Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JZW3

Protein Details
Accession B6JZW3    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-252ASSARPSRFNRSTRNRYPPTRHSGYHydrophilic
1150-1176ERARLQVKAKPRSRVVRAKPARRIHGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1150-1174ERARLQVKAKPRSRVVRAKPARRIH
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011709  DEAD-box_helicase_OB_fold  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR002464  DNA/RNA_helicase_DEAH_CS  
IPR007502  Helicase-assoc_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0034458  F:3'-5' RNA helicase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000386  F:second spliceosomal transesterification activity  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000378  P:RNA exon ligation  
GO:0040031  P:snRNA modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF04408  HA2  
PF00271  Helicase_C  
PF07717  OB_NTP_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00690  DEAH_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18791  SF2_C_RHA  
Amino Acid Sequences MSSSFHKIIEKLSASSVDPKLAPNLAERVVAIAQKSPNQTVFSTLIRSFGRFDDTVSADIYELAKSESASSKSSGSVTPVTSNADVLENKPVYQKAGLIIPPNASKTLATRPESLGLQSLARQKKASSSPVRHSLSSDENGYSNKRSHGGTTSIDPNTERVEFKKPKPAPDHHSSVQNPRTANALPVGHGLSEKAREKYETYREQRRRMDEGVSWENGSRHDRTNSRASSARPSRFNRSTRNRYPPTRHSGYWDERAVEYPEEDTEPPRDRARWEMEQSRLDRDWYMNSETNNLFGDESHNPFAEFETDLDREREDLLRLQQKKKMSMRSVERARENNLWETNRMVTSGITKLSDVSMELDTNEERRVHLLVHELRPHFLDGQEFTLQQQNTITAVRDPQSDLAVVSKKGSALVRERREFKERQKAATAATALAGTALGNVMGVREKEPSENMEKHMKKTPEPSRARKNHDDLPSKKELPIARVKSLREQRELLPAFAVREQLLSIIRDNQVTVVVGETGSGKTTQLAQFLYEDGQGKLGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGVQLGTLVGYSIRFEDVTSPQTIIKYMTDGVLLRESLVQNDLDRYSVIIMDEAHERSLNTDILMGLLRTILSRRRDLKLIVTSATMNAQRFSEFFGGAPQFTIPGRTYPVDVLFSKAPCSDYVEAAVRQVLQIHVSQPAGDILVFMTGQEDIEVTCDVIKERLAQLTDAAPLSVLPIYSQMPADLQTKIFDAAEPGVRKVVVATNIAETSLTVDGISYVVDTGFCKLKMYNAKMGIDTLQITPISQANANQRSGRAGRTGPGVAYRLYTESAFVREMFQTTLPEIQRTNLSNTVLLLKSLGVKNIMDFDFMDRPPAATLTTSSYELWTLGALDNFGNLTALGSKMANFPMDPSLAKLLIIAAEYGCSNEVLTIVSMLSVPSVFYRPKERLEESDAAREKFHVPESDHLTLLNIYLQWERNHCSVAWCTKHFLHSRSLSRARSIRDQLLDIMKFQKLPIVSCKSDWDVIRKVLCSAYFNQAATAKGIGEYVHLRTGMPCHLHATSSLYGLGYLPDYVIYHELVLTSKEYMNVVTSVDPYWLAEFGGAFYTLKERVKKGSKIVDTVYSKKTELEDQIENDRLKEEEEKERARLQVKAKPRSRVVRAKPARRIHGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.36
3 0.35
4 0.3
5 0.28
6 0.27
7 0.29
8 0.29
9 0.28
10 0.24
11 0.27
12 0.25
13 0.25
14 0.23
15 0.23
16 0.23
17 0.23
18 0.2
19 0.21
20 0.22
21 0.27
22 0.32
23 0.32
24 0.33
25 0.35
26 0.34
27 0.34
28 0.35
29 0.31
30 0.33
