0.4
450 0.4
451 0.41
452 0.37
453 0.37
454 0.37
455 0.31
456 0.27
457 0.28
458 0.27
459 0.26
460 0.27
461 0.25
462 0.22
463 0.26
464 0.25
465 0.26
466 0.33
467 0.37
468 0.39
469 0.47
470 0.51
471 0.53
472 0.61
473 0.67
474 0.7
475 0.72
476 0.76
477 0.79
478 0.81
479 0.84
480 0.84
481 0.8
482 0.77
483 0.8
484 0.72
485 0.66
486 0.57
487 0.48
488 0.38
489 0.34
490 0.28
491 0.22
492 0.21
493 0.23
494 0.27
495 0.32
496 0.33
497 0.33
498 0.36
499 0.4
500 0.48
501 0.5
502 0.55
503 0.52
504 0.57
505 0.62
506 0.61
507 0.57
508 0.53
509 0.46
510 0.36
511 0.42
512 0.38
513 0.37
514 0.44
515 0.52
516 0.55
517 0.63
518 0.72
519 0.73
520 0.81
521 0.86
522 0.86