FuNGI

B6JXQ9

Protein Details

Accession

B6JXQ9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
875-896	SQVVTGKFGGRPKKKKKARSGF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
883-895	GGRPKKKKKARSG

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 9, cyto 5.5, mito 4, extr 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019350 RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like
Gene Ontology	GO:0070860 C:RNA polymerase I core factor complex GO:0001179 F:RNA polymerase I general transcription initiation factor binding GO:0001163 F:RNA polymerase I transcription regulatory region sequence-specific DNA binding GO:0042790 P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF10214 Rrn6

Amino Acid Sequences

MSSWPLDAVEHTPYVSLDFGVLGSCALVDSETGKPTRSPGHYEWQFTKTDNDNQKKLIQTPYNWEVVSNFFDKKAVDYVDVYSSASSVAYRSLSYLRSAEKSVYVPEDLLLPSLKESFVLDHVFPTFTPDVTSLMTVGAVSNMRKNPSLSQDQCLAVAGGQQRTSLFLALAIPWKFHVSPLDPNATNEIDPSAGVFHKGPQMLHVPAFQMNPFPAHQFLQPIEQLQFGSHSSSWLYVRTASEIVLFHVRYDEKVKAETSYRLVTDVVYSVRASELCGHTTFVDFCIHPDDENLVVAITRTGEWFVWKYEGGTYNVLHRGKFHQQLDRAKKNIFPEAVQQTEKKQEKNPFYRIRWSYKRDAIVIIDASHILRVSLRAKKPKILLSADHILQVSTYDAWANRSHVFVLTSEEVLWMDESKGVLLAWKHNRMCDPTLQLQVSVANPDQNTENYNVFVFSKLNGIVQVFTFEMQRGLPVSPLSPYALYSKGLANSLVHLLVLPCVFWDAATKERSIAPWFVAIRFNTTGYLGLTLFGSGTAVDNYNIRPLNSSSRSLLTMDYGDEDSDSSENENWRAFMTANGKNAMRMHNFYMAIFGCFNENRPNGGEFLTSAYESIRLAYEQSNKGITLLYDCFPNILLSDWQPCKLSVLEGLRSIASGLGTLYELNVTERSVATNESMDVDMDQGTFFSSQTIGTQIEQQQPLPTSVLGIPYLISSWTEDSGSISAVLRCLRAAALSDTEFVLLCSSLGLSAEAVRVPDTSVEREEMANVLAPLQPFVAHTLDVSSLHPDTEEILGAWKLGDPTRLDLLSLPEESTSLPPASQEFEPVLPSLSQPLPRRRIPTLSQTTGPPPVSQFSQPSSLSASMPASQPTIVMSQVVTGKFGGRPKKKKKARSGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.15
3	0.12
4	0.09
5	0.08
6	0.08
7	0.08
8	0.08
9	0.06
10	0.05
11	0.05
12	0.05
13	0.05
14	0.05
15	0.05
16	0.08
17	0.11
18	0.15
19	0.16
20	0.18
21	0.19
22	0.23
23	0.31
24	0.32
25	0.37
26	0.38
27	0.48
28	0.52
29	0.58
30	0.59
31	0.54
32	0.52
33	0.45
34	0.47
35	0.42
36	0.46
37	0.51
38	0.54
39	0.54
40	0.56
41	0.6
42	0.59
43	0.57
44	0.57
45	0.53
46	0.49
47	0.53
48	0.54
49	0.53
50	0.48
51	0.44
52	0.35
53	0.32
54	0.32
55	0.27
56	0.24
57	0.2
58	0.22
59	0.21
60	0.23
61	0.24
62	0.22
63	0.21
64	0.21
65	0.23
66	0.24
67	0.24
68	0.22
69	0.17
70	0.15
71	0.13
72	0.11
73	0.09
74	0.07
75	0.08
76	0.09
77	0.09
78	0.11
79	0.14
80	0.15
81	0.18
82	0.21
83	0.23
84	0.25
85	0.26
86	0.26
87	0.26
88	0.26
89	0.27
90	0.26
91	0.23
92	0.2
93	0.19
94	0.2
95	0.17
96	0.17
97	0.14
98	0.11
99	0.12
100	0.13
101	0.12
102	0.1
103	0.11
104	0.11
105	0.14
106	0.17
107	0.15
108	0.16
109	0.18
110	0.18
111	0.17
112	0.21
113	0.19
114	0.16
115	0.17
116	0.16
117	0.17
118	0.17
119	0.18
120	0.11
121	0.11
122	0.1
123	0.09
124	0.08
125	0.08
126	0.09
127	0.1
128	0.16
129	0.19
130	0.21
131	0.23
132	0.26
133	0.29
134	0.34
135	0.43
136	0.4
137	0.41
138	0.43
139	0.41
140	0.39
141	0.35
142	0.28
143	0.18
144	0.19
145	0.19
146	0.17
147	0.17
148	0.17
149	0.16
150	0.19
151	0.19
152	0.16
153	0.12
154	0.1
155	0.11
156	0.11
157	0.18
158	0.15
159	0.15
160	0.15
161	0.18
162	0.18
163	0.18
164	0.22
165	0.19
166	0.27
167	0.31
168	0.37
169	0.35
170	0.36
171	0.38
172	0.34
173	0.3
174	0.23
175	0.19
176	0.13
177	0.12
178	0.11
179	0.09
180	0.08
181	0.1
182	0.1