31 0.29
32 0.31
33 0.3
34 0.31
35 0.28
36 0.26
37 0.29
38 0.24
39 0.26
40 0.26
41 0.27
42 0.27
43 0.26
44 0.24
45 0.18
46 0.2
47 0.19
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.1
52 0.1
53 0.13
54 0.18
55 0.2
56 0.22
57 0.23
58 0.23
59 0.24
60 0.26
61 0.23
62 0.22
63 0.23
64 0.23
65 0.24
66 0.24
67 0.27
68 0.25
69 0.24
70 0.21
71 0.21
72 0.2
73 0.19
74 0.27
75 0.23
76 0.24
77 0.28
78 0.27
79 0.26
80 0.26
81 0.26
82 0.2
83 0.25
84 0.27
85 0.27
86 0.28
87 0.29
88 0.31
89 0.31
90 0.3
91 0.25
92 0.23
93 0.23
94 0.3
95 0.34
96 0.35
97 0.37
98 0.38
99 0.41
100 0.41
101 0.38
102 0.32
103 0.25
104 0.23
105 0.24
106 0.3
107 0.32
108 0.33
109 0.33
110 0.31
111 0.38
112 0.43
113 0.49
114 0.5
115 0.53
116 0.59
117 0.67
118 0.7
119 0.62
120 0.58
121 0.53
122 0.49
123 0.44
124 0.39
125 0.31
126 0.29
127 0.31
128 0.32
129 0.31
130 0.27
131 0.26
132 0.26
133 0.26
134 0.28
135 0.3
136 0.31
137 0.3
138 0.32
139 0.36
140 0.35
141 0.35
142 0.32
143 0.29
144 0.28
145 0.28
146 0.25
147 0.21
148 0.31
149 0.37
150 0.41
151 0.5
152 0.5
153 0.57
154 0.64
155 0.69
156 0.67
157 0.67
158 0.71
159 0.63
160 0.69
161 0.63
162 0.64
163 0.61
164 0.57
165 0.49
166 0.41
167 0.42
168 0.34
169 0.32
170 0.27
171 0.22
172 0.19
173 0.21
174 0.21
175 0.17
176 0.17
177 0.16
178 0.13
179 0.19
180 0.23
181 0.23
182 0.25
183 0.26
184 0.3
185 0.37
186 0.44
187 0.48
188 0.51
189 0.6
190 0.66
191 0.73
192 0.78
193 0.76
194 0.72
195 0.64
196 0.61
197 0.54
198 0.54
199 0.5
200 0.44
201 0.38
202 0.34
203 0.32
204 0.31
205 0.31
206 0.26
207 0.25
208 0.31
209 0.33
210 0.36
211 0.45
212 0.43
213 0.44
214 0.45
215 0.43
216 0.47
217 0.53
218 0.55
219 0.54
220 0.57
221 0.62
222 0.66
223 0.7
224 0.7
225 0.72
226 0.75
227 0.77
228 0.82
229 0.8
230 0.81
231 0.84
232 0.82
233 0.81
234 0.76
235 0.68
236 0.64
237 0.64
238 0.61
239 0.59
240 0.53
241 0.46
242 0.4
243 0.42
244 0.38
245 0.3
246 0.24
247 0.18
248 0.16
249 0.17
250 0.17
251 0.16
252 0.19
253 0.23
254 0.25
255 0.27
256 0.28
257 0.28
258 0.34
259 0.39
260 0.41
261 0.44
262 0.48
263 0.5
264 0.55
265 0.55
266 0.54
267 0.47
268 0.41
269 0.36
270 0.3
271 0.29
272 0.26
273 0.3
274 0.27
275 0.27
276 0.31
277 0.29
278 0.29
279 0.25
280 0.22
281 0.16
282 0.14
283 0.18
284 0.16
285 0.2
286 0.2
287 0.19
288 0.19
289 0.19
290 0.2
291 0.17
292 0.14
293 0.11
294 0.13
295 0.14
296 0.16
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.16
301 0.16
302 0.14
303 0.16
304 0.22
305 0.3
306 0.36
307 0.4
308 0.42
309 0.45
310 0.53
311 0.56
312 0.58
313 0.55
314 0.58
315 0.61
316 0.67
317 0.71
318 0.68
319 0.67
320 0.61
321 0.61
