Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3E8T1

Protein Details
Accession A0A2H3E8T1    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-47GSSPQKPRPPKAAAPRKQEDDHydrophilic
144-169EESKAKGAPAKKKFQKKTKQVFVVPEHydrophilic
566-590GSGQAGGPPKPKKRKSNAGPVPPLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-43KKKLPVAKAQPKAGSSPQKPRPPKAAAPRK
148-160AKGAPAKKKFQKK
502-508KAPKLKP
553-581KKRKADDGAASPPGSGQAGGPPKPKKRKS
Subcellular Location(s) mito_nucl 12.333, nucl 12, mito 11.5, cyto_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Amino Acid Sequences MPPKKDLASILFHKKKLPVAKAQPKAGSSPQKPRPPKAAAPRKQEDDDDDLHLPDGPYSDFKLFSSALNGWKYDVMKFDSRKPVDIATWPPPIKLNRKDLRKDDPAANVPGVPVGPMLGADGQPVLQDGKIVMVDAEGRIVQDEESKAKGAPAKKKFQKKTKQVFVVPEEVRQLRKEERYPWVLEDGMGKETWVAQLDDTTKALTHAFFMPAANDVFKFVPAHRWYKFQKKMKHDLPTDTANVEAQYAKHQKRDPTAWLSQRTGRAISAQTAAMFKAEAEGTTVDGPNSLVHTSGQSLGPGGRKLKVVDNGMSGLFGDDEDGEGSRRQREKEYGEEGDLDEQEYEEEFADDDEKMEVDNDDEEAKELEERLKKEYKSANKTREGYIDDSDEEEKPKMSKEERRMQKLIRNREGGDPDDSDDENKNPYASSSSEEEEEIPAQPVSQPPQANETPANSQAPQTPKPSTSQPALNGSKSDVRATSPVGSSLSGHSVVAKRATSPKAPKLKPSGGSRGGSPLASRATSPVPVSNSRATSPVAGAGSRAGSPVVQNGKKRKADDGAASPPGSGQAGGPPKPKKRKSNAGPVPPLEDRMVIEWLKNTPNASTRDCIQHFTPFLRDEGKKAKFTALVKEVAQLKDGVLVLRAAYRNGGAPVSPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.57
3 0.59
4 0.58
5 0.58
6 0.62
7 0.71
8 0.74
9 0.77
10 0.75
11 0.67
12 0.65
13 0.64
14 0.63
15 0.6
16 0.63
17 0.65
18 0.71
19 0.76
20 0.78
21 0.78
22 0.75
23 0.77
24 0.78
25 0.8
26 0.78
27 0.81
28 0.82
29 0.79
30 0.75
31 0.68
32 0.62
33 0.57
34 0.51
35 0.46
36 0.39
37 0.33
38 0.3
39 0.28
40 0.23
41 0.18
42 0.16
43 0.13
44 0.13
45 0.16
46 0.18
47 0.17
48 0.17
49 0.2
50 0.2
51 0.19
52 0.22
53 0.21
54 0.26
55 0.27
56 0.27
57 0.25
58 0.28
59 0.28
60 0.25
61 0.26
62 0.25
63 0.31
64 0.34
65 0.41
66 0.48
67 0.49
68 0.5
69 0.48
70 0.46
71 0.41
72 0.43
73 0.41
74 0.37
75 0.44
76 0.41
77 0.39
78 0.42
79 0.46
80 0.5
81 0.52
82 0.56
83 0.56
84 0.65
85 0.73
86 0.74
87 0.77
88 0.75
89 0.72
90 0.67
91 0.66
92 0.61
93 0.56
94 0.5
95 0.41
96 0.33
97 0.29
98 0.23
99 0.15
100 0.1
101 0.07
102 0.06
103 0.05
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.08
128 0.07
129 0.1
130 0.12
131 0.14
132 0.15
133 0.16
134 0.16
135 0.18
136 0.22
137 0.26
138 0.34
139 0.4
140 0.49
141 0.57
142 0.68
143 0.75
144 0.81
145 0.84
146 0.86
147 0.88
148 0.88
149 0.88
150 0.82
151 0.8
152 0.73
153 0.71
154 0.61
155 0.52
156 0.47
157 0.41
158 0.37
159 0.31
160 0.31
161 0.29
162 0.34
163 0.37
164 0.38
165 0.43
166 0.46
167 0.46
168 0.44
169 0.4
170 0.34
171 0.3
172 0.27
173 0.22
174 0.18
175 0.16
176 0.14
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.1
181 0.09
182 0.07
183 0.1
184 0.12
185 0.14
186 0.14
187 0.13
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.1
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.18
208 0.22
209 0.28
210 0.27
211 0.34
212 0.39
213 0.49
214 0.58
215 0.58
216 0.63
217 0.65
218 0.74
219 0.75
220 0.78
221 0.71
222 0.66
223 0.62
224 0.57
225 0.49
226 0.39
227 0.32
228 0.23
229 0.2
230 0.15
231 0.12
232 0.08
233 0.15
234 0.23
235 0.24
236 0.3
237 0.33
238 0.37
239 0.42
240 0.46
241 0.44
242 0.42
243 0.48
244 0.48
245 0.49
246 0.47
247 0.45
248 0.45
249 0.4
250 0.35
251 0.28
252 0.24
253 0.2
