FuNGI

B6K6S9

Protein Details

Accession

B6K6S9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-55	MSSPTDSRKVKKRKLSIETCEKQD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito_nucl 11.333, cyto_nucl 10.333, mito 5.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010347 Tdp1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0106334 F:3'-deoxyribose phosphate lyase activity GO:0017005 F:3'-tyrosyl-DNA phosphodiesterase activity GO:0003690 F:double-stranded DNA binding GO:0003697 F:single-stranded DNA binding GO:0006284 P:base-excision repair GO:0006281 P:DNA repair
Pfam	View protein in Pfam PF06087 Tyr-DNA_phospho

Amino Acid Sequences

MRRRAGPSASHARPRAETLIRHLNVEQTTRDMSSPTDSRKVKKRKLSIETCEKQDSPIFLNSIKSLPDEENVHCLSLRQLIGSKNLRETWQFNFCIDLGFIVENMHPSVLKQVKVHVTHGYSYDSPRMDVLRQQKTRLPMDIELHSVYVPQWGTHHSKIMVNFFADDSCQVVIHTANMIQMDWEGMSQAIYKTPLLWRKTVEREGPPSVGDRFQKDFCSYLSHYKHCAKLICKLQRYDFTSVKAIFISSVPGKFGGDKLDSWGHNRLEKELAAIESMAEFMGPRNKFQDSDICVSQCSSMGSFGARQAFLKEHTKALHCDLTHWKLIFPTVTDVRDSLLGWHSGSSIHFNVTARGAPAQVEELVRHNQLCKWKAMKSGRQRIAPHVKTYMRLNDEGTLIRWVLLTSANLSKPAWGTLEGVAANSKTEHGLRIRSYEAGVLLHPGLFADDSNSACAFFPVYKSNSLKSPNFDFPLSVAIRMPWDFPPQPYGDKDDIWSPSIPRNETDWLGSKWPPTDYS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.55
3	0.51
4	0.47
5	0.46
6	0.53
7	0.49
8	0.5
9	0.45
10	0.43
11	0.4
12	0.41
13	0.34
14	0.27
15	0.29
16	0.28
17	0.27
18	0.22
19	0.21
20	0.25
21	0.29
22	0.31
23	0.38
24	0.41
25	0.48
26	0.58
27	0.67
28	0.7
29	0.74
30	0.78
31	0.79
32	0.85
33	0.88
34	0.87
35	0.88
36	0.84
37	0.8
38	0.76
39	0.65
40	0.58
41	0.52
42	0.45
43	0.38
44	0.36
45	0.32
46	0.27
47	0.29
48	0.28
49	0.26
50	0.23
51	0.2
52	0.19
53	0.19
54	0.21
55	0.23
56	0.23
57	0.27
58	0.27
59	0.26
60	0.23
61	0.22
62	0.2
63	0.22
64	0.21
65	0.16
66	0.19
67	0.21
68	0.29
69	0.35
70	0.36
71	0.35
72	0.37
73	0.38
74	0.38
75	0.39
76	0.37
77	0.38
78	0.37
79	0.32
80	0.32
81	0.3
82	0.27
83	0.24
84	0.18
85	0.12
86	0.11
87	0.11
88	0.09
89	0.1
90	0.09
91	0.1
92	0.1
93	0.08
94	0.08
95	0.17
96	0.2
97	0.22
98	0.22
99	0.27
100	0.34
101	0.37
102	0.39
103	0.36
104	0.34
105	0.33
106	0.34
107	0.32
108	0.26
109	0.26
110	0.29
111	0.24
112	0.22
113	0.22
114	0.22
115	0.2
116	0.24
117	0.31
118	0.36
119	0.39
120	0.41
121	0.44
122	0.48
123	0.5
124	0.48
125	0.42
126	0.36
127	0.38
128	0.36
129	0.35
130	0.29
131	0.26
132	0.22
133	0.18
134	0.14
135	0.14
136	0.12
137	0.09
138	0.1
139	0.14
140	0.2
141	0.21
142	0.25
143	0.23
144	0.25
145	0.28
146	0.3
147	0.28
148	0.22
149	0.21
150	0.18
151	0.17
152	0.14
153	0.12
154	0.09
155	0.08
156	0.07
157	0.06
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.08
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.06
169	0.06
170	0.05
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.05
175	0.05
176	0.06
177	0.07
178	0.07
179	0.09
180	0.14
181	0.21
182	0.22
183	0.24
184	0.26
185	0.31
186	0.38
187	0.42
188	0.42
189	0.4
190	0.43
191	0.44
192	0.42
193	0.36
194	0.31
195	0.27
196	0.26
197	0.23
198	0.22
199	0.22
200	0.23
201	0.25
202	0.24
203	0.23
204	0.19
205	0.24
206	0.22
207	0.28
208	0.31
209	0.31
210	0.35
211	0.38
212	0.41
213	0.38
214	0.4
215	0.33
216	0.36
217	0.43
218	0.46
219	0.47
220	0.46
221	0.46
222	0.48
223	0.51
224	0.49
225	0.41
226	0.35
227	0.35
228	0.33
229	0.3
230	0.24
231	0.19
232	0.14
233	0.12
234	0.12
235	0.09
236	0.09
237	0.09
238	0.09
239	0.09
240	0.09
241	0.1
242	0.1
243	0.1
244	0.1
245	0.12
246	0.16
247	0.16
248	0.19
249	0.24
250	0.22
251	0.24
252	0.24
253	0.23
254	0.21
255	0.2
256	0.19
257	0.14
258	0.13
259	0.1
260	0.09
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.04
265	0.03
266	0.03
267	0.04
268	0.11
269	0.11
270	0.12
271	0.14
272	0.15
273	0.16
274	0.18
275	0.24
276	0.22
277	0.25
278	0.26
279	0.24
280	0.23
281	0.23
282	0.22
283	0.16
284	0.12
285	0.08
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.08
290	0.1
291	0.11
292	0.1
293	0.1
294	0.11
295	0.13
296	0.15
297	0.2
298	0.19
299	0.2
300	0.22
301	0.24
302	0.24
303	0.27
304	0.28
305	0.22
306	0.25
307	0.3
308	0.31
309	0.32
310	0.31
311	0.27
312	0.23
313	0.25
314	0.21
315	0.15
316	0.17
317	0.16
318	0.17
319	0.17
320	0.16
321	0.16
322	0.16
323	0.15
324	0.12
325	0.11
326	0.11
327	0.1
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.11
332	0.12
333	0.11
334	0.11
335	0.13
336	0.13
337	0.14
338	0.15
339	0.15
340	0.12
341	0.12
342	0.11
343	0.1
344	0.1
345	0.1
346	0.1
347	0.1
348	0.1
349	0.13
350	0.15
351	0.16
352	0.16
353	0.16
354	0.18
355	0.26
356	0.28
357	0.3
358	0.32
359	0.34
360	0.43
361	0.5
362	0.56
363	0.59
364	0.68
365	0.68
366	0.71
367	0.7
368	0.7
369	0.73
370	0.67
371	0.6
372	0.56
373	0.51
374	0.47
375	0.5
376	0.47
377	0.4
378	0.38
379	0.36
380	0.31
381	0.31
382	0.29
383	0.25
384	0.2
385	0.16
386	0.14
387	0.13
388	0.11
389	0.1
390	0.1
391	0.09
392	0.11
393	0.15
394	0.15
395	0.17
396	0.17
397	0.18
398	0.17
399	0.18
400	0.16
401	0.13
402	0.15
403	0.14
404	0.17
405	0.15
406	0.15
407	0.15
408	0.13
409	0.13
410	0.11
411	0.11
412	0.1
413	0.1
414	0.14
415	0.16
416	0.22
417	0.24
418	0.27
419	0.28
420	0.27
421	0.27
422	0.24
423	0.22
424	0.17
425	0.16
426	0.14
427	0.13
428	0.12
429	0.11
430	0.09
431	0.09
432	0.08
433	0.08
434	0.08
435	0.1
436	0.11
437	0.13
438	0.13
439	0.13
440	0.13
441	0.13
442	0.12
443	0.11
444	0.14
445	0.18
446	0.2
447	0.27
448	0.3
449	0.33
450	0.38
451	0.44
452	0.45
453	0.44
454	0.49
455	0.48
456	0.49
457	0.47
458	0.41
459	0.35
460	0.39
461	0.34
462	0.28
463	0.21
464	0.19
465	0.22
466	0.22
467	0.23
468	0.19
469	0.26
470	0.27
471	0.28
472	0.33
473	0.33
474	0.37
475	0.37
476	0.41
477	0.36
478	0.35
479	0.35
480	0.36
481	0.35
482	0.33
483	0.33
484	0.28
485	0.32
486	0.38
487	0.37
488	0.33
489	0.35
490	0.37
491	0.37
492	0.4
493	0.39
494	0.35
495	0.38
496	0.39
497	0.38
498	0.36

B6K6S9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer