Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3DVD5

Protein Details
Accession A0A2H3DVD5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-61KVSKVKAEDAKQKKGKRRVREEEEDHQGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-52KVKAEKAVKAEKVSKVKAEDAKQKKGKRRVR
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 7.5, cyto_nucl 6.5, cyto 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038729  Rad50/SbcC_AAA  
IPR027131  SMC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
Pfam View protein in Pfam  
PF13476  AAA_23  
Amino Acid Sequences MARQPAASSDNVNARDTRAAMKVKAEKAVKAEKVSKVKAEDAKQKKGKRRVREEEEDHQGRDENGEDDAEGDEDALDDDDDAPEHKHVATLPRDTDGFIPGSIVRIQLQNFVTYDWVEFRPGPYLNMIIGPNGTGKSSIACAICLGLGWSPQILGRASEINSFVKQGKTSGHIEIELKGPKGKPNLVIRRNLTSTSKTSTFTLNGVSAIGREISSQMASLNVQIGNLCTFLPQDKVSEFAAMSPQDLLKETQRAAGDQNLTAWHKTLIEAGADQKKINDLIKSEMDQLQQMRERNEAIERDVQRCLERQKIEQEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.29
4 0.29
5 0.28
6 0.3
7 0.3
8 0.37
9 0.43
10 0.43
11 0.49
12 0.48
13 0.44
14 0.46
15 0.54
16 0.5
17 0.48
18 0.52
19 0.52
20 0.58
21 0.59
22 0.57
23 0.52
24 0.55
25 0.56
26 0.57
27 0.59
28 0.59
29 0.66
30 0.69
31 0.74
32 0.77
33 0.8
34 0.81
35 0.82
36 0.85
37 0.85
38 0.85
39 0.87
40 0.85
41 0.82
42 0.83
43 0.76
44 0.65
45 0.55
46 0.47
47 0.37
48 0.31
49 0.24
50 0.15
51 0.12
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.09
57 0.07
58 0.06
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.04
64 0.04
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.06
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.1
75 0.17
76 0.2
77 0.23
78 0.24
79 0.25
80 0.25
81 0.25
82 0.25
83 0.2
84 0.16
85 0.12
86 0.12
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.11
93 0.12
94 0.16
95 0.17
96 0.16
97 0.16
98 0.16
99 0.16
100 0.13
101 0.14
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.14
108 0.14
109 0.14
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.14
114 0.13
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.13
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.14
156 0.16
157 0.17
158 0.16
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.19
163 0.17
164 0.16
165 0.16
166 0.16
167 0.19
168 0.22
169 0.23
170 0.25
171 0.34
172 0.43
173 0.46
174 0.51
175 0.5
176 0.52
177 0.51
178 0.47
179 0.4
180 0.34
181 0.32
182 0.3
183 0.29
184 0.26
185 0.25
186 0.25
187 0.23
188 0.2
189 0.19
190 0.15
191 0.13
192 0.12
193 0.11
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.08
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.12
222 0.14
223 0.15
224 0.15
225 0.14
226 0.12
227 0.16
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.12
233 0.13
234 0.15
235 0.15
236 0.18
237 0.18
238 0.22
239 0.22
240 0.23
241 0.24
242 0.27
243 0.25
244 0.22
245 0.23
246 0.23
247 0.24
248 0.23
249 0.22
250 0.18
251 0.16
252 0.16
253 0.17
254 0.14
255 0.13
256 0.14
257 0.2
258 0.25
259 0.25
260 0.25
261 0.23
262 0.25
263 0.27
264 0.29
265 0.25
266 0.21
267 0.25
268 0.29
269 0.31
270 0.32
271 0.33
272 0.31
273 0.32
274 0.31
275 0.33
276 0.34
277 0.36
278 0.34
279 0.33
280 0.34
281 0.32
282 0.37
283 0.32
284 0.32
285 0.37
286 0.38
287 0.38
288 0.4
289 0.39
290 0.36
291 0.4
292 0.42
293 0.42
294 0.43
295 0.46