Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JVB5

Protein Details
Accession B6JVB5    Localization Confidence High Confidence Score 23.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-57TMSGVQNTTKKKPDKKSRNQIRREKKKLKRLQVKKEQDTGAHydrophilic
149-173DGNHTLSKKKARRLRRKTVAQLKMLHydrophilic
566-588EQVQKVSAKRQRPAPTKKEKFRLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-50KKKPDKKSRNQIRREKKKLKRLQVK
156-165KKKARRLRRK
574-587KRQRPAPTKKEKFR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007180  DUF382  
IPR006568  PSP_pro-rich  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF04037  DUF382  
PF04046  PSP  
Amino Acid Sequences MSSAVTDSAPVADNLITMSGVQNTTKKKPDKKSRNQIRREKKKLKRLQVKKEQDTGAAQTLTDHHAKDKSLVKKEEPEDSIYDTPVVVESITIESDDPLYSQFQHILEKFRVEETEDATGEYGRGQIMFSDEEELSEGENAEGEGDHADGNHTLSKKKARRLRRKTVAQLKMLAEHPEVVEWWDVSSPDPLLLVHLKGYRCTIPVPQHWNQKRDYLSGQRGVEKKLFELPSYIRATGIMQMREAVHQKEADMSLRQKMREKVQPKMGKLDIDYQKLHDAFFRFQTKPIMTGFGECYYEGKELEANIKEKRPGDISEELRDALGIAVGAPPPWLFAMQRYGPPPSYPNLKIPGVNCPIPEGAQWGFHPGGWGKPPVDQFNRPLYGDVFGNAKPRMPEMEAEPVNRQRWGELEEFEEEESSSDEEEEEEEPEEDMGHPEMEEHAHIQHTTHEPSRPAAATVEPITSYGIAEDLAPENMELRKNARPKSSTSDEKLYHVLPEKATRPEGFMAQQTRYETPSTSADYDQQGRKRKAEDVPITTKLNNSEDARSRNPGSDWQNDLSEMVAEQVQKVSAKRQRPAPTKKEKFRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.08
4 0.08
5 0.09
6 0.1
7 0.12
8 0.14
9 0.2
10 0.25
11 0.33
12 0.42
13 0.5
14 0.57
15 0.67
16 0.76
17 0.81
18 0.86
19 0.91
20 0.93
21 0.94
22 0.95
23 0.95
24 0.95
25 0.95
26 0.95
27 0.94
28 0.93
29 0.93
30 0.93
31 0.94
32 0.93
33 0.93
34 0.93
35 0.93
36 0.94
37 0.9
38 0.88
39 0.78
40 0.71
41 0.64
42 0.57
43 0.51
44 0.4
45 0.32
46 0.25
47 0.25
48 0.25
49 0.25
50 0.21
51 0.19
52 0.22
53 0.23
54 0.28
55 0.35
56 0.4
57 0.46
58 0.51
59 0.52
60 0.58
61 0.6
62 0.62
63 0.56
64 0.51
65 0.44
66 0.45
67 0.41
68 0.33
69 0.3
70 0.22
71 0.19
72 0.16
73 0.14
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.14
90 0.14
91 0.2
92 0.22
93 0.27
94 0.27
95 0.29
96 0.28
97 0.27
98 0.27
99 0.23
100 0.23
101 0.2
102 0.23
103 0.2
104 0.2
105 0.18
106 0.18
107 0.15
108 0.13
109 0.11
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.13
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.06
126 0.07
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.08
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.17
142 0.28
143 0.33
144 0.42
145 0.49
146 0.57
147 0.67
148 0.76
149 0.83
150 0.84
151 0.87
152 0.89
153 0.91
154 0.87
155 0.79
156 0.75
157 0.64
158 0.58
159 0.49
160 0.41
161 0.31
162 0.24
163 0.21
164 0.15
165 0.14
166 0.12
167 0.11
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.1
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.09
179 0.1
180 0.09
181 0.11
182 0.15
183 0.15
184 0.16
185 0.19
186 0.17
187 0.17
188 0.18
189 0.21
190 0.24
191 0.31
192 0.38
193 0.41
194 0.51
195 0.56
196 0.58
197 0.54
198 0.53
199 0.49
200 0.44
201 0.44
202 0.42
203 0.41
204 0.44
205 0.43
206 0.43
207 0.43
208 0.42
209 0.4
210 0.32
211 0.28
212 0.28
213 0.28
214 0.22
215 0.23
216 0.22
217 0.26
218 0.28
219 0.27
220 0.19
221 0.19
222 0.19
223 0.21
224 0.24
225 0.17
226 0.14
227 0.15
228 0.16
229 0.18
230 0.2
231 0.16
232 0.14
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.15
237 0.14
238 0.15
239 0.15
240 0.19
241 0.22
242 0.23
243 0.27
244 0.3
245 0.34
246 0.39
247 0.41
248 0.42
249 0.49
250 0.54
251 0.49
252 0.52
253 0.47
254 0.4
255 0.38
256 0.41
257 0.36
258 0.34
259 0.33
260 0.28
261 0.3
262 0.29
263 0.27
264 0.21
265 0.18
266 0.16
267 0.21
268 0.25
269 0.22
270 0.23
271 0.27
272 0.25
273 0.25
274 0.23
275 0.22
276 0.16
277 0.17
278 0.17
279 0.14
280 0.14
281 0.12
282 0.12
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.12
290 0.14
291 0.15
292 0.16
293 0.18
294 0.2
295 0.2
296 0.21
297 0.2
298 0.19
299 0.22
300 0.27
301 0.28
302 0.28
303 0.28
304 0.26
305 0.24
306 0.22
307 0.17
308 0.09
309 0.07
310 0.04
311 0.03
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.12
323 0.13
324 0.16
325 0.17
326 0.19
327 0.19
328 0.2
329 0.21
330 0.18
331 0.23
332 0.23
333 0.25
334 0.27
335 0.28
336 0.29
337 0.28
338 0.34
339 0.31
340 0.3
341 0.26
342 0.24
343 0.23
344 0.21
345 0.2
346 0.15
347 0.12
348 0.12
349 0.13
350 0.14
351 0.14
352 0.13
353 0.15
354 0.12
355 0.14
356 0.14
357 0.16
358 0.14
359 0.17
360 0.2
361 0.25
362 0.3
363 0.31
364 0.33
365 0.38
366 0.4
367 0.36
368 0.34
369 0.28
370 0.25
371 0.22
372 0.19
373 0.14
374 0.13
375 0.17
376 0.16
377 0.17
378 0.16
379 0.17
380 0.18
381 0.17
382 0.17
383 0.16
384 0.25
385 0.25
386 0.27
387 0.31
388 0.33
389 0.33
390 0.33
391 0.3
392 0.21
393 0.22
394 0.24
395 0.21
396 0.17
397 0.19
398 0.19
399 0.19
400 0.19
401 0.17
402 0.13
403 0.11
404 0.11
405 0.09
406 0.07
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.09
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.14
433 0.18
434 0.21
435 0.23
436 0.26
437 0.26
438 0.28
439 0.31
440 0.27
441 0.24
442 0.21
443 0.19
444 0.19
445 0.19
446 0.18
447 0.14
448 0.14
449 0.14
450 0.13
451 0.12
452 0.08
453 0.07
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.08
460 0.07
461 0.09
462 0.11
463 0.13
464 0.13
465 0.16
466 0.23
467 0.3
468 0.36
469 0.42
470 0.42
471 0.46
472 0.53
473 0.58
474 0.59
475 0.58
476 0.61
477 0.55
478 0.55
479 0.53
480 0.45
481 0.41
482 0.38
483 0.35
484 0.29
485 0.34
486 0.35
487 0.36
488 0.39
489 0.35
490 0.34
491 0.33
492 0.33
493 0.3
494 0.32
495 0.31
496 0.3
497 0.33
498 0.33
499 0.33
500 0.32
501 0.31
502 0.25
503 0.24
504 0.26
505 0.27
506 0.26
507 0.26
508 0.27
509 0.31
510 0.37
511 0.41
512 0.44
513 0.5
514 0.52
515 0.55
516 0.55
517 0.57
518 0.58
519 0.61
520 0.62
521 0.6
522 0.63
523 0.63
524 0.63
525 0.57
526 0.52
527 0.46
528 0.4
529 0.38
530 0.34
531 0.36
532 0.4
533 0.46
534 0.48
535 0.49
536 0.49
537 0.46
538 0.45
539 0.46
540 0.45
541 0.46
542 0.47
543 0.44
544 0.43
545 0.4
546 0.38
547 0.3
548 0.24
549 0.17
550 0.13
551 0.12
552 0.11
553 0.11
554 0.12
555 0.14
556 0.16
557 0.18
558 0.26
559 0.32
560 0.4
561 0.45
562 0.54
563 0.62
564 0.7
565 0.79
566 0.8
567 0.84
568 0.86