Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3DCJ2

Protein Details
Accession A0A2H3DCJ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
244-270YDNPDFVPKDVKKRKRDPPFPPSRLFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-258KRK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 9.333, mito 9, cyto 4.5, cyto_pero 3.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005100  NGN-domain  
IPR036735  NGN_dom_sf  
IPR039659  SPT5  
Gene Ontology GO:0032784  P:regulation of DNA-templated transcription elongation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03439  Spt5-NGN  
Amino Acid Sequences MPMARSTVTLTDSDPKVASSKYNRFLVMDEDSSTDEDVSLPIHKNPQDDGLNAVKNRSLSCRTETYGVHRDIYHPDHEQWLQELLDSSKMLRPASRMSFRMMPKFAGLMPDDWALWKVKCTLGEEEFVMVSLLASVISEHQVHSAFVLVVGRRWVYLETTKPAALQVLLKGMRDVIQTHNSGALKLLSVPREEWIAMLSSNRKVVERKVGTWVCIRTGNMKGVVGVVSGRYTWGVSIVLIPRIYDNPDFVPKDVKKRKRDPPFPPSRLFNVTHVKAKYGDSSVKQHQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.24
4 0.24
5 0.29
6 0.31
7 0.39
8 0.43
9 0.47
10 0.47
11 0.45
12 0.46
13 0.43
14 0.38
15 0.31
16 0.25
17 0.23
18 0.23
19 0.23
20 0.22
21 0.17
22 0.12
23 0.1
24 0.09
25 0.09
26 0.11
27 0.12
28 0.14
29 0.2
30 0.22
31 0.24
32 0.25
33 0.31
34 0.3
35 0.29
36 0.32
37 0.31
38 0.35
39 0.33
40 0.32
41 0.27
42 0.26
43 0.27
44 0.28
45 0.27
46 0.25
47 0.29
48 0.33
49 0.33
50 0.36
51 0.36
52 0.38
53 0.41
54 0.39
55 0.36
56 0.32
57 0.32
58 0.34
59 0.36
60 0.32
61 0.27
62 0.26
63 0.28
64 0.29
65 0.27
66 0.23
67 0.22
68 0.18
69 0.15
70 0.15
71 0.12
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.16
80 0.2
81 0.27
82 0.31
83 0.3
84 0.32
85 0.38
86 0.4
87 0.44
88 0.39
89 0.33
90 0.28
91 0.28
92 0.24
93 0.2
94 0.18
95 0.12
96 0.13
97 0.13
98 0.12
99 0.11
100 0.12
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.11
106 0.13
107 0.16
108 0.18
109 0.18
110 0.19
111 0.18
112 0.17
113 0.15
114 0.14
115 0.11
116 0.07
117 0.05
118 0.04
119 0.03
120 0.02
121 0.02
122 0.02
123 0.03
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.05
133 0.05
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.11
144 0.13
145 0.15
146 0.17
147 0.17
148 0.17
149 0.16
150 0.14
151 0.12
152 0.1
153 0.08
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.13
163 0.16
164 0.17
165 0.17
166 0.21
167 0.2
168 0.19
169 0.18
170 0.14
171 0.1
172 0.12
173 0.14
174 0.11
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.14
179 0.14
180 0.12
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.11
185 0.13
186 0.13
187 0.16
188 0.16
189 0.18
190 0.19
191 0.22
192 0.3
193 0.31
194 0.31
195 0.38
196 0.39
197 0.39
198 0.42
199 0.4
200 0.32
201 0.31
202 0.3
203 0.25
204 0.28
205 0.29
206 0.25
207 0.24
208 0.21
209 0.19
210 0.19
211 0.14
212 0.11
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.11
224 0.12
225 0.15
226 0.15
227 0.16
228 0.16
229 0.17
230 0.21
231 0.18
232 0.19
233 0.2
234 0.27
235 0.29
236 0.28
237 0.36
238 0.36
239 0.47
240 0.55
241 0.6
242 0.63
243 0.71
244 0.81
245 0.82
246 0.89
247 0.88
248 0.88
249 0.9
250 0.87
251 0.83
252 0.78
253 0.73
254 0.69
255 0.62
256 0.58
257 0.57
258 0.54
259 0.55
260 0.51
261 0.47
262 0.43
263 0.43
264 0.41
265 0.36
266 0.38
267 0.36