322 0.57
323 0.52
324 0.47
325 0.45
326 0.41
327 0.35
328 0.34
329 0.31
330 0.26
331 0.24
332 0.18
333 0.13
334 0.14
335 0.15
336 0.14
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.12
341 0.12
342 0.09
343 0.1
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.13
351 0.11
352 0.11
353 0.12
354 0.13
355 0.11
356 0.12
357 0.19
358 0.22
359 0.27
360 0.33
361 0.32
362 0.32
363 0.32
364 0.33
365 0.25
366 0.2
367 0.18
368 0.13
369 0.17
370 0.17
371 0.16
372 0.16
373 0.21
374 0.2
375 0.18
376 0.17
377 0.14
378 0.14
379 0.15
380 0.14
381 0.09
382 0.12
383 0.13
384 0.14
385 0.14
386 0.14
387 0.14
388 0.13
389 0.12
390 0.13
391 0.14
392 0.14
393 0.13
394 0.13
395 0.12
396 0.15
397 0.15
398 0.15
399 0.22
400 0.31
401 0.38
402 0.42
403 0.47
404 0.49
405 0.55
406 0.57
407 0.57
408 0.59
409 0.54
410 0.53
411 0.53
412 0.49
413 0.45
414 0.43
415 0.34
416 0.23
417 0.21
418 0.16
419 0.11
420 0.1
421 0.08
422 0.04
423 0.03
424 0.03
425 0.02
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.04
430 0.05
431 0.06
432 0.08
433 0.09
434 0.1
435 0.11
436 0.14
437 0.19
438 0.21
439 0.23
440 0.32
441 0.33
442 0.35
443 0.42
444 0.4
445 0.36
446 0.44
447 0.5
448 0.5
449 0.57
450 0.62
451 0.66
452 0.72
453 0.77
454 0.75
455 0.71
456 0.68
457 0.69
458 0.7
459 0.63
460 0.62
461 0.6
462 0.54
463 0.49
464 0.46
465 0.38
466 0.34
467 0.41
468 0.37
469 0.36
470 0.39
471 0.39
472 0.43
473 0.5
474 0.49
475 0.43
476 0.41
477 0.38
478 0.44
479 0.44
480 0.35
481 0.28
482 0.25
483 0.22
484 0.2
485 0.2
486 0.1
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.11
494 0.12
495 0.12
496 0.12
497 0.11
498 0.1
499 0.1
500 0.09
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.09
512 0.1
513 0.11
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.12
518 0.12
519 0.11
520 0.11
521 0.09
522 0.09
523 0.09
524 0.08
525 0.08
526 0.09
527 0.07
528 0.06
529 0.08
530 0.1
531 0.13
532 0.13
533 0.13
534 0.13
535 0.15
536 0.15
537 0.14
538 0.15
539 0.21
540 0.23
541 0.26
542 0.26
543 0.23
544 0.23
545 0.23
546 0.2
547 0.11
548 0.1
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.07
553 0.06
554 0.05
555 0.04
556 0.04
557 0.03
558 0.02
559 0.03
560 0.03
561 0.03
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.07
566 0.09
567 0.11
568 0.11
569 0.12
570 0.12
571 0.12
572 0.13
573 0.11
574 0.09
575 0.08
576 0.08
577 0.07
578 0.08
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.08
583 0.07
584 0.09
585 0.08
586 0.08
587 0.09
588 0.08
589 0.07
590 0.09
591 0.09
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.05
599 0.05
600 0.06
601 0.08
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.08
606 0.09
607 0.1
608 0.09
609 0.07
610 0.07
611 0.07
612 0.07
613 0.08
614 0.06
615 0.04
616 0.04
617 0.04
618 0.04
619 0.06
620 0.1
621 0.13
622 0.19
623 0.22
624 0.25
625 0.27
626 0.28
627 0.32
628 0.32
629 0.3
630 0.26
631 0.23
632 0.21
633 0.19
634 0.21
635 0.17
636 0.12
637 0.12
638 0.11
639 0.11
640 0.11
641 0.13
642 0.12
643 0.1
644 0.1
645 0.13
646 0.13
647 0.12
648 0.13
649 0.09
650 0.09
651 0.09
652 0.11
653 0.08
654 0.08
655 0.11
656 0.11
657 0.12
658 0.13
659 0.14
660 0.15
661 0.14
662 0.16
663 0.16
664 0.15
665 0.15
666 0.15
667 0.15
668 0.12
669 0.17
670 0.16
671 0.14
672 0.16
673 0.17
674 0.17
675 0.16
676 0.16
677 0.11
678 0.1
679 0.1
680 0.08
681 0.07
682 0.07
683 0.08
684 0.09
685 0.09
686 0.09
687 0.09
688 0.09
689 0.08
690 0.07
691 0.06
692 0.04
693 0.05
694 0.04
695 0.04
696 0.04
697 0.04
698 0.04
699 0.04
700 0.04
701 0.03
702 0.05
703 0.05
704 0.04
705 0.05
706 0.05
707 0.06
708 0.06
709 0.07
710 0.08
711 0.09
712 0.11
713 0.12
714 0.11
715 0.12
716 0.13
717 0.14
718 0.12
719 0.1
720 0.07
721 0.07
722 0.07
723 0.07
724 0.05
725 0.04
726 0.06
727 0.07
728 0.08
729 0.08
730 0.07
731 0.07
732 0.1
733 0.12
734 0.11
735 0.1
736 0.1
737 0.11
738 0.12
739 0.11
740 0.09
741 0.09
742 0.09
743 0.14
744 0.14
745 0.14
746 0.14
747 0.14
748 0.14
749 0.13
750 0.15
751 0.12
752 0.12
753 0.13
754 0.14
755 0.14
756 0.14
757 0.13
758 0.1
759 0.1
760 0.08
761 0.07
762 0.05
763 0.05
764 0.05
765 0.06
766 0.06
767 0.03
768 0.03
769 0.03
770 0.04
771 0.04
772 0.06
773 0.09
774 0.09
775 0.1
776 0.1
777 0.16
778 0.24
779 0.28
780 0.33
781 0.35
782 0.36
783 0.35
784 0.36
785 0.31
786 0.23
787 0.2
788 0.14
789 0.12
790 0.11
791 0.1
792 0.11
793 0.11
794 0.11
795 0.1
796 0.14
797 0.21
798 0.25
799 0.27
800 0.27
801 0.26
802 0.3
803 0.31
804 0.29
805 0.23
806 0.2
807 0.2
808 0.22
809 0.23
810 0.19
811 0.2
812 0.19
813 0.16
814 0.16
815 0.15
816 0.13
817 0.13
818 0.13
819 0.11
820 0.11
821 0.13
822 0.13
823 0.12
824 0.13
825 0.12
826 0.14
827 0.14
828 0.13
829 0.12
830 0.13
831 0.18
832 0.17
833 0.18
834 0.17
835 0.18
836 0.21
837 0.22
838 0.25
839 0.23
840 0.24
841 0.22
842 0.22
843 0.25
844 0.21
845 0.18
846 0.15
847 0.11
848 0.15
849 0.16
850 0.16
851 0.13
852 0.13
853 0.14
854 0.18
855 0.18
856 0.14
857 0.14
858 0.17
859 0.2
860 0.2
861 0.22
862 0.17
863 0.18
864 0.17
865 0.18
866 0.14
867 0.1
868 0.11
869 0.13
870 0.15
871 0.16
872 0.16
873 0.16
874 0.15
875 0.15
876 0.14
877 0.09
878 0.08
879 0.08
880 0.08
881 0.08
882 0.07
883 0.08
884 0.07
885 0.07
