Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6K211

Protein Details
Accession B6K211    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-124GVAPRAKMNQQRSRRFRSAREHydrophilic
767-792NEVVKHLYSKKRQGKPVKLSGKRAHGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
776-789KKRQGKPVKLSGKR
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 9.5, cyto_mito 7.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
GO:0051984  P:positive regulation of chromosome segregation  
GO:0106354  P:tRNA surveillance  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGIPALFRLLSRKYTKVITPVIEVPSKVLPDGTEFGPDLAEPNPNGECDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPPPETEDEMMLAVFEYTDRILAMVRPRNLLMIAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAREAAQKAAALEECVREAKEKGIPVDENAAKKKAWDSNCITPGTPFMDILAKALRYYITHKLNTEPAFKNLRFLLSDASVPGEGEHKIMEFIRSQRVNPEYDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQQGSTRRSKKEQLGLVPKIEATEAPKAPVKKPFIWLNVDILREYLEIELQVPNLPFPFDLERAIDDWVFFIFFVGNDFLPHLPSLDIRDGALERLTEAWRLCLPHMGGYLTLDGSVNLSRAEVILSVIGDQEDEIFRRLKQNEDRRNENQKRRRQAENNANNAELNAPIPVHASPESTQQVASAPPTKVHKTSKVVPPPPENLVNLSDKSSNKFIGVTNKDLINNRAANRLGITPQAAAASSVNKLVAANLKAQLAASQQPAAAPIEKPSRSEEPDLTETIPPTPLDEDEGESTTPAGEETSDVATAGTKRKKPETPELIEGDTVRLWEPGYRERYYTQKFHFEENNEEQIREAVYHYVKGLCWVLLYYYQGCPSWTWYYPFHYAPFAADFKNLSSLKISFDLNQPFKPYEQLLGVLPAASKENLPEKLQKLMTDPDSEIIDFYPENFVIDLNGKKFEWQGVALLPFIDEKRLLDAVAKVYPELTEEESRRNTQGPPLLFFSEKHPMYNEVVKHLYSKKRQGKPVKLSGKRAHGIFGKVSSNPAVVPNVSVPCPLELKDESARNKYGEVQNDTSMCVLYQLPRSHYVHKSMLLRGVNMPPRVLTMDDVNTLRAMRDNPRNMYQRGRRNGGGYGNGGGHSRYGQSNSAPPYPPSRNGYGYGQNNAGYGYGNQGYSQAPWTNGGGYGNAGGAGYSSGYGNGYGGYRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.45
3 0.48
4 0.5
5 0.45
6 0.44
7 0.45
8 0.47
9 0.44
10 0.4
11 0.35
12 0.33
13 0.3
14 0.26
15 0.21
16 0.17
17 0.19
18 0.22
19 0.2
20 0.2
21 0.19
22 0.19
23 0.19
24 0.18
25 0.15
26 0.13
27 0.16
28 0.13
29 0.16
30 0.17
31 0.17
32 0.18
33 0.17
34 0.17
35 0.16
36 0.19
37 0.17
38 0.16
39 0.16
40 0.15
41 0.16
42 0.14
43 0.13
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.11
48 0.13
49 0.18
50 0.21
51 0.23
52 0.31
53 0.41
54 0.46
55 0.51
56 0.51
57 0.51
58 0.52
59 0.51
60 0.44
61 0.37
62 0.31
63 0.26
64 0.22
65 0.17
66 0.12
67 0.1
68 0.08
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.11
77 0.2
78 0.26
79 0.29
80 0.31
81 0.31
82 0.33
83 0.32
84 0.29
85 0.21
86 0.16
87 0.14
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.09
95 0.12
96 0.18
97 0.26
98 0.36
99 0.45
100 0.55
101 0.66
102 0.74
103 0.8
104 0.84
105 0.82
106 0.79
107 0.8
108 0.79
109 0.78
110 0.79
111 0.73
112 0.65
113 0.62
114 0.56
115 0.46
116 0.39
117 0.29
118 0.21
119 0.19
120 0.18
121 0.16
122 0.16
123 0.17
124 0.16
125 0.17
126 0.19
127 0.22
128 0.24
129 0.24
130 0.28
131 0.29
132 0.28
133 0.36
134 0.36
135 0.37
136 0.38
137 0.38
138 0.32
139 0.33
140 0.37
141 0.36
142 0.36
143 0.38
144 0.41
145 0.49
146 0.54
147 0.54
148 0.48
149 0.41
150 0.4
151 0.35
152 0.29
153 0.19
154 0.15
155 0.17
156 0.17
157 0.18
158 0.18
159 0.16
160 0.15
161 0.16
162 0.15
163 0.13
164 0.18
165 0.25
166 0.29
167 0.31
168 0.33
169 0.36
170 0.42
171 0.44
172 0.47
173 0.41
174 0.4
175 0.45
176 0.44
177 0.44
178 0.38
179 0.37
180 0.3
181 0.28
182 0.26
183 0.19
184 0.2
185 0.16
186 0.17
187 0.14
188 0.13
189 0.13
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.11
198 0.13
199 0.16
200 0.24
201 0.25
202 0.26
203 0.31
204 0.34
205 0.35
206 0.34
207 0.4
208 0.36
209 0.41
210 0.43
211 0.39
212 0.41
213 0.38
214 0.36
215 0.28
216 0.25
217 0.19
218 0.19
219 0.16
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.06
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.05
232 0.07
233 0.07
234 0.11
235 0.13
236 0.13
237 0.17
238 0.19
239 0.23
240 0.25
241 0.26
242 0.25
243 0.27
244 0.27
245 0.22
246 0.25
247 0.26
248 0.27
249 0.34
250 0.37
251 0.37
252 0.43
253 0.5
254 0.53
255 0.55
256 0.57
257 0.58
258 0.62
259 0.61
260 0.57
261 0.5
262 0.43
263 0.35
264 0.29
265 0.2
266 0.14
267 0.18
268 0.17
269 0.19
270 0.23
271 0.25
272 0.28
273 0.34
274 0.37
275 0.32
276 0.38
277 0.42
278 0.43
279 0.46
280 0.44
281 0.43
282 0.4
283 0.38
284 0.32
285 0.26
286 0.22
287 0.17
288 0.16
289 0.1
290 0.07
291 0.06
292 0.07
293 0.08
294 0.07
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.1
302 0.13
303 0.12
304 0.13
305 0.14
306 0.14
307 0.15
308 0.16
309 0.14
310 0.1
311 0.1
312 0.08
313 0.08
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.04
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.07
328 0.08
329 0.11
330 0.12
331 0.12
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.09
338 0.07
339 0.09
340 0.1
341 0.11
342 0.1
343 0.12
344 0.13
345 0.14
346 0.14
347 0.15
348 0.15
349 0.15
350 0.16
351 0.15
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.09
356 0.09
357 0.07
358 0.05
359 0.06
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.05
368 0.05
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.05
378 0.06
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.15
383 0.16
384 0.23
385 0.31
386 0.41
387 0.5
388 0.54
389 0.62
390 0.62
391 0.73
392 0.75
393 0.76
394 0.75
395 0.74
396 0.79
397 0.76
398 0.78
399 0.73
400 0.74
401 0.75
402 0.74
403 0.73
404 0.65
405 0.6
406 0.5
407 0.44
408 0.34
409 0.23
410 0.14
411 0.07
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.08
418 0.09
419 0.09
420 0.15
421 0.16
422 0.15
423 0.15
424 0.13
425 0.14
426 0.12
427 0.14
428 0.13
429 0.12
430 0.14
431 0.18
432 0.2
433 0.24
434 0.27
435 0.32
436 0.32
437 0.39
438 0.45
439 0.51
440 0.54
441 0.54
442 0.54
443 0.5
444 0.49
445 0.44
446 0.35
447 0.28
448 0.26
449 0.23
450 0.2
451 0.18
452 0.19
453 0.17
454 0.19
455 0.19
456 0.17
457 0.15
458 0.16
459 0.16
460 0.21
461 0.24
462 0.24
463 0.24
464 0.25
465 0.26
466 0.26
467 0.26
468 0.21
469 0.22
470 0.19
471 0.22
472 0.21
473 0.19
474 0.19
475 0.18
476 0.15
477 0.12
478 0.12
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.07
486 0.06
487 0.07
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.1
493 0.1
494 0.11
495 0.12
496 0.12
497 0.12
498 0.12
499 0.12
500 0.1
501 0.11
502 0.1
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.1
507 0.1
508 0.1
509 0.08
510 0.11
511 0.17
512 0.17
513 0.19
514 0.22
515 0.25
516 0.27
517 0.29
518 0.27
519 0.26
520 0.28
521 0.28
522 0.25
523 0.22
524 0.19
525 0.17
526 0.17
527 0.11
528 0.1
529 0.1
530 0.08
531 0.1
532 0.1
533 0.11
534 0.11
535 0.12
536 0.11
537 0.1
538 0.1
539 0.08
540 0.07
541 0.05
542 0.04
543 0.03
544 0.04
545 0.05
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.07
551 0.09
552 0.15
553 0.2
554 0.22
555 0.25
556 0.31
557 0.36
558 0.41
559 0.5
560 0.52
561 0.51
562 0.54
563 0.53
564 0.48
565 0.44
566 0.38
567 0.28
568 0.19
569 0.15
570 0.1
571 0.08
572 0.07
573 0.08
574 0.11
575 0.16
576 0.22
577 0.22
578 0.23
579 0.25
580 0.34
581 0.37
582 0.41
583 0.37
584 0.41
585 0.42
586 0.44
587 0.48
588 0.42
589 0.44
590 0.43
591 0.48
592 0.39
593 0.37
594 0.33
595 0.29
596 0.26
597 0.19
598 0.15
599 0.1
600 0.11
601 0.11
602 0.12
603 0.12
604 0.12
605 0.13
606 0.13
607 0.09
608 0.09
609 0.08
610 0.09
611 0.09
612 0.11
613 0.11
614 0.11
615 0.12
616 0.12
617 0.13
618 0.13
619 0.16
620 0.18
621 0.18
622 0.21
623 0.21
624 0.26
625 0.3
626 0.31
627 0.27
628 0.24
629 0.23
630 0.21
631 0.22
632 0.19
633 0.16
634 0.15
635 0.14
636 0.14
637 0.21
638 0.2
639 0.17
640 0.18
641 0.18
642 0.19
643 0.2
644 0.2
645 0.15
646 0.21
647 0.28
648 0.29
649 0.3
650 0.31
651 0.3
652 0.3
653 0.3
654 0.25
655 0.19
656 0.17
657 0.17
658 0.14
659 0.15
660 0.14
661 0.12
662 0.11
663 0.09
664 0.09
665 0.09
666 0.08
667 0.09
668 0.14
669 0.17
670 0.19
671 0.25
672 0.26
673 0.32
674 0.33
675 0.31
676 0.3
677 0.32
678 0.32
679 0.28
680 0.27
681 0.22
682 0.22
683 0.21
684 0.18
685 0.13
686 0.12
687 0.09
688 0.09
689 0.1
690 0.09
691 0.09
692 0.09
693 0.09
694 0.09
695 0.13
696 0.15
697 0.14
698 0.17
699 0.16
700 0.17
701 0.18
702 0.19
703 0.17
704 0.14
705 0.15
706 0.15
707 0.16
708 0.15
709 0.14
710 0.12
711 0.12
712 0.11
713 0.11
714 0.09
715 0.09
716 0.12
717 0.12
718 0.12
719 0.13
720 0.15
721 0.16
722 0.18
723 0.18
724 0.14
725 0.14
726 0.14
727 0.13
728 0.13
729 0.15
730 0.18
731 0.2
732 0.26
733 0.29
734 0.31
735 0.32
736 0.32
737 0.29
738 0.29
739 0.34
740 0.3
741 0.3
742 0.32
743 0.32
744 0.31
745 0.31
746 0.3
747 0.33
748 0.31
749 0.29
750 0.27
751 0.28
752 0.31
753 0.36
754 0.32
755 0.28
756 0.29
757 0.29
758 0.32
759 0.36
760 0.41
761 0.43
762 0.52
763 0.57
764 0.64
765 0.73
766 0.79
767 0.82
768 0.83
769 0.86
770 0.86
771 0.83
772 0.84
773 0.81
774 0.8
775 0.73
776 0.64
777 0.58
778 0.52
779 0.48
780 0.41
781 0.37
782 0.31
783 0.28
784 0.29
785 0.25
786 0.21
787 0.19
788 0.19
789 0.17
790 0.14
791 0.15
792 0.17
793 0.18
794 0.18
795 0.18
796 0.17
797 0.17
798 0.18
799 0.17
800 0.19
801 0.18
802 0.22
803 0.27
804 0.33
805 0.36
806 0.4
807 0.42
808 0.38
809 0.38
810 0.41
811 0.41
812 0.42
813 0.44
814 0.42
815 0.43
816 0.43
817 0.42
818 0.35
819 0.29
820 0.21
821 0.15
822 0.13
823 0.13
824 0.2
825 0.23
826 0.26
827 0.33
828 0.37
829 0.42
830 0.45
831 0.48
832 0.45
833 0.47
834 0.48
835 0.45
836 0.48
837 0.42
838 0.4
839 0.37
840 0.41
841 0.42
842 0.39
843 0.36
844 0.3
845 0.3
846 0.3
847 0.27
848 0.21
849 0.19
850 0.2
851 0.24
852 0.24
853 0.22
854 0.21
855 0.21
856 0.19
857 0.18
858 0.19
859 0.23
860 0.32
861 0.39
862 0.44
863 0.52
864 0.58
865 0.58
866 0.65
867 0.67
868 0.67
869 0.68
870 0.69
871 0.63
872 0.59
873 0.61
874 0.56
875 0.51
876 0.43
877 0.37
878 0.31
879 0.29
880 0.27
881 0.22
882 0.17
883 0.14
884 0.15
885 0.15
886 0.18
887 0.19
888 0.22
889 0.28
890 0.33
891 0.37
892 0.37
893 0.37
894 0.42
895 0.46
896 0.49
897 0.48
898 0.48
899 0.46
900 0.47
901 0.51
902 0.52
903 0.5
904 0.48
905 0.45
906 0.39
907 0.36
908 0.33
909 0.27
910 0.19
911 0.15
912 0.16
913 0.15
914 0.15
915 0.15
916 0.16
917 0.17
918 0.17
919 0.22
920 0.19
921 0.18
922 0.21
923 0.22
924 0.21
925 0.22
926 0.21
927 0.17
928 0.15
929 0.14
930 0.12
931 0.11
932 0.09
933 0.08
934 0.07
935 0.07
936 0.06
937 0.06
938 0.06
939 0.06
940 0.07
941 0.08
942 0.07
943 0.08