FuNGI

B6JZZ3

Protein Details

Accession

B6JZZ3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
412-456	DEDFGSRRKKLKEKRMMMASKVQTTRKHSARHSKKKASVKTKKSL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
418-456	RRKKLKEKRMMMASKVQTTRKHSARHSKKKASVKTKKSL

Subcellular Location(s)

cyto 15, nucl 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR000629 RNA-helicase_DEAD-box_CS IPR014014 RNA_helicase_DEAD_Q_motif
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000027 P:ribosomal large subunit assembly
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS00039 DEAD_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51195 Q_MOTIF
CDD	cd17955 DEADc_DDX49 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MTNERKETFGSLGISPWLVETLQAVAIQEPTPIQKGVIKKVLEGADCIGGAKTGSGKTIAFALPILEKWARDPFGTFAVILTPTRELAIQIDEQFAALGAPMNLKHILVVGGMDMVAQAIALSKRPHIVVATPGRLADLIRSNGEETYASLHRTQFVVFDEADRLLSPTFADDLDDCLEVLPPPEKRQTLLFTATMTDAIRALKDREPHPGKPPLWLYEVDTEGVSIPESLEQHYLLVASHVRDAYLVQLLSSPENEDKSVIVFANRTYTVELLYRMLRLLDFRVTCLHSEMAQRERVNSLGRFRAEAARVLIATDVASRGLDIPSVKMVVNYDIPRDPDDYVHRVGRAARVGRFGESVSFVTEHDVDLIHAIEDRVGKQMTAYESFSENKMLEKLKQINEAKRKVSLELVDEDFGSRRKKLKEKRMMMASKVQTTRKHSARHSKKKASVKTKKSL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.18
3	0.16
4	0.13
5	0.1
6	0.09
7	0.09
8	0.09
9	0.1
10	0.11
11	0.11
12	0.1
13	0.12
14	0.12
15	0.12
16	0.12
17	0.13
18	0.16
19	0.15
20	0.16
21	0.19
22	0.24
23	0.32
24	0.38
25	0.36
26	0.34
27	0.4
28	0.43
29	0.39
30	0.35
31	0.29
32	0.23
33	0.23
34	0.22
35	0.16
36	0.12
37	0.11
38	0.1
39	0.11
40	0.1
41	0.11
42	0.12
43	0.12
44	0.12
45	0.16
46	0.16
47	0.13
48	0.12
49	0.13
50	0.13
51	0.13
52	0.17
53	0.15
54	0.15
55	0.18
56	0.24
57	0.24
58	0.23
59	0.25
60	0.22
61	0.24
62	0.25
63	0.21
64	0.15
65	0.16
66	0.16
67	0.15
68	0.14
69	0.11
70	0.11
71	0.11
72	0.11
73	0.1
74	0.1
75	0.13
76	0.14
77	0.14
78	0.15
79	0.15
80	0.14
81	0.14
82	0.12
83	0.09
84	0.06
85	0.06
86	0.05
87	0.07
88	0.07
89	0.09
90	0.1
91	0.1
92	0.1
93	0.09
94	0.09
95	0.08
96	0.08
97	0.05
98	0.05
99	0.05
100	0.05
101	0.04
102	0.03
103	0.03
104	0.03
105	0.02
106	0.04
107	0.05
108	0.08
109	0.09
110	0.1
111	0.12
112	0.13
113	0.14
114	0.13
115	0.14
116	0.2
117	0.26
118	0.27
119	0.26
120	0.25
121	0.25
122	0.24
123	0.22
124	0.17
125	0.16
126	0.15
127	0.16
128	0.17
129	0.17
130	0.17
131	0.18
132	0.14
133	0.09
134	0.12
135	0.13
136	0.13
137	0.15
138	0.15
139	0.16
140	0.16
141	0.16
142	0.13
143	0.14
144	0.15
145	0.13
146	0.13
147	0.13
148	0.13
149	0.13
150	0.11
151	0.1
152	0.08
153	0.08
154	0.07
155	0.06
156	0.07
157	0.06
158	0.07
159	0.06
160	0.08
161	0.09
162	0.09
163	0.08
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.1
169	0.1
170	0.13
171	0.18
172	0.18
173	0.19
174	0.22
175	0.24
176	0.24
177	0.26
178	0.23
179	0.19
180	0.2
181	0.19
182	0.17
183	0.13
184	0.1
185	0.08
186	0.07
187	0.08
188	0.08
189	0.1
190	0.12
191	0.16
192	0.17
193	0.27
194	0.32
195	0.34
196	0.39
197	0.45
198	0.42
199	0.43
200	0.45
201	0.37
202	0.34
203	0.32
204	0.28
205	0.22
206	0.23
207	0.18
208	0.15
209	0.13
210	0.11
211	0.1
212	0.08
213	0.05
214	0.04
215	0.05
216	0.06
217	0.06
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.05
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.08
234	0.08
235	0.06
236	0.08
237	0.09
238	0.09
239	0.09
240	0.1
241	0.09
242	0.1
243	0.1
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.1
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.11
253	0.11
254	0.11
255	0.11
256	0.11
257	0.11
258	0.12
259	0.12
260	0.1
261	0.11
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.09
266	0.09
267	0.1
268	0.13
269	0.12
270	0.13
271	0.16
272	0.17
273	0.17
274	0.18
275	0.17
276	0.14
277	0.18
278	0.21
279	0.21
280	0.26
281	0.26
282	0.25
283	0.25
284	0.25
285	0.26
286	0.25
287	0.26
288	0.25
289	0.26
290	0.26
291	0.26
292	0.3
293	0.27
294	0.26
295	0.24
296	0.19
297	0.19
298	0.18
299	0.16
300	0.11
301	0.1
302	0.08
303	0.06
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.06
308	0.06
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.09
313	0.11
314	0.1
315	0.1
316	0.11
317	0.12
318	0.17
319	0.17
320	0.19
321	0.2
322	0.21
323	0.22
324	0.23
325	0.22
326	0.21
327	0.25
328	0.26
329	0.28
330	0.28
331	0.27
332	0.26
333	0.27
334	0.28
335	0.29
336	0.29
337	0.28
338	0.31
339	0.32
340	0.32
341	0.31
342	0.27
343	0.22
344	0.2
345	0.18
346	0.15
347	0.14
348	0.13
349	0.15
350	0.14
351	0.13
352	0.11
353	0.11
354	0.09
355	0.09
356	0.09
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.09
361	0.1
362	0.11
363	0.14
364	0.14
365	0.13
366	0.13
367	0.17
368	0.19
369	0.21
370	0.21
371	0.19
372	0.22
373	0.23
374	0.24
375	0.23
376	0.19
377	0.18
378	0.21
379	0.22
380	0.22
381	0.3
382	0.37
383	0.38
384	0.48
385	0.53
386	0.58
387	0.65
388	0.7
389	0.64
390	0.63
391	0.6
392	0.52
393	0.51
394	0.44
395	0.38
396	0.36
397	0.36
398	0.3
399	0.28
400	0.27
401	0.24
402	0.25
403	0.25
404	0.24
405	0.28
406	0.36
407	0.47
408	0.56
409	0.65
410	0.72
411	0.77
412	0.82
413	0.86
414	0.83
415	0.78
416	0.77
417	0.71
418	0.69
419	0.66
420	0.63
421	0.59
422	0.62
423	0.67
424	0.64
425	0.67
426	0.68
427	0.73
428	0.78
429	0.83
430	0.86
431	0.86
432	0.88
433	0.91
434	0.92
435	0.92
436	0.91

B6JZZ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer