FuNGI

B6JVX3

Protein Details

Accession

B6JVX3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-38	LDFSTVKEKREKKQPESRKDAEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045161 Utp18 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0034388 C:Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000292 P:RNA fragment catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MAKKTRTSSKGGDKFLDFSTVKEKREKKQPESRKDAEELRLEEAIFGNLDEFKENLGAEDEEVQIDEGGKVSEQEENGDVALLDDSELFMMDVGEPSKIDSEDAATRDVDMLSNASEDEDFEEEQEEAVWHDSDDERVEVSLLDNARLRKLRRYEDENMLNGVQYSARLRVQFERIYPKPKWALKKTDDDGENSDEEVSLSEASVLPSSLREILQSSVSYAAKKTSVLQPGQIDIKRLKDANFQSPSHSGIRCMSLHPIYPLLLTCGFDRTLRIYQLDGRTNPLLTSMHLRSSDLQTAAFHPDGKHVIAGGRRRYFYIWDLETSKVQKVSRIYGHQDLQPSMERFHLDPSGKFMALEGKNGYVNMLDALTGQFVTNFKIEGTISDVLFDSNGANLFVLSYEAEVWQFDIKAKTIVRRWHVQDAVATTRFSLDSKNRYMAIGSKSGIVNVYELARNDAPKAIATLDNITFSINSLAFSTDGQVLLAASRGKKDTLRLYHVPSFTTFRNWPTSVTPLGRVTAVIFGKGGELCVGNEAGRVGFWKLAHYL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.51
3	0.5
4	0.39
5	0.33
6	0.38
7	0.39
8	0.4
9	0.46
10	0.53
11	0.53
12	0.63
13	0.71
14	0.71
15	0.76
16	0.83
17	0.84
18	0.87
19	0.84
20	0.8
21	0.76
22	0.72
23	0.68
24	0.64
25	0.56
26	0.5
27	0.46
28	0.39
29	0.34
30	0.28
31	0.23
32	0.16
33	0.13
34	0.1
35	0.1
36	0.11
37	0.11
38	0.1
39	0.1
40	0.12
41	0.12
42	0.11
43	0.12
44	0.12
45	0.12
46	0.14
47	0.14
48	0.12
49	0.13
50	0.12
51	0.1
52	0.1
53	0.09
54	0.07
55	0.07
56	0.07
57	0.07
58	0.08
59	0.11
60	0.11
61	0.13
62	0.13
63	0.13
64	0.13
65	0.13
66	0.12
67	0.09
68	0.09
69	0.07
70	0.06
71	0.05
72	0.05
73	0.05
74	0.05
75	0.04
76	0.04
77	0.04
78	0.05
79	0.06
80	0.07
81	0.07
82	0.07
83	0.08
84	0.1
85	0.1
86	0.1
87	0.09
88	0.12
89	0.16
90	0.17
91	0.18
92	0.16
93	0.16
94	0.17
95	0.16
96	0.13
97	0.09
98	0.09
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.07
103	0.07
104	0.07
105	0.09
106	0.1
107	0.09
108	0.09
109	0.1
110	0.1
111	0.1
112	0.1
113	0.08
114	0.07
115	0.08
116	0.08
117	0.07
118	0.09
119	0.09
120	0.1
121	0.11
122	0.11
123	0.09
124	0.09
125	0.1
126	0.08
127	0.09
128	0.11
129	0.1
130	0.11
131	0.14
132	0.15
133	0.2
134	0.25
135	0.26
136	0.31
137	0.38
138	0.45
139	0.49
140	0.56
141	0.57
142	0.61
143	0.65
144	0.58
145	0.52
146	0.44
147	0.37
148	0.29
149	0.23
150	0.14
151	0.1
152	0.1
153	0.1
154	0.12
155	0.13
156	0.16
157	0.2
158	0.25
159	0.27
160	0.29
161	0.35
162	0.37
163	0.43
164	0.41
165	0.43
166	0.46
167	0.49
168	0.55
169	0.53
170	0.59
171	0.58
172	0.66
173	0.62
174	0.61
175	0.57
176	0.5
177	0.46
178	0.39
179	0.34
180	0.25
181	0.22
182	0.15
183	0.13
184	0.11
185	0.09
186	0.06
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.05
194	0.05
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.08
200	0.09
201	0.11
202	0.11
203	0.1
204	0.13
205	0.13
206	0.13
207	0.12
208	0.13
209	0.12
210	0.12
211	0.14
212	0.16
213	0.22
214	0.22
215	0.24
216	0.24
217	0.25
218	0.3
219	0.28
220	0.25
221	0.21
222	0.23
223	0.22
224	0.23
225	0.22
226	0.24
227	0.27
228	0.33
229	0.37
230	0.34
231	0.35
232	0.35
233	0.37
234	0.33
235	0.29
236	0.22
237	0.18
238	0.21
239	0.18
240	0.18
241	0.18
242	0.15
243	0.16
244	0.15
245	0.15
246	0.12
247	0.11
248	0.11
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.09
254	0.1
255	0.1
256	0.1
257	0.12
258	0.14
259	0.14
260	0.15
261	0.14
262	0.18
263	0.22
264	0.26
265	0.22
266	0.23
267	0.23
268	0.22
269	0.21
270	0.18
271	0.14
272	0.1
273	0.15
274	0.13
275	0.15
276	0.15
277	0.16
278	0.16
279	0.19
280	0.21
281	0.16
282	0.15
283	0.13
284	0.14
285	0.17
286	0.15
287	0.14
288	0.11
289	0.13
290	0.14
291	0.14
292	0.12
293	0.1
294	0.12
295	0.15
296	0.2
297	0.25
298	0.27
299	0.27
300	0.28
301	0.29
302	0.29
303	0.27
304	0.28
305	0.22
306	0.21
307	0.23
308	0.23
309	0.25
310	0.24
311	0.23
312	0.21
313	0.2
314	0.22
315	0.21
316	0.25
317	0.28
318	0.3
319	0.33
320	0.34
321	0.36
322	0.35
323	0.35
324	0.3
325	0.28
326	0.28
327	0.25
328	0.21
329	0.2
330	0.19
331	0.17
332	0.2
333	0.23
334	0.19
335	0.18
336	0.23
337	0.24
338	0.23
339	0.22
340	0.2
341	0.23
342	0.22
343	0.24
344	0.19
345	0.18
346	0.18
347	0.18
348	0.18
349	0.09
350	0.09
351	0.07
352	0.06
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.06
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.13
369	0.14
370	0.13
371	0.14
372	0.14
373	0.12
374	0.12
375	0.12
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.07
392	0.07
393	0.08
394	0.1
395	0.11
396	0.12
397	0.16
398	0.18
399	0.24
400	0.29
401	0.36
402	0.38
403	0.45
404	0.49
405	0.53
406	0.52
407	0.47
408	0.44
409	0.42
410	0.43
411	0.37
412	0.32
413	0.23
414	0.23
415	0.22
416	0.19
417	0.21
418	0.22
419	0.27
420	0.32
421	0.35
422	0.34
423	0.34
424	0.35
425	0.35
426	0.32
427	0.29
428	0.25
429	0.25
430	0.24
431	0.24
432	0.24
433	0.18
434	0.15
435	0.12
436	0.14
437	0.13
438	0.13
439	0.18
440	0.18
441	0.19
442	0.19
443	0.21
444	0.19
445	0.17
446	0.18
447	0.16
448	0.16
449	0.17
450	0.2
451	0.18
452	0.19
453	0.18
454	0.17
455	0.15
456	0.14
457	0.15
458	0.11
459	0.11
460	0.1
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.13
465	0.11
466	0.11
467	0.1
468	0.1
469	0.09
470	0.09
471	0.11
472	0.12
473	0.12
474	0.15
475	0.17
476	0.19
477	0.21
478	0.28
479	0.35
480	0.39
481	0.47
482	0.49
483	0.54
484	0.59
485	0.58
486	0.54
487	0.47
488	0.44
489	0.37
490	0.39
491	0.35
492	0.32
493	0.38
494	0.37
495	0.37
496	0.37
497	0.4
498	0.39
499	0.39
500	0.4
501	0.34
502	0.34
503	0.32
504	0.28
505	0.24
506	0.25
507	0.22
508	0.18
509	0.16
510	0.15
511	0.17
512	0.17
513	0.16
514	0.1
515	0.11
516	0.1
517	0.13
518	0.13
519	0.11
520	0.12
521	0.12
522	0.11
523	0.1
524	0.12
525	0.11
526	0.14
527	0.14

B6JVX3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer