Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3D2Y9

Protein Details
Accession A0A2H3D2Y9    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
297-323AEGMVSDKQKKKKQRRLEKKMQQGEGPHydrophilic
661-684DDEASGKKNKKKPDGRVKQAKIIRBasic
790-824STQQRERATNPDKEKKGKRDKKKEKTKADAEEPPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-316KQKKKKQRRLEKK
666-682GKKNKKKPDGRVKQAKI
800-862PDKEKKGKRDKKKEKTKADAEEPPSEQERPAKKVHTEETAKKGPGRSLGSLIGRKRKERKGKH
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 12, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSTLGKRKERDEEPVGHGSTLFVSNLPYTATSVDLQTLFSDIAPVRSAFVVTEAGTGVSKGVGYVSFAIKEDAQAAFDKISTDGIALVGRNLRVQWAENKPKDKTEKVKVEAKPKQIPTPRPRAPQDPLAIRTIVVTGIPSSVDSKSLLWKKFRKYKGAESVEWPVDEGAAHVLFSTPSAAHEAVDKLHAHVYKGSLLSVTLKKRMDSLAKASKADIKAAAPNHSSRLIIRNTPFNITEQDLRALFLPYGPIHSIHIPKGKDNGRSRGFAFVWMLSKKDAEKAMESCNGKVIRAGMAEGMVSDKQKKKKQRRLEKKMQQGEGPNGDDDNDEAQEAEKPSERTIAVDWALSKDKWEEEKTRMEEDDDVEMEDSSSEKDEESDEEEQLGVHDGTDEDADDSSDEEDENDEEPVKPQLPPPETGTTLFIRNVPFTATEDELRTLFRAFGPLRYARITLDGSTGRSRGTGFACFWNKEDADKVVEQSDLLKAETTGVESAPKKNPFSMPSILTPDPSSSLAQSLVLHGRTLDVVRAVTRDEAGKLKEEGERRREKADKRNMYLLREGVILPNSPAAQVMVQAELERRNASFGARKALLNSNPSLYVSKTRLSIRQIPIFVSERVLKRLALYAAREFESDVKKGDRNGLTADELAVEVDRKGQLDDDEASGKKNKKKPDGRVKQAKIIRQHERVDVITGKGRSKGYGFVEMHTHADSLRVLRWANNNPSVGKLLQEWYKDELKDLVKAEKGKGKEKDDARLKRLQDEQEKAGPAVKGTLIVEFSIENVQVVQRRSTQQRERATNPDKEKKGKRDKKKEKTKADAEEPPSEQERPAKKVHTEETAKKGPGRSLGSLIGRKRKERKGKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.58
3 0.49
4 0.44
5 0.35
6 0.3
7 0.25
8 0.19
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.13
13 0.13
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.14
18 0.13
19 0.14
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.14
24 0.15
25 0.13
26 0.12
27 0.15
28 0.12
29 0.14
30 0.15
31 0.15
32 0.15
33 0.15
34 0.16
35 0.12
36 0.13
37 0.13
38 0.11
39 0.12
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.09
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.07
49 0.06
50 0.08
51 0.1
52 0.12
53 0.13
54 0.14
55 0.16
56 0.15
57 0.16
58 0.16
59 0.14
60 0.14
61 0.14
62 0.15
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.12
67 0.13
68 0.11
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.09
74 0.11
75 0.13
76 0.13
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.16
81 0.19
82 0.25
83 0.33
84 0.44
85 0.5
86 0.56
87 0.57
88 0.64
89 0.68
90 0.69
91 0.67
92 0.67
93 0.7
94 0.69
95 0.75
96 0.73
97 0.76
98 0.75
99 0.74
100 0.72
101 0.67
102 0.71
103 0.71
104 0.75
105 0.73
106 0.76
107 0.76
108 0.75
109 0.77
110 0.75
111 0.72
112 0.69
113 0.68
114 0.65
115 0.59
116 0.53
117 0.48
118 0.4
119 0.35
120 0.27
121 0.19
122 0.12
123 0.1
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.21
134 0.28
135 0.33
136 0.4
137 0.47
138 0.55
139 0.64
140 0.7
141 0.7
142 0.7
143 0.75
144 0.77
145 0.77
146 0.7
147 0.64
148 0.65
149 0.57
150 0.5
151 0.4
152 0.29
153 0.22
154 0.19
155 0.14
156 0.1
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.06
165 0.07
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.13
170 0.14
171 0.13
172 0.16
173 0.16
174 0.14
175 0.18
176 0.19
177 0.18
178 0.19
179 0.2
180 0.2
181 0.2
182 0.19
183 0.15
184 0.14
185 0.19
186 0.23
187 0.25
188 0.27
189 0.28
190 0.28
191 0.3
192 0.34
193 0.34
194 0.32
195 0.38
196 0.41
197 0.43
198 0.43
199 0.42
200 0.44
201 0.39
202 0.37
203 0.3
204 0.22
205 0.24
206 0.26
207 0.29
208 0.25
209 0.25
210 0.26
211 0.26
212 0.25
213 0.21
214 0.25
215 0.24
216 0.28
217 0.29
218 0.33
219 0.33
220 0.36
221 0.35
222 0.3
223 0.3
224 0.27
225 0.28
226 0.22
227 0.23
228 0.2
229 0.2
230 0.19
231 0.17
232 0.14
233 0.11
234 0.12
235 0.1
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.13
240 0.17
241 0.19
242 0.21
243 0.27
244 0.25
245 0.27
246 0.34
247 0.37
248 0.42
249 0.46
250 0.51
251 0.49
252 0.5
253 0.49
254 0.48
255 0.43
256 0.36
257 0.31
258 0.24
259 0.25
260 0.23
261 0.23
262 0.17
263 0.18
264 0.17
265 0.19
266 0.2
267 0.17
268 0.2
269 0.22
270 0.25
271 0.3
272 0.3
273 0.27
274 0.3
275 0.28
276 0.25
277 0.23
278 0.2
279 0.16
280 0.15
281 0.15
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.14
290 0.19
291 0.27
292 0.35
293 0.46
294 0.56
295 0.65
296 0.75
297 0.81
298 0.86
299 0.89
300 0.93
301 0.92
302 0.91
303 0.89
304 0.8
305 0.72
306 0.65
307 0.59
308 0.52
309 0.43
310 0.33
311 0.25
312 0.23
313 0.19
314 0.15
315 0.12
316 0.08
317 0.07
318 0.06
319 0.07
320 0.09
321 0.1
322 0.1
323 0.12
324 0.13
325 0.13
326 0.16
327 0.16
328 0.14
329 0.15
330 0.17
331 0.14
332 0.14
333 0.14
334 0.13
335 0.16
336 0.14
337 0.14
338 0.12
339 0.14
340 0.18
341 0.22
342 0.23
343 0.25
344 0.33
345 0.35
346 0.36
347 0.34
348 0.31
349 0.28
350 0.25
351 0.23
352 0.15
353 0.13
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.08
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.07
366 0.11
367 0.12
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.04
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.07
397 0.08
398 0.09
399 0.09
400 0.1
401 0.17
402 0.18
403 0.2
404 0.24
405 0.25
406 0.25
407 0.26
408 0.26
409 0.21
410 0.2
411 0.19
412 0.16
413 0.14
414 0.13
415 0.13
416 0.11
417 0.1
418 0.1
419 0.12
420 0.11
421 0.11
422 0.12
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.11
427 0.09
428 0.08
429 0.07
430 0.11
431 0.11
432 0.12
433 0.16
434 0.17
435 0.18
436 0.19
437 0.2
438 0.15
439 0.18
440 0.17
441 0.13
442 0.15
443 0.14
444 0.15
445 0.15
446 0.15
447 0.12
448 0.12
449 0.12
450 0.12
451 0.12
452 0.13
453 0.13
454 0.19
455 0.22
456 0.23
457 0.23
458 0.24
459 0.22
460 0.21
461 0.21
462 0.16
463 0.16
464 0.15
465 0.15
466 0.13
467 0.13
468 0.12
469 0.11
470 0.11
471 0.09
472 0.09
473 0.08
474 0.07
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.07
479 0.06
480 0.1
481 0.11
482 0.16
483 0.21
484 0.24
485 0.24
486 0.26
487 0.29
488 0.27
489 0.31
490 0.3
491 0.26
492 0.26
493 0.31
494 0.29
495 0.27
496 0.25
497 0.2
498 0.18
499 0.17
500 0.15
501 0.1
502 0.11
503 0.1
504 0.1
505 0.1
506 0.1
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.1
511 0.1
512 0.1
513 0.1
514 0.08
515 0.06
516 0.07
517 0.07
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.09
523 0.1
524 0.12
525 0.13
526 0.15
527 0.15
528 0.16
529 0.2
530 0.25
531 0.3
532 0.36
533 0.43
534 0.43
535 0.49
536 0.54
537 0.57
538 0.62
539 0.66
540 0.66
541 0.62
542 0.69
543 0.65
544 0.61
545 0.57
546 0.47
547 0.37
548 0.3
549 0.26
550 0.18
551 0.16
552 0.13
553 0.1
554 0.11
555 0.1
556 0.09
557 0.09
558 0.08
559 0.06
560 0.08
561 0.08
562 0.07
563 0.07
564 0.08
565 0.09
566 0.1
567 0.12
568 0.11
569 0.1
570 0.11
571 0.12
572 0.13
573 0.18
574 0.18
575 0.23
576 0.24
577 0.24
578 0.26
579 0.32
580 0.33
581 0.3
582 0.3
583 0.25
584 0.24
585 0.25
586 0.23
587 0.18
588 0.2
589 0.19
590 0.2
591 0.22
592 0.24
593 0.28
594 0.33
595 0.4
596 0.41
597 0.44
598 0.43
599 0.4
600 0.42
601 0.41
602 0.35
603 0.29
604 0.29
605 0.24
606 0.27
607 0.27
608 0.23
609 0.2
610 0.24
611 0.24
612 0.21
613 0.22
614 0.23
615 0.24
616 0.25
617 0.24
618 0.21
619 0.24
620 0.24
621 0.22
622 0.21
623 0.22
624 0.23
625 0.25
626 0.32
627 0.28
628 0.27
629 0.28
630 0.28
631 0.26
632 0.24
633 0.23
634 0.15
635 0.13
636 0.11
637 0.09
638 0.07
639 0.06
640 0.08
641 0.08
642 0.08
643 0.09
644 0.1
645 0.1
646 0.13
647 0.14
648 0.14
649 0.17
650 0.17
651 0.19
652 0.25
653 0.31
654 0.36
655 0.4
656 0.47
657 0.54
658 0.64
659 0.72
660 0.77
661 0.82
662 0.84
663 0.9
664 0.85
665 0.84
666 0.8
667 0.75
668 0.73
669 0.71
670 0.69
671 0.65
672 0.64
673 0.58
674 0.56
675 0.51
676 0.46
677 0.39
678 0.33
679 0.31
680 0.31
681 0.28
682 0.29
683 0.29
684 0.26
685 0.26
686 0.29
687 0.27
688 0.34
689 0.33
690 0.3
691 0.33
692 0.33
693 0.33
694 0.28
695 0.24
696 0.15
697 0.15
698 0.15
699 0.13
700 0.14
701 0.15
702 0.15
703 0.19
704 0.27
705 0.34
706 0.4
707 0.43
708 0.44
709 0.41
710 0.43
711 0.42
712 0.35
713 0.28
714 0.23
715 0.22
716 0.24
717 0.25
718 0.26
719 0.27
720 0.32
721 0.31
722 0.3
723 0.32
724 0.29
725 0.32
726 0.32
727 0.32
728 0.31
729 0.34
730 0.37
731 0.38
732 0.4
733 0.44
734 0.49
735 0.5
736 0.54
737 0.55
738 0.6
739 0.65
740 0.69
741 0.66
742 0.65
743 0.62
744 0.6
745 0.63
746 0.62
747 0.61
748 0.58
749 0.58
750 0.57
751 0.57
752 0.5
753 0.47
754 0.38
755 0.3
756 0.26
757 0.21
758 0.17
759 0.15
760 0.17
761 0.14
762 0.13
763 0.13
764 0.11
765 0.12
766 0.12
767 0.11
768 0.09
769 0.09
770 0.12
771 0.16
772 0.18
773 0.2
774 0.24
775 0.31
776 0.39
777 0.48
778 0.55
779 0.59
780 0.67
781 0.72
782 0.72
783 0.76
784 0.76
785 0.75
786 0.76
787 0.77
788 0.74
789 0.76
790 0.81
791 0.81
792 0.85
793 0.86
794 0.87
795 0.89
796 0.93
797 0.94
798 0.96
799 0.95
800 0.95
801 0.95
802 0.93
803 0.91
804 0.88
805 0.85
806 0.8
807 0.76
808 0.68
809 0.62
810 0.56
811 0.48
812 0.42
813 0.42
814 0.43
815 0.41
816 0.45
817 0.46
818 0.48
819 0.55
820 0.57
821 0.58
822 0.6
823 0.63
824 0.65
825 0.67
826 0.65
827 0.61
828 0.6
829 0.54
830 0.53
831 0.51
832 0.46
833 0.42
834 0.45
835 0.49
836 0.52
837 0.55
838 0.57
839 0.57
840 0.63
841 0.69
842 0.73