Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JYD1

Protein Details
Accession B6JYD1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MPKKRFYRKLGRKYSHRKALLRNLVTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-13RKLGRK
Subcellular Location(s) mito 21.5, cyto_mito 12.5, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000456  Ribosomal_L17  
IPR036373  Ribosomal_L17_sf  
Gene Ontology GO:0005762  C:mitochondrial large ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01196  Ribosomal_L17  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01167  RIBOSOMAL_L17  
Amino Acid Sequences MPKKRFYRKLGRKYSHRKALLRNLVTSLVQHENILTTWAKAKEAQKQAEKLITIAKKNGRDHEAWIKASNLVFQPKTTLTKVFDELAPRFQERPGGYTRVLRMPPRFGDNAPQGVLEFVDGPGDSRFYMTAKIIGICQARGKALTEVTELNKRRVLAFRKGGEEEFQRLVECARQEELQRVQADQELENCIREGRVPPKDWKLGDPIPRPTYVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.91
3 0.89
4 0.84
5 0.82
6 0.84
7 0.83
8 0.76
9 0.67
10 0.59
11 0.53
12 0.47
13 0.38
14 0.32
15 0.25
16 0.22
17 0.2
18 0.17
19 0.16
20 0.16
21 0.18
22 0.13
23 0.1
24 0.16
25 0.17
26 0.18
27 0.22
28 0.26
29 0.33
30 0.41
31 0.47
32 0.48
33 0.51
34 0.53
35 0.51
36 0.47
37 0.38
38 0.38
39 0.35
40 0.3
41 0.33
42 0.36
43 0.39
44 0.43
45 0.47
46 0.44
47 0.4
48 0.44
49 0.48
50 0.47
51 0.41
52 0.39
53 0.34
54 0.32
55 0.31
56 0.28
57 0.2
58 0.2
59 0.19
60 0.17
61 0.19
62 0.2
63 0.23
64 0.22
65 0.23
66 0.21
67 0.23
68 0.25
69 0.23
70 0.22
71 0.23
72 0.22
73 0.23
74 0.23
75 0.22
76 0.21
77 0.19
78 0.23
79 0.2
80 0.22
81 0.2
82 0.21
83 0.21
84 0.23
85 0.25
86 0.25
87 0.26
88 0.27
89 0.26
90 0.26
91 0.27
92 0.28
93 0.27
94 0.22
95 0.26
96 0.25
97 0.24
98 0.21
99 0.2
100 0.16
101 0.15
102 0.14
103 0.08
104 0.06
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.08
116 0.07
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.13
126 0.13
127 0.14
128 0.15
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.15
134 0.17
135 0.25
136 0.25
137 0.26
138 0.27
139 0.26
140 0.27
141 0.33
142 0.36
143 0.37
144 0.43
145 0.44
146 0.46
147 0.48
148 0.46
149 0.43
150 0.4
151 0.35
152 0.29
153 0.26
154 0.21
155 0.2
156 0.2
157 0.19
158 0.17
159 0.15
160 0.16
161 0.18
162 0.18
163 0.25
164 0.28
165 0.3
166 0.3
167 0.28
168 0.27
169 0.28
170 0.29
171 0.23
172 0.22
173 0.21
174 0.21
175 0.21
176 0.21
177 0.18
178 0.16
179 0.18
180 0.22
181 0.26
182 0.33
183 0.37
184 0.45
185 0.52
186 0.59
187 0.59
188 0.56
189 0.55
190 0.55
191 0.6
192 0.59
193 0.6
194 0.57