Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6K5L9

Protein Details
Accession B6K5L9    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-56SYSNDRRRDYGDERRRRRRDDSEYRGRYRDBasic
73-114RKESRYSRDRHDRYDRNERRESRYSSRRRSRSPSYRSRPLNIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-44RRRR
91-103RRESRYSSRRRSR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR006529  U2AF_lg  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0008187  F:poly-pyrimidine tract binding  
GO:0030628  F:pre-mRNA 3'-splice site binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0000245  P:spliceosomal complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MDLHSRISSDRGSSRSRDYGSAGEYNSYSNDRRRDYGDERRRRRRDDSEYRGRYRDDDRRYSSGRDRDDERDRKESRYSRDRHDRYDRNERRESRYSSRRRSRSPSYRSRPLNIERELEELKNVVPLNQWKRKRSMWDMKPPGYENVTADQAKMSGLFPLPGAPRSATADPEKLAAFARSTAGSIIAPPPPIQPGASRQARRLKVKELPAEFEVEDLKNVFEESISTSSFHKDRDTKHVTAIYPCKTERYAIIELATPEDATFIWGARKLKFKNETVLIDRLEGYIVPQISSEVAQKRPKNDLNQKVLDSADKVYIGSLPLYLNEDQISELLKPFGELQSLFLAKNSADMTSRGYAFCEYISSESATAAVQGLNNMEFGDTRLMVQFACVGIQQPVPSPRSVGMAALIELSKSSTEAAPTRVLQIHNLLDADETLDTEDYEDIRKSVQNKCNEYGQVLDLKLPRETSSSDNTSAPPGVGVTFVRFGSIKDAANALQHMSGLRFDDRSIVIAYYPEDCYKANAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.47
3 0.48
4 0.45
5 0.42
6 0.42
7 0.41
8 0.42
9 0.35
10 0.31
11 0.28
12 0.27
13 0.26
14 0.27
15 0.26
16 0.29
17 0.36
18 0.37
19 0.4
20 0.44
21 0.49
22 0.54
23 0.61
24 0.64
25 0.68
26 0.74
27 0.82
28 0.86
29 0.85
30 0.85
31 0.84
32 0.84
33 0.85
34 0.85
35 0.85
36 0.85
37 0.84
38 0.79
39 0.7
40 0.64
41 0.62
42 0.61
43 0.59
44 0.59
45 0.6
46 0.63
47 0.65
48 0.67
49 0.67
50 0.66
51 0.62
52 0.58
53 0.56
54 0.57
55 0.64
56 0.66
57 0.63
58 0.65
59 0.61
60 0.61
61 0.66
62 0.65
63 0.64
64 0.65
65 0.64
66 0.65
67 0.74
68 0.75
69 0.74
70 0.78
71 0.77
72 0.75
73 0.81
74 0.8
75 0.77
76 0.81
77 0.77
78 0.75
79 0.75
80 0.74
81 0.72
82 0.74
83 0.76
84 0.78
85 0.83
86 0.83
87 0.82
88 0.83
89 0.84
90 0.84
91 0.83
92 0.84
93 0.82
94 0.83
95 0.81
96 0.77
97 0.75
98 0.72
99 0.7
100 0.63
101 0.57
102 0.49
103 0.49
104 0.46
105 0.38
106 0.3
107 0.23
108 0.19
109 0.19
110 0.18
111 0.14
112 0.16
113 0.24
114 0.33
115 0.41
116 0.48
117 0.49
118 0.55
119 0.59
120 0.63
121 0.65
122 0.66
123 0.67
124 0.71
125 0.75
126 0.74
127 0.73
128 0.67
129 0.6
130 0.51
131 0.43
132 0.33
133 0.27
134 0.28
135 0.23
136 0.21
137 0.18
138 0.16
139 0.14
140 0.13
141 0.11
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.13
151 0.14
152 0.18
153 0.19
154 0.18
155 0.2
156 0.21
157 0.2
158 0.21
159 0.2
160 0.16
161 0.16
162 0.13
163 0.11
164 0.1
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.15
182 0.23
183 0.3
184 0.31
185 0.36
186 0.44
187 0.5
188 0.56
189 0.54
190 0.52
191 0.51
192 0.57
193 0.58
194 0.51
195 0.48
196 0.42
197 0.41
198 0.34
199 0.28
200 0.22
201 0.15
202 0.14
203 0.1
204 0.09
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.04
209 0.05
210 0.07
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.13
216 0.15
217 0.15
218 0.17
219 0.2
220 0.22
221 0.31
222 0.37
223 0.36
224 0.38
225 0.41
226 0.37
227 0.38
228 0.41
229 0.34
230 0.3
231 0.29
232 0.28
233 0.25
234 0.24
235 0.2
236 0.21
237 0.2
238 0.17
239 0.18
240 0.17
241 0.17
242 0.17
243 0.16
244 0.09
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.09
253 0.11
254 0.13
255 0.2
256 0.2
257 0.28
258 0.33
259 0.34
260 0.36
261 0.38
262 0.39
263 0.36
264 0.38
265 0.31
266 0.26
267 0.25
268 0.19
269 0.16
270 0.12
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.11
280 0.12
281 0.18
282 0.25
283 0.27
284 0.3
285 0.37
286 0.41
287 0.47
288 0.54
289 0.57
290 0.58
291 0.59
292 0.57
293 0.51
294 0.46
295 0.38
296 0.29
297 0.21
298 0.15
299 0.11
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.08
325 0.1
326 0.13
327 0.14
328 0.14
329 0.13
330 0.13
331 0.11
332 0.14
333 0.12
334 0.09
335 0.1
336 0.1
337 0.14
338 0.15
339 0.16
340 0.14
341 0.15
342 0.14
343 0.14
344 0.13
345 0.1
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.11
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.08
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.09
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.13
382 0.18
383 0.19
384 0.19
385 0.2
386 0.19
387 0.21
388 0.21
389 0.17
390 0.14
391 0.13
392 0.13
393 0.13
394 0.12
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.1
403 0.12
404 0.15
405 0.18
406 0.19
407 0.22
408 0.25
409 0.25
410 0.24
411 0.26
412 0.25
413 0.23
414 0.22
415 0.18
416 0.15
417 0.14
418 0.14
419 0.09
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.09
426 0.08
427 0.1
428 0.11
429 0.1
430 0.12
431 0.15
432 0.19
433 0.28
434 0.35
435 0.42
436 0.47
437 0.5
438 0.55
439 0.53
440 0.5
441 0.43
442 0.39
443 0.34
444 0.28
445 0.3
446 0.26
447 0.27
448 0.27
449 0.26
450 0.24
451 0.22
452 0.24
453 0.24
454 0.29
455 0.32
456 0.33
457 0.33
458 0.33
459 0.33
460 0.31
461 0.27
462 0.19
463 0.15
464 0.13
465 0.13
466 0.13
467 0.12
468 0.14
469 0.14
470 0.15
471 0.15
472 0.15
473 0.19
474 0.23
475 0.21
476 0.19
477 0.22
478 0.21
479 0.24
480 0.24
481 0.19
482 0.16
483 0.15
484 0.15
485 0.14
486 0.15
487 0.16
488 0.17
489 0.17
490 0.16
491 0.2
492 0.2
493 0.21
494 0.21
495 0.18
496 0.16
497 0.17
498 0.18
499 0.17
500 0.19
501 0.18
502 0.18
503 0.18