Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3EDM2

Protein Details
Accession A0A2H3EDM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-75PVEPSRSRPVSKRKPSSQSATSSRKKKKKNNDKRPEPSRYFEEHydrophilic
701-720EGLGAEKRRVRRNLMRKGQMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-67SRPVSKRKPSSQSATSSRKKKKKNNDKRP
703-717LGAEKRRVRRNLMRK
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 9, cyto_nucl 8.5, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MLSAVAARKAAQAVQPKPAQTPSVLQEEPAPVPVEPSRSRPVSKRKPSSQSATSSRKKKKKNNDKRPEPSRYFEEPDPFQIQEDIIAIDSDTSDEGDIEQPEPVQRGWSPSAPLNDSSEDEDEGMTPISVPQPPPLPIIPEETDTLSTFHPILDQNTFILTPEELCFFGLGEGVAALLALSSSDTICFLGTYKLTVLQGSIKICGTTLHSSTRAHNVFAPRSSPLPVIAVESESQGGPSKTVSLAPRFQRLSGTTDALVVIQELQTNVSGLEVICRAFDGVFSPYRRKDEDAFDFCVPGVHMVSRKTKHCEPFCLPLLWSSALSSASPIEADASEVYVVEGPKKTGKSTFARTLVNQLLARYQRVAYLECDVGQSEFTPGGMVALNIIESPLFGPPFTHPTLPIQAHYIGATTPKSSPSHYLSAIQSLVQTYRLDIQTPTDIGIEGDDDRTWDRIPLVVNTMGWTKGLGADILQKIHAMVEPTQIFEFEAPIIDNAWPARTPAHRLIKPIPSSNLYSAVDTRTLSIMSYFHAVFPSAINPDSFRQITAMKWNTSLPLCAKRPYEVTFSAAVDQVILTGAGTEDVQPSEVQCVLNGALVGLVSCEPGSLDAPLDGIPYTQGALPPSTQSSSCYGLALIRSLSPSVLHILTPSPPASLHKARVLVKGEMELPIWGLLDFRTDKDEVAGVEKGKVPFLQWGKREGLGAEKRRVRRNLMRKGQM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.43
3 0.43
4 0.45
5 0.46
6 0.42
7 0.35
8 0.37
9 0.33
10 0.37
11 0.35
12 0.32
13 0.33
14 0.34
15 0.33
16 0.3
17 0.27
18 0.19
19 0.23
20 0.25
21 0.28
22 0.26
23 0.32
24 0.37
25 0.4
26 0.45
27 0.5
28 0.59
29 0.63
30 0.72
31 0.76
32 0.78
33 0.82
34 0.85
35 0.85
36 0.81
37 0.78
38 0.77
39 0.77
40 0.76
41 0.78
42 0.8
43 0.81
44 0.85
45 0.86
46 0.88
47 0.89
48 0.92
49 0.93
50 0.94
51 0.95
52 0.95
53 0.95
54 0.94
55 0.88
56 0.83
57 0.8
58 0.75
59 0.7
60 0.64
61 0.61
62 0.53
63 0.54
64 0.51
65 0.43
66 0.37
67 0.32
68 0.27
69 0.21
70 0.19
71 0.13
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.13
89 0.15
90 0.14
91 0.15
92 0.14
93 0.2
94 0.23
95 0.25
96 0.27
97 0.29
98 0.34
99 0.33
100 0.34
101 0.32
102 0.3
103 0.29
104 0.29
105 0.26
106 0.22
107 0.19
108 0.18
109 0.15
110 0.14
111 0.12
112 0.09
113 0.07
114 0.07
115 0.1
116 0.12
117 0.12
118 0.15
119 0.18
120 0.2
121 0.23
122 0.23
123 0.24
124 0.23
125 0.29
126 0.27
127 0.25
128 0.25
129 0.23
130 0.24
131 0.21
132 0.21
133 0.15
134 0.15
135 0.13
136 0.12
137 0.13
138 0.13
139 0.15
140 0.15
141 0.16
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.14
146 0.13
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.02
165 0.02
166 0.02
167 0.02
168 0.03
169 0.03
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.13
185 0.16
186 0.16
187 0.17
188 0.15
189 0.14
190 0.14
191 0.14
192 0.15
193 0.16
194 0.17
195 0.19
196 0.22
197 0.23
198 0.25
199 0.34
200 0.3
201 0.28
202 0.29
203 0.31
204 0.32
205 0.32
206 0.32
207 0.24
208 0.25
209 0.26
210 0.22
211 0.17
212 0.15
213 0.14
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.13
229 0.15
230 0.18
231 0.24
232 0.27
233 0.33
234 0.33
235 0.33
236 0.32
237 0.31
238 0.31
239 0.27
240 0.26
241 0.2
242 0.19
243 0.19
244 0.15
245 0.13
246 0.09
247 0.07
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.08
268 0.12
269 0.15
270 0.19
271 0.22
272 0.25
273 0.27
274 0.28
275 0.29
276 0.32
277 0.39
278 0.38
279 0.4
280 0.37
281 0.35
282 0.32
283 0.29
284 0.22
285 0.14
286 0.1
287 0.07
288 0.09
289 0.12
290 0.19
291 0.22
292 0.26
293 0.31
294 0.37
295 0.44
296 0.45
297 0.49
298 0.46
299 0.5
300 0.49
301 0.44
302 0.38
303 0.32
304 0.31
305 0.24
306 0.2
307 0.13
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.12
330 0.12
331 0.13
332 0.14
333 0.2
334 0.23
335 0.29
336 0.34
337 0.34
338 0.35
339 0.35
340 0.37
341 0.33
342 0.31
343 0.26
344 0.2
345 0.2
346 0.2
347 0.2
348 0.16
349 0.14
350 0.13
351 0.14
352 0.15
353 0.12
354 0.13
355 0.13
356 0.12
357 0.12
358 0.1
359 0.09
360 0.08
361 0.07
362 0.06
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.05
368 0.05
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.03
374 0.04
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.07
383 0.11
384 0.13
385 0.13
386 0.13
387 0.15
388 0.21
389 0.21
390 0.2
391 0.18
392 0.17
393 0.17
394 0.16
395 0.14
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.09
401 0.11
402 0.12
403 0.13
404 0.18
405 0.2
406 0.23
407 0.23
408 0.26
409 0.23
410 0.24
411 0.23
412 0.19
413 0.15
414 0.13
415 0.12
416 0.1
417 0.1
418 0.08
419 0.12
420 0.12
421 0.13
422 0.13
423 0.14
424 0.14
425 0.15
426 0.15
427 0.11
428 0.1
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.06
433 0.07
434 0.06
435 0.07
436 0.07
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.08
441 0.1
442 0.11
443 0.11
444 0.14
445 0.14
446 0.13
447 0.14
448 0.15
449 0.13
450 0.12
451 0.1
452 0.07
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.06
457 0.12
458 0.13
459 0.13
460 0.13
461 0.12
462 0.11
463 0.12
464 0.13
465 0.09
466 0.09
467 0.14
468 0.14
469 0.16
470 0.16
471 0.15
472 0.15
473 0.13
474 0.13
475 0.07
476 0.07
477 0.06
478 0.06
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.07
483 0.09
484 0.08
485 0.09
486 0.12
487 0.13
488 0.19
489 0.27
490 0.36
491 0.37
492 0.42
493 0.47
494 0.52
495 0.54
496 0.52
497 0.46
498 0.4
499 0.41
500 0.38
501 0.37
502 0.3
503 0.27
504 0.24
505 0.23
506 0.21
507 0.18
508 0.17
509 0.13
510 0.12
511 0.11
512 0.1
513 0.09
514 0.09
515 0.11
516 0.1
517 0.1
518 0.11
519 0.11
520 0.1
521 0.11
522 0.12
523 0.11
524 0.11
525 0.11
526 0.13
527 0.14
528 0.19
529 0.18
530 0.16
531 0.17
532 0.17
533 0.19
534 0.26
535 0.3
536 0.26
537 0.27
538 0.27
539 0.28
540 0.28
541 0.29
542 0.25
543 0.29
544 0.3
545 0.34
546 0.35
547 0.34
548 0.38
549 0.38
550 0.39
551 0.31
552 0.32
553 0.29
554 0.29
555 0.27
556 0.24
557 0.2
558 0.15
559 0.13
560 0.1
561 0.07
562 0.06
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.05
568 0.05
569 0.06
570 0.07
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.1
575 0.12
576 0.11
577 0.1
578 0.11
579 0.11
580 0.12
581 0.11
582 0.09
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.06
593 0.07
594 0.07
595 0.08
596 0.07
597 0.08
598 0.08
599 0.09
600 0.08
601 0.07
602 0.07
603 0.07
604 0.07
605 0.08
606 0.09
607 0.1
608 0.12
609 0.13
610 0.15
611 0.17
612 0.19
613 0.18
614 0.19
615 0.21
616 0.24
617 0.23
618 0.21
619 0.19
620 0.19
621 0.2
622 0.19
623 0.16
624 0.13
625 0.14
626 0.14
627 0.14
628 0.12
629 0.12
630 0.14
631 0.14
632 0.13
633 0.12
634 0.14
635 0.16
636 0.18
637 0.18
638 0.15
639 0.15
640 0.19
641 0.26
642 0.31
643 0.34
644 0.36
645 0.42
646 0.45
647 0.51
648 0.52
649 0.47
650 0.42
651 0.4
652 0.36
653 0.3
654 0.27
655 0.2
656 0.16
657 0.14
658 0.13
659 0.1
660 0.09
661 0.08
662 0.13
663 0.14
664 0.14
665 0.18
666 0.18
667 0.19
668 0.2
669 0.22
670 0.17
671 0.2
672 0.23
673 0.19
674 0.22
675 0.26
676 0.25
677 0.25
678 0.25
679 0.22
680 0.27
681 0.34
682 0.4
683 0.38
684 0.43
685 0.44
686 0.45
687 0.45
688 0.37
689 0.4
690 0.41
691 0.46
692 0.5
693 0.55
694 0.61
695 0.69
696 0.74
697 0.73
698 0.74
699 0.77
700 0.78