254 0.2
255 0.17
256 0.14
257 0.13
258 0.13
259 0.12
260 0.1
261 0.09
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.09
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.09
286 0.1
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.14
291 0.15
292 0.19
293 0.22
294 0.23
295 0.22
296 0.22
297 0.21
298 0.2
299 0.18
300 0.14
301 0.09
302 0.06
303 0.05
304 0.04
305 0.03
306 0.03
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.06
311 0.07
312 0.13
313 0.15
314 0.16
315 0.19
316 0.24
317 0.27
318 0.31
319 0.35
320 0.31
321 0.29
322 0.29
323 0.26
324 0.22
325 0.19
326 0.13
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.1
355 0.14
356 0.15
357 0.2
358 0.25
359 0.25
360 0.31
361 0.38
362 0.43
363 0.48
364 0.56
365 0.59
366 0.6
367 0.63
368 0.59
369 0.55
370 0.49
371 0.42
372 0.35
373 0.29
374 0.22
375 0.21
376 0.21
377 0.18
378 0.16
379 0.14
380 0.13
381 0.12
382 0.13
383 0.16
384 0.2
385 0.27
386 0.35
387 0.44
388 0.52
389 0.59
390 0.62
391 0.61
392 0.62
393 0.63
394 0.64
395 0.61
396 0.57
397 0.51
398 0.52
399 0.51
400 0.47
401 0.41
402 0.32
403 0.26
404 0.24
405 0.22
406 0.19
407 0.17
408 0.16
409 0.15
410 0.14
411 0.13
412 0.11
413 0.11
414 0.12
415 0.11
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.15
420 0.16
421 0.16
422 0.14
423 0.14
424 0.12
425 0.11
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.11
430 0.14
431 0.18
432 0.18
433 0.18
434 0.24
435 0.25
436 0.26
437 0.26
438 0.25
439 0.23
440 0.24
441 0.25
442 0.2
443 0.21
444 0.23
445 0.28
446 0.28
447 0.29
448 0.3
449 0.29
450 0.32
451 0.35
452 0.34
453 0.32
454 0.33
455 0.33
456 0.39
457 0.41
458 0.39
459 0.35
460 0.33
461 0.34
462 0.31
463 0.29
464 0.21
465 0.2
466 0.2
467 0.22
468 0.23
469 0.18
470 0.18
471 0.17
472 0.17
473 0.16
474 0.15
475 0.15
476 0.13
477 0.12
478 0.14
479 0.15
480 0.17
481 0.19
482 0.17
483 0.18
484 0.24
485 0.28
486 0.33
487 0.38
488 0.46
489 0.53
490 0.55
491 0.6
492 0.62
493 0.65
494 0.64
495 0.64
496 0.64
497 0.59
498 0.59
499 0.52
500 0.48
501 0.42
502 0.36
503 0.29
504 0.23
505 0.19
506 0.19
507 0.18
508 0.16
509 0.17
510 0.18
511 0.2
512 0.2
513 0.22
514 0.25
515 0.29
516 0.31
517 0.32
518 0.3
519 0.31
520 0.28
521 0.25
522 0.23
523 0.21
524 0.17
525 0.15
526 0.14
527 0.14
528 0.14
529 0.12
530 0.12
531 0.09
532 0.08
533 0.09
534 0.15
535 0.23
536 0.27
537 0.34
538 0.43
539 0.52
540 0.57
541 0.59
542 0.58
543 0.55
544 0.56
545 0.56
546 0.54
547 0.51
548 0.5
549 0.48
550 0.42
551 0.36
552 0.31
553 0.24
554 0.17
555 0.11
556 0.14
557 0.21
558 0.25
559 0.32
560 0.4
561 0.49
562 0.6
563 0.69
564 0.72
565 0.76
566 0.83
567 0.84
568 0.88
569 0.88
570 0.88
571 0.87
572 0.78
573 0.75
574 0.65
575 0.59
576 0.48
577 0.39
578 0.3
579 0.24
580 0.27
581 0.2
582 0.2
583 0.2
584 0.22
585 0.24
586 0.25
587 0.23
588 0.22
589 0.28
590 0.32
591 0.34
592 0.34
593 0.35
594 0.42
595 0.43
596 0.43
597 0.39
598 0.42
599 0.41
600 0.4
601 0.42
602 0.34
603 0.35
604 0.39
605 0.38
606 0.37
607 0.44
608 0.47
609 0.46
610 0.46
611 0.48
612 0.47
613 0.48
614 0.51
615 0.46
616 0.43
617 0.4
618 0.44
619 0.46
620 0.4
621 0.38
622 0.29
623 0.24
624 0.25
625 0.25
626 0.19
627 0.14
628 0.14
629 0.13
630 0.19
631 0.2
632 0.16
633 0.17
634 0.17
635 0.18
636 0.2
637 0.2