183	0.11
184	0.16
185	0.18
186	0.17
187	0.18
188	0.22
189	0.23
190	0.24
191	0.23
192	0.2
193	0.21
194	0.22
195	0.19
196	0.17
197	0.15
198	0.16
199	0.16
200	0.16
201	0.16
202	0.16
203	0.17
204	0.18
205	0.18
206	0.2
207	0.2
208	0.2
209	0.19
210	0.18
211	0.17
212	0.15
213	0.15
214	0.12
215	0.14
216	0.12
217	0.12
218	0.12
219	0.14
220	0.14
221	0.14
222	0.15
223	0.13
224	0.14
225	0.16
226	0.16
227	0.14
228	0.15
229	0.14
230	0.15
231	0.17
232	0.17
233	0.14
234	0.17
235	0.17
236	0.17
237	0.2
238	0.22
239	0.19
240	0.21
241	0.21
242	0.21
243	0.23
244	0.24
245	0.24
246	0.23
247	0.22
248	0.21
249	0.2
250	0.18
251	0.16
252	0.15
253	0.12
254	0.1
255	0.1
256	0.09
257	0.1
258	0.1
259	0.1
260	0.13
261	0.14
262	0.15
263	0.15
264	0.16
265	0.16
266	0.17
267	0.16
268	0.13
269	0.14
270	0.11
271	0.12
272	0.15
273	0.15
274	0.14
275	0.14
276	0.15
277	0.13
278	0.13
279	0.12
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.06
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.06
288	0.06
289	0.09
290	0.1
291	0.11
292	0.12
293	0.12
294	0.12
295	0.15
296	0.18
297	0.18
298	0.19
299	0.18
300	0.2
301	0.27
302	0.27
303	0.23
304	0.22
305	0.25
306	0.3
307	0.37
308	0.37
309	0.37
310	0.43
311	0.54
312	0.62
313	0.64
314	0.59
315	0.53
316	0.53
317	0.49
318	0.48
319	0.39
320	0.3
321	0.3
322	0.32
323	0.34
324	0.32
325	0.3
326	0.27
327	0.36
328	0.38
329	0.34
330	0.36
331	0.41
332	0.49
333	0.56
334	0.63
335	0.62
336	0.62
337	0.68
338	0.67
339	0.68
340	0.66
341	0.65
342	0.62
343	0.59
344	0.58
345	0.5
346	0.46
347	0.38
348	0.31
349	0.26
350	0.19
351	0.14
352	0.11
353	0.1
354	0.09
355	0.08
356	0.05
357	0.05
358	0.07
359	0.12
360	0.19
361	0.25
362	0.33
363	0.35
364	0.4
365	0.43
366	0.46
367	0.47
368	0.42
369	0.39
370	0.36
371	0.38
372	0.34
373	0.31
374	0.26
375	0.2
376	0.16
377	0.15
378	0.1
379	0.06
380	0.06
381	0.05
382	0.05
383	0.08
384	0.09
385	0.11
386	0.11
387	0.12
388	0.12
389	0.12
390	0.12
391	0.1
392	0.13
393	0.12
394	0.11
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.09
399	0.09
400	0.06
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.06
408	0.07
409	0.13
410	0.18
411	0.24
412	0.25
413	0.26
414	0.28
415	0.3
416	0.31
417	0.27
418	0.27
419	0.24
420	0.28
421	0.27
422	0.25
423	0.22
424	0.21
425	0.18
426	0.15
427	0.11
428	0.09
429	0.09
430	0.1
431	0.11
432	0.1
433	0.11
434	0.12
435	0.12
436	0.1
437	0.1
438	0.1
439	0.1
440	0.1
441	0.09
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.08
448	0.08
449	0.07
450	0.08
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.06
455	0.07
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.07
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.08
465	0.08
466	0.07
467	0.08
468	0.1
469	0.1
470	0.11
471	0.11
472	0.12
473	0.12
474	0.12
475	0.12
476	0.1
477	0.09
478	0.1
479	0.09
480	0.07
481	0.06
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.05
486	0.04
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.07
491	0.07
492	0.12
493	0.13
494	0.14
495	0.14
496	0.15
497	0.16
498	0.17
499	0.16
500	0.12
501	0.15
502	0.15
503	0.16
504	0.19
505	0.17
506	0.19
507	0.19
508	0.19
509	0.15
510	0.15
511	0.14
512	0.11
513	0.12
514	0.08
515	0.07
516	0.07
517	0.06
518	0.06
519	0.05
520	0.05
521	0.03
522	0.04
523	0.04
524	0.05
525	0.06
526	0.06
527	0.07
528	0.12
529	0.12
530	0.12
531	0.13
532	0.14
533	0.22
534	0.25
535	0.26
536	0.24
537	0.24
538	0.26
539	0.24
540	0.23
541	0.15
542	0.13
543	0.11
544	0.11
545	0.1
546	0.09
547	0.08
548	0.08
549	0.07
550	0.07
551	0.07
552	0.06
553	0.08
554	0.09
555	0.11
556	0.11
557	0.1
558	0.11
559	0.11
560	0.1
561	0.13
562	0.18
563	0.21
564	0.23
565	0.25
566	0.24
567	0.25
568	0.27
569	0.28
570	0.24
571	0.23
572	0.23
573	0.26
574	0.26
575	0.24
576	0.25
577	0.21
578	0.19
579	0.16
580	0.14
581	0.12
582	0.12
583	0.13
584	0.17
585	0.18
586	0.18
587	0.2
588	0.21
589	0.19
590	0.2
591	0.18
592	0.12
593	0.14
594	0.13
595	0.11
596	0.1
597	0.09
598	0.09
599	0.09
600	0.09
601	0.07
602	0.06
603	0.08
604	0.12
605	0.18
606	0.2
607	0.21
608	0.22
609	0.21
610	0.21
611	0.2
612	0.16
613	0.13
614	0.14
615	0.12
616	0.12
617	0.12
618	0.12
619	0.12
620	0.12
621	0.09
622	0.08
623	0.09
624	0.1
625	0.18
626	0.19
627	0.2
628	0.2
629	0.2
630	0.2
631	0.19
632	0.18
633	0.17
634	0.2
635	0.21
636	0.21
637	0.21
638	0.19
639	0.19
640	0.18
641	0.13
642	0.08
643	0.06
644	0.05
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.05
651	0.06
652	0.07
653	0.07
654	0.08
655	0.08
656	0.09
657	0.1
658	0.1
659	0.1
660	0.1
661	0.1
662	0.11
663	0.11
664	0.1
665	0.09
666	0.09
667	0.08
668	0.08
669	0.07
670	0.05
671	0.06
672	0.07
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.07
678	0.1
679	0.1
680	0.1
681	0.16
682	0.2
683	0.26
684	0.27
685	0.27
686	0.28
687	0.29
688	0.29
689	0.25
690	0.2
691	0.15
692	0.15
693	0.16
694	0.13
695	0.12
696	0.1
697	0.09
698	0.1
699	0.08
700	0.08
701	0.07
702	0.09
703	0.1
704	0.1
705	0.1
706	0.11
707	0.11
708	0.11
709	0.11
710	0.1
711	0.1
712	0.12
713	0.13
714	0.11
715	0.11
716	0.11
717	0.1
718	0.09
719	0.11
720	0.12
721	0.14
722	0.15
723	0.16
724	0.15
725	0.15
726	0.15
727	0.12
728	0.11
729	0.07
730	0.06
731	0.05
732	0.05
733	0.05
734	0.06
735	0.06
736	0.05
737	0.06
738	0.07
739	0.08
740	0.08
741	0.09
742	0.09
743	0.09
744	0.12
745	0.14
746	0.16
747	0.18
748	0.19
749	0.19
750	0.19
751	0.19
752	0.16
753	0.15
754	0.13
755	0.11
756	0.11
757	0.11
758	0.11
759	0.11
760	0.1
761	0.1
762	0.09
763	0.12
764	0.12
765	0.1
766	0.1
767	0.11
768	0.12
769	0.13
770	0.14
771	0.14
772	0.13
773	0.13
774	0.13
775	0.12
776	0.12
777	0.12
778	0.12
779	0.08
780	0.11
781	0.11
782	0.11
783	0.11
784	0.1
785	0.11
786	0.12
787	0.16
788	0.15
789	0.19
790	0.24
791	0.24
792	0.23
793	0.22
794	0.25
795	0.25
796	0.24
797	0.2
798	0.16
799	0.16
800	0.17
801	0.18
802	0.16
803	0.13
804	0.13
805	0.13
806	0.15
807	0.18
808	0.17
809	0.18
810	0.17
811	0.17
812	0.18
813	0.18
814	0.19
815	0.15
816	0.15
817	0.18
818	0.19
819	0.26
820	0.33
821	0.42
822	0.47
823	0.52
824	0.58
825	0.58
826	0.62
827	0.6
828	0.63
829	0.63
830	0.61
831	0.58
832	0.56
833	0.55
834	0.54
835	0.5
836	0.41
837	0.33
838	0.32
839	0.33
840	0.33
841	0.33
842	0.29
843	0.35
844	0.33
845	0.32
846	0.34
847	0.32
848	0.28
849	0.27
850	0.26
851	0.21
852	0.23
853	0.23
854	0.19
855	0.18
856	0.17
857	0.17
858	0.16
859	0.14
860	0.13
861	0.11
862	0.13
863	0.18
864	0.18
865	0.17
866	0.16
867	0.18
868	0.22
869	0.29
870	0.36
871	0.42
872	0.53
873	0.62
874	0.73
875	0.81
876	0.87

B6JXQ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer