Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JY09

Protein Details
Accession B6JY09    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-118ILCGNKVIVRHRRRKRVFKNVTNLEKSKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-106RRRKR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd21621  RRM2_Crp79_Mug28  
cd21622  RRM3_Crp79_Mug28  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSFVEEQLRMQPNNRQFFFKNELFVGNLSDSVTEDDLRKFFAPIGEIVVIQLHNNDTRNSNFKRKATKFAFVVFSNTMQVEQAIEALNDTILCGNKVIVRHRRRKRVFKNVTNLEKSKNAATSIMEGDDTDITNQFSSKDLVSSSKTKSARKKSQSGYCFLAIGILNFPTNVTPLQLYNDFKKHAKIVGTAINQAPPNSESTYAEVLIPTYYDCIQLLEYYKEYEYHDRKLDFFVKAPSYFSSRAQMSPDMRQVLAVSLALQKEQAYARAWSACGMNTSAAEQQNYEPEDPCNVFVKNLDDKLIYSKTLLEQLFEPFGHITSSCLPCIPDTDIPKGYGFVAFSKPEEAFSAITRMNGVVVGEKRIFVCFAESREQRSKRLEMGLRARVQENPYSVIPTQTLNRVCVLPMGTNENQVKVMKRENMQPNIKPLKVLGERSNVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.53
3 0.49
4 0.54
5 0.59
6 0.53
7 0.48
8 0.4
9 0.4
10 0.35
11 0.34
12 0.3
13 0.22
14 0.19
15 0.16
16 0.14
17 0.13
18 0.14
19 0.15
20 0.13
21 0.14
22 0.17
23 0.18
24 0.21
25 0.2
26 0.19
27 0.19
28 0.2
29 0.2
30 0.17
31 0.21
32 0.19
33 0.18
34 0.17
35 0.17
36 0.15
37 0.13
38 0.14
39 0.12
40 0.14
41 0.16
42 0.18
43 0.19
44 0.24
45 0.32
46 0.37
47 0.45
48 0.5
49 0.55
50 0.64
51 0.65
52 0.71
53 0.68
54 0.7
55 0.62
56 0.6
57 0.58
58 0.48
59 0.49
60 0.4
61 0.35
62 0.29
63 0.26
64 0.21
65 0.16
66 0.15
67 0.11
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.11
83 0.15
84 0.23
85 0.31
86 0.41
87 0.51
88 0.61
89 0.71
90 0.79
91 0.86
92 0.88
93 0.9
94 0.9
95 0.89
96 0.9
97 0.89
98 0.88
99 0.84
100 0.76
101 0.68
102 0.6
103 0.53
104 0.45
105 0.37
106 0.29
107 0.23
108 0.22
109 0.21
110 0.19
111 0.18
112 0.14
113 0.12
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.12
129 0.16
130 0.2
131 0.22
132 0.28
133 0.32
134 0.38
135 0.47
136 0.55
137 0.62
138 0.65
139 0.71
140 0.71
141 0.77
142 0.73
143 0.68
144 0.62
145 0.52
146 0.44
147 0.35
148 0.3
149 0.2
150 0.17
151 0.13
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.09
156 0.06
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.1
163 0.14
164 0.16
165 0.19
166 0.22
167 0.23
168 0.24
169 0.25
170 0.24
171 0.23
172 0.23
173 0.21
174 0.21
175 0.26
176 0.26
177 0.26
178 0.25
179 0.25
180 0.24
181 0.22
182 0.2
183 0.13
184 0.15
185 0.13
186 0.14
187 0.11
188 0.14
189 0.15
190 0.14
191 0.13
192 0.11
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.2
212 0.21
213 0.24
214 0.27
215 0.27
216 0.27
217 0.3
218 0.32
219 0.25
220 0.24
221 0.24
222 0.23
223 0.22
224 0.23
225 0.2
226 0.21
227 0.21
228 0.21
229 0.21
230 0.2
231 0.2
232 0.21
233 0.25
234 0.23
235 0.25
236 0.27
237 0.24
238 0.23
239 0.22
240 0.2
241 0.16
242 0.14
243 0.1
244 0.07
245 0.08
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.1
251 0.1
252 0.11
253 0.1
254 0.11
255 0.13
256 0.14
257 0.14
258 0.13
259 0.13
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.1
266 0.13
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.17
272 0.19
273 0.19
274 0.15
275 0.15
276 0.18
277 0.18
278 0.19
279 0.17
280 0.16
281 0.15
282 0.16
283 0.2
284 0.21
285 0.21
286 0.21
287 0.19
288 0.19
289 0.24
290 0.24
291 0.19
292 0.15
293 0.16
294 0.15
295 0.22
296 0.21
297 0.17
298 0.17
299 0.18
300 0.2
301 0.18
302 0.18
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.15
309 0.17
310 0.16
311 0.17
312 0.17
313 0.16
314 0.19
315 0.21
316 0.21
317 0.23
318 0.28
319 0.29
320 0.3
321 0.3
322 0.28
323 0.24
324 0.2
325 0.17
326 0.14
327 0.17
328 0.16
329 0.17
330 0.19
331 0.18
332 0.18
333 0.18
334 0.17
335 0.15
336 0.15
337 0.18
338 0.16
339 0.16
340 0.16
341 0.14
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.12
346 0.13
347 0.17
348 0.17
349 0.18
350 0.18
351 0.19
352 0.19
353 0.14
354 0.18
355 0.17
356 0.2
357 0.29
358 0.3
359 0.37
360 0.46
361 0.49
362 0.49
363 0.53
364 0.53
365 0.49
366 0.56
367 0.54
368 0.53
369 0.59
370 0.62
371 0.59
372 0.58
373 0.54
374 0.5
375 0.48
376 0.44
377 0.38
378 0.33
379 0.3
380 0.32
381 0.31
382 0.28
383 0.26
384 0.23
385 0.24
386 0.28
387 0.29
388 0.26
389 0.28
390 0.27
391 0.26
392 0.26
393 0.25
394 0.2
395 0.2
396 0.26
397 0.25
398 0.32
399 0.33
400 0.32
401 0.33
402 0.33
403 0.35
404 0.33
405 0.4
406 0.39
407 0.41
408 0.5
409 0.56
410 0.63
411 0.67
412 0.67
413 0.69
414 0.71
415 0.67
416 0.59
417 0.5
418 0.5
419 0.48
420 0.5
421 0.46