Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A2H3DDE9

Protein Details
Accession A0A2H3DDE9    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-29QVPPVQPSPALKRKKKSSGTNTPTADHydrophilic
36-65APAPPAIKSRPKIKRDRVPNPSRPPRNDSAHydrophilic
77-106IPPPDAPREPRSQRKGNRKSKANNNNGIEVHydrophilic
163-240DEREGRREDKDRDSRRRRDDDIDNDRREKKSKKRDHSPPEREWDRGKERRRSRERETYTDRRRREKAKYEPDYRTRKVBasic
656-684DGGRYNIGKEPPKKRRRKGTSANFRGTDEBasic
688-711AEGEKAGPSKKRRRKVDAGGIFTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-19KRKKK
36-61APAPPAIKSRPKIKRDRVPNPSRPPR
82-97APREPRSQRKGNRKSK
168-230RREDKDRDSRRRRDDDIDNDRREKKSKKRDHSPPEREWDRGKERRRSRERETYTDRRRREKAK
646-648KRR
663-674GKEPPKKRRRKG
692-702KAGPSKKRRRK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, cyto 5, mito 1, plas 1, pero 1, E.R. 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR002058  PAP_assoc  
IPR002934  Polymerase_NTP_transf_dom  
IPR045862  Trf4-like  
Gene Ontology GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:1990817  F:poly(A) RNA polymerase activity  
GO:0031123  P:RNA 3'-end processing  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01909  NTP_transf_2  
PF03828  PAP_assoc  
CDD cd05402  NT_PAP_TUTase  
Amino Acid Sequences MEEQVPPVQPSPALKRKKKSSGTNTPTADGPAASPAPAPPAIKSRPKIKRDRVPNPSRPPRNDSALPAEKIASSSSIPPPDAPREPRSQRKGNRKSKANNNNGIEVARKVVVIDDDDAQTVSKDLGAGADFVSFDDSDLDNSNEKKSDTKGKERDDGLMSRSDEREGRREDKDRDSRRRRDDDIDNDRREKKSKKRDHSPPEREWDRGKERRRSRERETYTDRRRREKAKYEPDYRTRKVEKVPWLENLDLDTCINVAEVLHREVEAFTKWISPTPVEDEIRGLVVAHIKQAVAASFADAKVLPFGSYATKLYLPTGDIDLVIISDSMAYSNKVTVLHSLAATLKRAGITDRVSIIAKARVPIVKFVTRLGMFHVDISINQGNGLVGVDIINGFLRDMHGRDCMALRSLVLITKMFLAQRGMNEVYTGGLGSYAIVCLVVSFLQMHPKIRRGEIDVDANMGVLVMEFFELYGCYFNFNDVGISVRDGGTYYNKRQRGWYNDSRGLLLSIEDPADPSNDISVGSFAFNKVKTTFAGAFNILASAAYLKAGIINSRRSGNTVQLRDRFDPADLSVLSAIVSITQETINHRKVVQEVYDSGDLHRMVGQKPLPQVFDGRSNGVRDSLKNTHEMDMVLGTDSEQEKESKKRRREEDDESDGGRYNIGKEPPKKRRRKGTSANFRGTDEDSVAEGEKAGPSKKRRRKVDAGGIFTADEDSLSEEEGEYASDSSNRPADKESIRKADIKDRNRSYWLSKGIGPGDVEDDDN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.64
3 0.73
4 0.81
5 0.85
6 0.86
7 0.87
8 0.88
9 0.87
10 0.87
11 0.79
12 0.71
13 0.62
14 0.53
15 0.44
16 0.32
17 0.25
18 0.21
19 0.18
20 0.16
21 0.16
22 0.14
23 0.17
24 0.2
25 0.2
26 0.18
27 0.26
28 0.32
29 0.41
30 0.46
31 0.52
32 0.6
33 0.68
34 0.76
35 0.79
36 0.82
37 0.84
38 0.89
39 0.9
40 0.9
41 0.91
42 0.92
43 0.92
44 0.92
45 0.87
46 0.85
47 0.8
48 0.77
49 0.71
50 0.65
51 0.64
52 0.62
53 0.57
54 0.5
55 0.44
56 0.37
57 0.33
58 0.29
59 0.21
60 0.14
61 0.18
62 0.23
63 0.25
64 0.26
65 0.27
66 0.32
67 0.37
68 0.43
69 0.44
70 0.44
71 0.51
72 0.59
73 0.67
74 0.7
75 0.74
76 0.76
77 0.81
78 0.86
79 0.87
80 0.88
81 0.87
82 0.88
83 0.89
84 0.91
85 0.89
86 0.88
87 0.81
88 0.74
89 0.65
90 0.57
91 0.48
92 0.38
93 0.3
94 0.21
95 0.17
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.15
105 0.13
106 0.12
107 0.1
108 0.09
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.13
126 0.14
127 0.16
128 0.18
129 0.2
130 0.19
131 0.2
132 0.21
133 0.24
134 0.33
135 0.37
136 0.46
137 0.53
138 0.57
139 0.63
140 0.62
141 0.62
142 0.56
143 0.51
144 0.43
145 0.4
146 0.36
147 0.32
148 0.31
149 0.29
150 0.28
151 0.29
152 0.34
153 0.35
154 0.38
155 0.42
156 0.48
157 0.51
158 0.58
159 0.65
160 0.67
161 0.72
162 0.77
163 0.8
164 0.83
165 0.84
166 0.79
167 0.76
168 0.75
169 0.74
170 0.75
171 0.75
172 0.7
173 0.69
174 0.69
175 0.65
176 0.63
177 0.61
178 0.61
179 0.63
180 0.68
181 0.72
182 0.78
183 0.86
184 0.9
185 0.92
186 0.91
187 0.87
188 0.86
189 0.79
190 0.71
191 0.65
192 0.63
193 0.62
194 0.61
195 0.63
196 0.63
197 0.69
198 0.77
199 0.82
200 0.81
201 0.8
202 0.82
203 0.8
204 0.8
205 0.79
206 0.79
207 0.8
208 0.81
209 0.78
210 0.76
211 0.76
212 0.74
213 0.75
214 0.74
215 0.74
216 0.76
217 0.8
218 0.8
219 0.81
220 0.83
221 0.82
222 0.74
223 0.72
224 0.65
225 0.6
226 0.58
227 0.57
228 0.57
229 0.56
230 0.57
231 0.54
232 0.53
233 0.48
234 0.43
235 0.37
236 0.28
237 0.21
238 0.18
239 0.12
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.05
244 0.04
245 0.06
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.11
253 0.1
254 0.09
255 0.08
256 0.11
257 0.11
258 0.13
259 0.14
260 0.13
261 0.14
262 0.18
263 0.24
264 0.22
265 0.22
266 0.21
267 0.19
268 0.19
269 0.17
270 0.12
271 0.07
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.05
292 0.06
293 0.07
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.1
303 0.11
304 0.09
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.05
310 0.04
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.1
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.12
337 0.13
338 0.13
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.15
343 0.14
344 0.13
345 0.12
346 0.13
347 0.14
348 0.14
349 0.17
350 0.2
351 0.2
352 0.2
353 0.2
354 0.22
355 0.2
356 0.2
357 0.19
358 0.18
359 0.15
360 0.14
361 0.14
362 0.1
363 0.1
364 0.14
365 0.13
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.04
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.04
383 0.05
384 0.06
385 0.07
386 0.08
387 0.08
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.07
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.13
408 0.13
409 0.12
410 0.12
411 0.11
412 0.1
413 0.09
414 0.08
415 0.04
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.02
424 0.02
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.04
429 0.05
430 0.11
431 0.12
432 0.16
433 0.18
434 0.24
435 0.25
436 0.26
437 0.28
438 0.26
439 0.3
440 0.29
441 0.31
442 0.25
443 0.24
444 0.22
445 0.2
446 0.16
447 0.11
448 0.08
449 0.04
450 0.03
451 0.02
452 0.02
453 0.02
454 0.02
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.05
459 0.05
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.07
467 0.09
468 0.07
469 0.08
470 0.08
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.09
475 0.14
476 0.19
477 0.25
478 0.33
479 0.36
480 0.37
481 0.42
482 0.49
483 0.5
484 0.54
485 0.56
486 0.57
487 0.59
488 0.59
489 0.54
490 0.47
491 0.39
492 0.3
493 0.21
494 0.13
495 0.09
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.08
502 0.07
503 0.07
504 0.06
505 0.07
506 0.06
507 0.07
508 0.06
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.11
513 0.11
514 0.13
515 0.14
516 0.14
517 0.14
518 0.19
519 0.21
520 0.2
521 0.22
522 0.2
523 0.2
524 0.18
525 0.18
526 0.12
527 0.09
528 0.07
529 0.05
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.06
535 0.06
536 0.1
537 0.13
538 0.17
539 0.19
540 0.22
541 0.22
542 0.24
543 0.25
544 0.31
545 0.36
546 0.38
547 0.43
548 0.46
549 0.51
550 0.5
551 0.51
552 0.44
553 0.36
554 0.31
555 0.25
556 0.23
557 0.18
558 0.17
559 0.14
560 0.13
561 0.12
562 0.1
563 0.09
564 0.05
565 0.06
566 0.05
567 0.05
568 0.06
569 0.07
570 0.13
571 0.2
572 0.23
573 0.24
574 0.24
575 0.25
576 0.27
577 0.31
578 0.28
579 0.24
580 0.22
581 0.25
582 0.28
583 0.26
584 0.24
585 0.24
586 0.21
587 0.19
588 0.2
589 0.19
590 0.17
591 0.23
592 0.25
593 0.25
594 0.3
595 0.32
596 0.31
597 0.29
598 0.32
599 0.28
600 0.33
601 0.31
602 0.3
603 0.3
604 0.3
605 0.3
606 0.31
607 0.31
608 0.25
609 0.3
610 0.32
611 0.31
612 0.33
613 0.35
614 0.32
615 0.32
616 0.3
617 0.23
618 0.18
619 0.17
620 0.13
621 0.11
622 0.08
623 0.11
624 0.11
625 0.12
626 0.12
627 0.14
628 0.18
629 0.28
630 0.38
631 0.44
632 0.52
633 0.6
634 0.68
635 0.76
636 0.8
637 0.8
638 0.8
639 0.78
640 0.73
641 0.65
642 0.57
643 0.48
644 0.4
645 0.31
646 0.22
647 0.17
648 0.19
649 0.24
650 0.31
651 0.39
652 0.5
653 0.6
654 0.7
655 0.78
656 0.82
657 0.87
658 0.89
659 0.91
660 0.91
661 0.91
662 0.92
663 0.91
664 0.9
665 0.8
666 0.72
667 0.64
668 0.56
669 0.46
670 0.36
671 0.27
672 0.19
673 0.19
674 0.18
675 0.14
676 0.12
677 0.11
678 0.12
679 0.14
680 0.17
681 0.24
682 0.33
683 0.44
684 0.54
685 0.63
686 0.71
687 0.78
688 0.84
689 0.87
690 0.88
691 0.86
692 0.83
693 0.75
694 0.66
695 0.56
696 0.46
697 0.36
698 0.25
699 0.15
700 0.09
701 0.09
702 0.09
703 0.09
704 0.09
705 0.09
706 0.09
707 0.09
708 0.09
709 0.08
710 0.08
711 0.08
712 0.11
713 0.12
714 0.15
715 0.2
716 0.2
717 0.21
718 0.24
719 0.3
720 0.37
721 0.45
722 0.5
723 0.53
724 0.56
725 0.6
726 0.61
727 0.65
728 0.66
729 0.65
730 0.67
731 0.66
732 0.69
733 0.69
734 0.69
735 0.64
736 0.63
737 0.61
738 0.54
739 0.49
740 0.5
741 0.46
742 0.45
743 0.39
744 0.32
745 0.29