Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JWH8

Protein Details
Accession B6JWH8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
358-387MNEKMYLLKPKERRRARPKGKETTASNRGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
366-387KPKERRRARPKGKETTASNRGK
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12, nucl 10.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0000214  C:tRNA-intron endonuclease complex  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0090502  P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic  
GO:0000379  P:tRNA-type intron splice site recognition and cleavage  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MNKQDGENPFSNFEDDVDPSDEVQDWRFLSSLKGDDVNFTIPKRGLKDFEPDGTQKQVTVLQNSQNAMFDALAVERLIPAKTVIQAVWRPQQQKAEVLHAHGPMFKTMGHATSNNSVWLLPEETVYLVERGSMECWCEEGIPMSLQHVYAEAIAACGGLEYYHVYAHLRRCGFTVVRSKQPSPEDVEAYQLKKQMYGRSLRTLMLDLKSKLLNFSFVAFQRLWFSPSSMKKSMLPDRTYRSYEQIYEQIQFVAGYTPQPKAPVLPDLPFRNAFDVYKPSASFKKSAPGEPDFTVCVVNAHTTCVPTLQHLDALFRSVPLKESTSNNPMQRIKEGRRQIIIAIDDGGVISYMKFGDVFMNEKMYLLKPKERRRARPKGKETTASNRGKALAGTDEKKQVSSKPAAKPTSVGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.21
3 0.22
4 0.22
5 0.21
6 0.2
7 0.21
8 0.21
9 0.19
10 0.19
11 0.19
12 0.17
13 0.17
14 0.18
15 0.17
16 0.17
17 0.21
18 0.22
19 0.2
20 0.23
21 0.22
22 0.24
23 0.26
24 0.29
25 0.27
26 0.25
27 0.27
28 0.26
29 0.3
30 0.33
31 0.35
32 0.33
33 0.33
34 0.4
35 0.39
36 0.41
37 0.42
38 0.41
39 0.39
40 0.41
41 0.38
42 0.31
43 0.28
44 0.31
45 0.29
46 0.32
47 0.33
48 0.33
49 0.37
50 0.38
51 0.37
52 0.31
53 0.28
54 0.23
55 0.19
56 0.13
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.1
68 0.11
69 0.13
70 0.13
71 0.17
72 0.2
73 0.25
74 0.32
75 0.36
76 0.37
77 0.39
78 0.46
79 0.42
80 0.46
81 0.43
82 0.44
83 0.39
84 0.4
85 0.41
86 0.35
87 0.34
88 0.29
89 0.27
90 0.19
91 0.19
92 0.16
93 0.14
94 0.14
95 0.15
96 0.15
97 0.15
98 0.18
99 0.22
100 0.22
101 0.2
102 0.19
103 0.17
104 0.15
105 0.16
106 0.14
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.11
113 0.09
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.06
137 0.07
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.02
146 0.03
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.1
153 0.14
154 0.19
155 0.19
156 0.19
157 0.2
158 0.24
159 0.23
160 0.25
161 0.32
162 0.3
163 0.37
164 0.41
165 0.41
166 0.43
167 0.44
168 0.4
169 0.36
170 0.35
171 0.29
172 0.26
173 0.29
174 0.26
175 0.26
176 0.26
177 0.23
178 0.2
179 0.21
180 0.23
181 0.23
182 0.25
183 0.29
184 0.3
185 0.32
186 0.33
187 0.31
188 0.29
189 0.26
190 0.24
191 0.21
192 0.21
193 0.17
194 0.17
195 0.17
196 0.17
197 0.16
198 0.14
199 0.14
200 0.11
201 0.11
202 0.13
203 0.12
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.16
208 0.16
209 0.16
210 0.13
211 0.14
212 0.19
213 0.24
214 0.3
215 0.29
216 0.3
217 0.31
218 0.38
219 0.44
220 0.45
221 0.43
222 0.41
223 0.45
224 0.48
225 0.48
226 0.43
227 0.39
228 0.34
229 0.32
230 0.3
231 0.29
232 0.25
233 0.23
234 0.22
235 0.18
236 0.16
237 0.14
238 0.12
239 0.08
240 0.07
241 0.08
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.13
246 0.12
247 0.13
248 0.14
249 0.18
250 0.18
251 0.2
252 0.25
253 0.27
254 0.3
255 0.3
256 0.29
257 0.26
258 0.25
259 0.23
260 0.2
261 0.22
262 0.21
263 0.22
264 0.22
265 0.23
266 0.26
267 0.28
268 0.28
269 0.24
270 0.31
271 0.3
272 0.34
273 0.37
274 0.36
275 0.37
276 0.36
277 0.36
278 0.28
279 0.26
280 0.22
281 0.16
282 0.13
283 0.1
284 0.12
285 0.1
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.14
291 0.14
292 0.13
293 0.16
294 0.14
295 0.16
296 0.16
297 0.18
298 0.16
299 0.19
300 0.17
301 0.14
302 0.15
303 0.13
304 0.15
305 0.15
306 0.18
307 0.18
308 0.22
309 0.28
310 0.33
311 0.4
312 0.4
313 0.45
314 0.46
315 0.46
316 0.49
317 0.51
318 0.51
319 0.54
320 0.6
321 0.58
322 0.57
323 0.55
324 0.49
325 0.46
326 0.4
327 0.32
328 0.25
329 0.19
330 0.16
331 0.15
332 0.13
333 0.08
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.09
342 0.11
343 0.14
344 0.14
345 0.18
346 0.18
347 0.18
348 0.2
349 0.2
350 0.27
351 0.28
352 0.36
353 0.42
354 0.53
355 0.63
356 0.71
357 0.79
358 0.82
359 0.89
360 0.91
361 0.93
362 0.93
363 0.93
364 0.91
365 0.88
366 0.85
367 0.83
368 0.83
369 0.78
370 0.7
371 0.62
372 0.55
373 0.48
374 0.41
375 0.33
376 0.31
377 0.31
378 0.32
379 0.34
380 0.4
381 0.4
382 0.41
383 0.41
384 0.38
385 0.38
386 0.46
387 0.49
388 0.51
389 0.6
390 0.62
391 0.61