886 0.06
887 0.05
888 0.05
889 0.05
890 0.06
891 0.06
892 0.07
893 0.07
894 0.09
895 0.1
896 0.11
897 0.1
898 0.11
899 0.13
900 0.14
901 0.14
902 0.14
903 0.16
904 0.15
905 0.15
906 0.13
907 0.11
908 0.1
909 0.11
910 0.09
911 0.06
912 0.06
913 0.06
914 0.07
915 0.07
916 0.06
917 0.06
918 0.05
919 0.06
920 0.06
921 0.06
922 0.06
923 0.05
924 0.05
925 0.06
926 0.05
927 0.05
928 0.05
929 0.05
930 0.06
931 0.1
932 0.11
933 0.14
934 0.21
935 0.24
936 0.3
937 0.36
938 0.38
939 0.4
940 0.46
941 0.5
942 0.46
943 0.53
944 0.51
945 0.46
946 0.42
947 0.39
948 0.34
949 0.3
950 0.31
951 0.26
952 0.25
953 0.3
954 0.38
955 0.38
956 0.36
957 0.33
958 0.3
959 0.25
960 0.23
961 0.18
962 0.1
963 0.1
964 0.13
965 0.17
966 0.18
967 0.21
968 0.25
969 0.25
970 0.27
971 0.25
972 0.26
973 0.29
974 0.35
975 0.38
976 0.36
977 0.39
978 0.4
979 0.47
980 0.48
981 0.45
982 0.45
983 0.47
984 0.51
985 0.56
986 0.62
987 0.56
988 0.58
989 0.61
990 0.57
991 0.58
992 0.57
993 0.54
994 0.49
995 0.49
996 0.46
997 0.48
998 0.44
999 0.37
1000 0.34
1001 0.29
1002 0.27
1003 0.25
1004 0.24
1005 0.18
1006 0.21
1007 0.27
1008 0.31
1009 0.32
1010 0.33
1011 0.38
1012 0.37
1013 0.42
1014 0.41
1015 0.39
1016 0.36
1017 0.4
1018 0.42
1019 0.38
1020 0.36
1021 0.34
1022 0.33
1023 0.3
1024 0.28
1025 0.3
1026 0.3
1027 0.3
1028 0.31
1029 0.3
1030 0.29
1031 0.27
1032 0.24
1033 0.17
1034 0.14
1035 0.14
1036 0.11
1037 0.12
1038 0.14
1039 0.14
1040 0.16
1041 0.16
1042 0.16
1043 0.17
1044 0.2
1045 0.23
1046 0.23
1047 0.22
1048 0.23
1049 0.24
1050 0.24
1051 0.24
1052 0.26
1053 0.22
1054 0.2
1055 0.2
1056 0.16
1057 0.16
1058 0.15
1059 0.15
1060 0.1
1061 0.09
1062 0.07
1063 0.08
1064 0.08
1065 0.09
1066 0.11
1067 0.1
1068 0.1
1069 0.1
1070 0.1
1071 0.1
1072 0.12
1073 0.11
1074 0.12
1075 0.13
1076 0.14
1077 0.14
1078 0.14
1079 0.15
1080 0.15
1081 0.14
1082 0.13
1083 0.14
1084 0.13
1085 0.14
1086 0.13
1087 0.12
1088 0.12
1089 0.11
1090 0.1
1091 0.09
1092 0.09
1093 0.09
1094 0.1
1095 0.1
1096 0.09
1097 0.09
1098 0.13
1099 0.17
1100 0.22
1101 0.26
1102 0.28
1103 0.36
1104 0.46
1105 0.51
1106 0.56
1107 0.62
1108 0.62
1109 0.62
1110 0.62
1111 0.62
1112 0.59
1113 0.6
1114 0.56
1115 0.49
1116 0.45
1117 0.42
1118 0.41
1119 0.38
1120 0.38
1121 0.38
1122 0.38
1123 0.38
1124 0.44
1125 0.49
1126 0.46
1127 0.41
1128 0.36
1129 0.3
1130 0.28
1131 0.31
1132 0.29
1133 0.33
1134 0.41
1135 0.44
1136 0.47
1137 0.52
1138 0.54
1139 0.51
1140 0.53
1141 0.5
1142 0.5
1143 0.56
1144 0.63
1145 0.65
1146 0.68
1147 0.74
1148 0.77
1149 0.79
1150 0.82
1151 0.81
1152 0.82
1153 0.85
1154 0.87
1155 0.87
1156 0.87