FuNGI

B6JVD7

Protein Details

Accession

B6JVD7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-32	MSDAQHHHRSSQKKKKSFKSKHASKSALKEAF	Hydrophilic
44-70	KPALHTSSKADRKNKAKQIQMNKRAEI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-60	SSQKKKKSFKSKHASKSALKEAFRNRVEPKQNGIKPALHTSSKADRKNKAK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 4, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012948 AARP2CN IPR039761 Bms1/Tsr1 IPR007034 BMS1_TSR1_C IPR030387 G_Bms1/Tsr1_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005730 C:nucleolus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0043021 F:ribonucleoprotein complex binding GO:0034511 F:U3 snoRNA binding GO:0000479 P:endonucleolytic cleavage of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000461 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF08142 AARP2CN PF04950 RIBIOP_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51714 G_BMS1

Amino Acid Sequences

MSDAQHHHRSSQKKKKSFKSKHASKSALKEAFRNRVEPKQNGIKPALHTSSKADRKNKAKQIQMNKRAEIANANRIFGGRNGAPKIVSVISLCANVDAWSTLKKILSSLETEIPEKPVEKFSVTVDRFRQKLQFLVPRRDFLSMADAAKASDYTIFILSATQEVDEFGELVIRTVQGQGASTVISVVDDLTLIDGQKLRTDVKKSLISFMNFFFSDQERIWASDISTEAQNIVRILCTTHPKGVHWRDTRAYVVADDLSWNDGKLAVSGIVRGKGLDPDRLVHIQGFGDFQVDEIHIHPQVRNGVKKQGDVDMEGSEPSDTIVRPTENQDSLDELAPAADVDDMDMAEDDAEKPKGVRLDDFYYFEDEEVPAAAQKRVPKGTSTYQAAWIPDDEEEVYSDAEETEVITVGTEEPKRETVEEEANEVVSDTDDMMDDTKSEMYVELSAEEEARQLAEYRRQVREEEEEREFPDEIELMPDELARERLRKYRGLRSMFSSPWDPEEPDANEPADWRRLFRFQNYRNMKNKMLKQPFIGDVKPGQLVTVYVRNVPESVYQYYADRLFVLYSLMEHEHKLCVSHFTVTKHSEYENPIKSKEELVLQVGPRRMFVNPLYSDASTTGTSNKVQKFNKFLQPSQLSVATAVLPINFGSSPVLLFKQDGDSLKLAATGTFVNTDHNVIIAKRAVLTGHPFKIHKKLVTVRYMFFNPEDVLWYKPIQLFTKQGRTGFIKEPLGTHGYFKATFNGKLTVQDTVAMSLYKRVYPRMSRPLLYTSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.88
3	0.92
4	0.92
5	0.92
6	0.92
7	0.92
8	0.93
9	0.93
10	0.9
11	0.86
12	0.84
13	0.84
14	0.8
15	0.71
16	0.68
17	0.67
18	0.69
19	0.64
20	0.61
21	0.56
22	0.58
23	0.65
24	0.62
25	0.61
26	0.62
27	0.63
28	0.63
29	0.62
30	0.57
31	0.53
32	0.56
33	0.54
34	0.45
35	0.43
36	0.44
37	0.5
38	0.54
39	0.58
40	0.57
41	0.61
42	0.68
43	0.77
44	0.81
45	0.79
46	0.79
47	0.8
48	0.84
49	0.86
50	0.87
51	0.84
52	0.75
53	0.71
54	0.63
55	0.55
56	0.53
57	0.47
58	0.47
59	0.41
60	0.4
61	0.36
62	0.35
63	0.34
64	0.26
65	0.27
66	0.2
67	0.25
68	0.27
69	0.28
70	0.28
71	0.27
72	0.29
73	0.23
74	0.21
75	0.15
76	0.15
77	0.15
78	0.16
79	0.16
80	0.13
81	0.12
82	0.11
83	0.11
84	0.1
85	0.1
86	0.11
87	0.12
88	0.15
89	0.16
90	0.15
91	0.16
92	0.18
93	0.2
94	0.21
95	0.23
96	0.26
97	0.27
98	0.29
99	0.29
100	0.28
101	0.26
102	0.24
103	0.22
104	0.21
105	0.21
106	0.22
107	0.22
108	0.23
109	0.32
110	0.33
111	0.37
112	0.4
113	0.44
114	0.44
115	0.46
116	0.47
117	0.38
118	0.41
119	0.44
120	0.46
121	0.47
122	0.56
123	0.56
124	0.54
125	0.54
126	0.51
127	0.43
128	0.35
129	0.33
130	0.25
131	0.23
132	0.21
133	0.19
134	0.17
135	0.17
136	0.16
137	0.11
138	0.09
139	0.08
140	0.09
141	0.09
142	0.09
143	0.08
144	0.09
145	0.09
146	0.09
147	0.08
148	0.07
149	0.06
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.05
155	0.08
156	0.08
157	0.08
158	0.08
159	0.08
160	0.08
161	0.09
162	0.1
163	0.07
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.07
169	0.07
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.07
181	0.09
182	0.09
183	0.11
184	0.13
185	0.15
186	0.2
187	0.24
188	0.27
189	0.31
190	0.38
191	0.37
192	0.41
193	0.43
194	0.4
195	0.37
196	0.34
197	0.32
198	0.25
199	0.25
200	0.21
201	0.18
202	0.19
203	0.17
204	0.19
205	0.16
206	0.17
207	0.18
208	0.16
209	0.14
210	0.14
211	0.15
212	0.14
213	0.13
214	0.12
215	0.11
216	0.11
217	0.12
218	0.1
219	0.1
220	0.08
221	0.08
222	0.09
223	0.12
224	0.18
225	0.19
226	0.23
227	0.24
228	0.25
229	0.35
230	0.41
231	0.47
232	0.45
233	0.48
234	0.46
235	0.47
236	0.47
237	0.39
238	0.32
239	0.22
240	0.2
241	0.15
242	0.12
243	0.1
244	0.09
245	0.09
246	0.08
247	0.08
248	0.07
249	0.08
250	0.08
251	0.07
252	0.08
253	0.07
254	0.07
255	0.1
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.11
260	0.11
261	0.14
262	0.16
263	0.17
264	0.17
265	0.17
266	0.21
267	0.22
268	0.22
269	0.17
270	0.16
271	0.13
272	0.12
273	0.12
274	0.08
275	0.08
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.09
283	0.1
284	0.11
285	0.11
286	0.13
287	0.19
288	0.23
289	0.26
290	0.27
291	0.33
292	0.34
293	0.35
294	0.34
295	0.32
296	0.29
297	0.26
298	0.25
299	0.18
300	0.17
301	0.15
302	0.13
303	0.09
304	0.08
305	0.06
306	0.06
307	0.05
308	0.06
309	0.08
310	0.09
311	0.1
312	0.14
313	0.18
314	0.18
315	0.19
316	0.18
317	0.18
318	0.19
319	0.18
320	0.15
321	0.1
322	0.09
323	0.08
324	0.07
325	0.05
326	0.04
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.04
337	0.05
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.08
342	0.11
343	0.11
344	0.12
345	0.15
346	0.19
347	0.21
348	0.23
349	0.22
350	0.22
351	0.21
352	0.2
353	0.16
354	0.12
355	0.1
356	0.08
357	0.07
358	0.06
359	0.07
360	0.07
361	0.08
362	0.11
363	0.15
364	0.17
365	0.18
366	0.18
367	0.21
368	0.26
369	0.29
370	0.3
371	0.27
372	0.28
373	0.29
374	0.27
375	0.23
376	0.19
377	0.14
378	0.11
379	0.1
380	0.07
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.04
397	0.07
398	0.08
399	0.08
400	0.09
401	0.11
402	0.12
403	0.12
404	0.13
405	0.13
406	0.18
407	0.18
408	0.18
409	0.17
410	0.16
411	0.15
412	0.14
413	0.11
414	0.05
415	0.05
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.04
420	0.05
421	0.04
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.06
441	0.08
442	0.14
443	0.2
444	0.25
445	0.28
446	0.29
447	0.3
448	0.31
449	0.38
450	0.35
451	0.35
452	0.33
453	0.32
454	0.31
455	0.33
456	0.3
457	0.22
458	0.18
459	0.13
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.07
464	0.07
465	0.07
466	0.06
467	0.07
468	0.1
469	0.09
470	0.12
471	0.14
472	0.2
473	0.24
474	0.3
475	0.35
476	0.42
477	0.5
478	0.52
479	0.52
480	0.51
481	0.53
482	0.47
483	0.44
484	0.38
485	0.29
486	0.28
487	0.28
488	0.23
489	0.19
490	0.23
491	0.23
492	0.21
493	0.22
494	0.18
495	0.17
496	0.17
497	0.18
498	0.2
499	0.18
500	0.18
501	0.2
502	0.26
503	0.28
504	0.36
505	0.44
506	0.43
507	0.53
508	0.6
509	0.65
510	0.67
511	0.7
512	0.68
513	0.66
514	0.69
515	0.69
516	0.69
517	0.62
518	0.57
519	0.56
520	0.54
521	0.5
522	0.42
523	0.33
524	0.26
525	0.26
526	0.24
527	0.2
528	0.15
529	0.11
530	0.12
531	0.12
532	0.16
533	0.15
534	0.16
535	0.16
536	0.17
537	0.17
538	0.17
539	0.18
540	0.17
541	0.18
542	0.18
543	0.18
544	0.18
545	0.21
546	0.2
547	0.17
548	0.13
549	0.12
550	0.1
551	0.09
552	0.09
553	0.07
554	0.06
555	0.08
556	0.1
557	0.1
558	0.11
559	0.12
560	0.13
561	0.13
562	0.14
563	0.12
564	0.14
565	0.15
566	0.19
567	0.21
568	0.23
569	0.29
570	0.31
571	0.32
572	0.29
573	0.29
574	0.3
575	0.32
576	0.38
577	0.4
578	0.4
579	0.39
580	0.4
581	0.4
582	0.37
583	0.33
584	0.28
585	0.22
586	0.23
587	0.27
588	0.26
589	0.3
590	0.32
591	0.3
592	0.27
593	0.26
594	0.23
595	0.22
596	0.22
597	0.26
598	0.23
599	0.26
600	0.29
601	0.27
602	0.28
603	0.25
604	0.25
605	0.18
606	0.17
607	0.16
608	0.15
609	0.18
610	0.24
611	0.29
612	0.35
613	0.39
614	0.45
615	0.5
616	0.55
617	0.61
618	0.6
619	0.56
620	0.58
621	0.57
622	0.53
623	0.5
624	0.44
625	0.34
626	0.29
627	0.28
628	0.18
629	0.15
630	0.13
631	0.09
632	0.08
633	0.08
634	0.09
635	0.08
636	0.08
637	0.08
638	0.08
639	0.09
640	0.11
641	0.12
642	0.11
643	0.12
644	0.12
645	0.15
646	0.18
647	0.2
648	0.21
649	0.21
650	0.21
651	0.21
652	0.21
653	0.17
654	0.13
655	0.13
656	0.1
657	0.1
658	0.11
659	0.11
660	0.13
661	0.14
662	0.15
663	0.14
664	0.14
665	0.14
666	0.12
667	0.16
668	0.15
669	0.15
670	0.14
671	0.14
672	0.14
673	0.16
674	0.23
675	0.27
676	0.3
677	0.34
678	0.35
679	0.39
680	0.48
681	0.52
682	0.47
683	0.48
684	0.53
685	0.57
686	0.64
687	0.64
688	0.57
689	0.56
690	0.55
691	0.49
692	0.41
693	0.36
694	0.27
695	0.24
696	0.25
697	0.21
698	0.21
699	0.22
700	0.22
701	0.23
702	0.25
703	0.29
704	0.29
705	0.32
706	0.37
707	0.43
708	0.52
709	0.52
710	0.5
711	0.51
712	0.53
713	0.54
714	0.52
715	0.51
716	0.46
717	0.43
718	0.43
719	0.42
720	0.4
721	0.35
722	0.31
723	0.28
724	0.27
725	0.28
726	0.27
727	0.3
728	0.31
729	0.33
730	0.33
731	0.34
732	0.31
733	0.35
734	0.35
735	0.31
736	0.27
737	0.27
738	0.25
739	0.22
740	0.22
741	0.18
742	0.16
743	0.19
744	0.21
745	0.22
746	0.24
747	0.27
748	0.35
749	0.42
750	0.52
751	0.57
752	0.61
753	0.6
754	0.61

B6JVD7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer