Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6K5K8

Protein Details
Accession B6K5K8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
163-188ANAAQSQQQRPNRHRPNGHRPMHLSRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR017340  U1_snRNP-C  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
Amino Acid Sequences MSMHEETFQSLRTKNKLTYNNYCHPRPRSNPSVRSLRDFRKRPTTSRVWLTHDSQSVRKAHNAGRAHLQNVQDYYARVAQEEAQKRLSEMSSSGLKQKENGTLNLPHVFAFPPKPVYTGFALPPPPLIIPSTMYTSAPQIPQAAAAPLAAAAAQTLPTAPSRANAAQSQQQRPNRHRPNGHRPMHLSRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.49
3 0.55
4 0.6
5 0.66
6 0.68
7 0.72
8 0.73
9 0.72
10 0.71
11 0.7
12 0.71
13 0.67
14 0.68
15 0.69
16 0.72
17 0.74
18 0.73
19 0.76
20 0.69
21 0.69
22 0.67
23 0.66
24 0.67
25 0.66
26 0.66
27 0.67
28 0.69
29 0.66
30 0.67
31 0.66
32 0.63
33 0.65
34 0.63
35 0.59
36 0.59
37 0.57
38 0.54
39 0.5
40 0.46
41 0.4
42 0.4
43 0.38
44 0.35
45 0.34
46 0.33
47 0.32
48 0.38
49 0.38
50 0.34
51 0.38
52 0.38
53 0.37
54 0.37
55 0.34
56 0.28
57 0.26
58 0.26
59 0.18
60 0.17
61 0.17
62 0.16
63 0.14
64 0.12
65 0.12
66 0.14
67 0.21
68 0.25
69 0.25
70 0.24
71 0.24
72 0.24
73 0.24
74 0.21
75 0.14
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.13
80 0.17
81 0.17
82 0.17
83 0.18
84 0.19
85 0.23
86 0.23
87 0.23
88 0.23
89 0.23
90 0.25
91 0.26
92 0.24
93 0.17
94 0.16
95 0.15
96 0.13
97 0.13
98 0.12
99 0.14
100 0.14
101 0.15
102 0.15
103 0.17
104 0.18
105 0.18
106 0.17
107 0.18
108 0.19
109 0.18
110 0.18
111 0.16
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.09
116 0.1
117 0.12
118 0.15
119 0.15
120 0.15
121 0.15
122 0.17
123 0.18
124 0.16
125 0.16
126 0.14
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.12
131 0.09
132 0.09
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.06
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.15
149 0.17
150 0.2
151 0.22
152 0.25
153 0.32
154 0.39
155 0.47
156 0.5
157 0.56
158 0.62
159 0.67
160 0.74
161 0.77
162 0.79
163 0.81
164 0.83
165 0.86
166 0.87
167 0.87
168 0.84
169 0.8