Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JY39

Protein Details
Accession B6JY39    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-66GDGRPKFSEYQKKKRSEHRRVRRQVKRQTDKFCFGCBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-56QKKKRSEHRRVRRQVK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042246  ZCCHC9  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MARYTNMGKKRFLQATPYEYKPVELPKGASGDGRPKFSEYQKKKRSEHRRVRRQVKRQTDKFCFGCRKQGHILQDCPESGNSKAICFRCGSTEHTLSSCAKKGPLEFATCFICKAKGHLASKCPDNPKGLYPRGGGCKLCSSVHHFAKDCDKITREDVIRGRVASSVGAIGPDEDGFHEYSRIVSATAQKKAAKAPAKKVVSF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.54
3 0.57
4 0.55
5 0.51
6 0.45
7 0.44
8 0.4
9 0.39
10 0.35
11 0.31
12 0.3
13 0.28
14 0.31
15 0.3
16 0.28
17 0.25
18 0.3
19 0.31
20 0.33
21 0.3
22 0.31
23 0.35
24 0.42
25 0.5
26 0.51
27 0.59
28 0.64
29 0.72
30 0.75
31 0.82
32 0.84
33 0.84
34 0.86
35 0.86
36 0.88
37 0.9
38 0.94
39 0.94
40 0.93
41 0.92
42 0.92
43 0.91
44 0.88
45 0.87
46 0.83
47 0.81
48 0.74
49 0.72
50 0.69
51 0.59
52 0.61
53 0.53
54 0.52
55 0.49
56 0.51
57 0.5
58 0.47
59 0.48
60 0.41
61 0.42
62 0.36
63 0.32
64 0.28
65 0.22
66 0.17
67 0.19
68 0.16
69 0.15
70 0.21
71 0.2
72 0.21
73 0.2
74 0.19
75 0.17
76 0.19
77 0.22
78 0.22
79 0.23
80 0.23
81 0.22
82 0.24
83 0.23
84 0.23
85 0.2
86 0.15
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.17
91 0.18
92 0.2
93 0.18
94 0.2
95 0.22
96 0.21
97 0.21
98 0.16
99 0.16
100 0.13
101 0.15
102 0.19
103 0.23
104 0.26
105 0.29
106 0.33
107 0.34
108 0.38
109 0.41
110 0.39
111 0.35
112 0.35
113 0.33
114 0.35
115 0.4
116 0.38
117 0.36
118 0.33
119 0.35
120 0.37
121 0.39
122 0.33
123 0.28
124 0.29
125 0.28
126 0.27
127 0.25
128 0.27
129 0.33
130 0.37
131 0.39
132 0.36
133 0.36
134 0.44
135 0.46
136 0.41
137 0.37
138 0.34
139 0.32
140 0.35
141 0.39
142 0.32
143 0.35
144 0.36
145 0.36
146 0.36
147 0.34
148 0.31
149 0.25
150 0.24
151 0.17
152 0.14
153 0.11
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.12
172 0.2
173 0.27
174 0.31
175 0.36
176 0.36
177 0.38
178 0.43
179 0.49
180 0.49
181 0.5
182 0.55
183 0.6