Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JXJ7

Protein Details
Accession B6JXJ7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
926-984SPVPSDSEDEKPKKKKQRKRRKTKDETESEHEPEHAETSARKTRRRRGGRRVISEERIEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
936-949KPKKKKQRKRRKTK
965-976ARKTRRRRGGRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031101  Ctr9  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR001440  TPR_1  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0051569  P:regulation of histone H3-K4 methylation  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00515  TPR_1  
PF13424  TPR_12  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50293  TPR_REGION  
Amino Acid Sequences MEGFTLEANAPRIIEIPLLGHDQSVEIDCTSLPTDASEICDILTNEQSEKEFWTRFAYEYITRGMSEQAISILTKGLEVLTDDESQAAFNAYLAAIYMQQARLAGRTRGANREEYLNRAQSFLDKISGSHRQWDPALLLQATFGIMKSPKSNSTLDAALHGYDRVLQKSGANVFALMGKALVLYHKKNFRSALKFYQRALVSNPSFQPDPRIGIGLCFWQLDMKEEAHAAWTRAQELNPSNYAIGTYLSLYHYDRAFKNLGTEEFVANYSQALNYTQKAFKACPTNAVAACILAGFTYTKKNLEACIKLANAVVHNAFTPSLSADGYFWMGRAYHQLGKYDEAMKCYQQARSIQDNHLLSYMGIGQIQILQSDYTSAKLTFERISEQAPKCAEALIILGCLNASDPKADPAKPKMLLERAFNILSSSKIPRVVDSDLLITQARLWEKDDASKSLKYLEKALAFIRDAQMVETPELLNNVGVLEYQLFNYGDALKHFEAAKTVMTEGNDGFRVLLTYNIARCKEQLGQLQEAEKMYRDVLQERPEFSDARVRLCLLELANPTDATFKTIRQLMTNDGENLEVRAFFGWYLSKQKRRPAEDPELRHCSQTLRHWHDDTYSLVQLGNAYLRQARELRVASPADKVKRQKLFNKAIQSFDQAIKYDHNNAYAAQGIAITLVHAKQFSKAMLILSKVRETIKDVTTLINIGNCLAELKQYHRAIEIFEQVLDKTGETDGYNVLSSLGRVWLQRGREDKNPAFLRESLKYTQRALAQNPTNTSLQFNTAFVQFQLSELIRTQNENVRTVKDLEYAMEQLDEAIKTFDQLVESKTPPFPPADIQQRSNMAKNTTRRQLERAIQQQKETDALNNARLDEARHRREEEKARRLAEQAALEEAKRKREQELEEERRTMQAEVAEYRRNEQQDENVSPVPSDSEDEKPKKKKQRKRRKTKDETESEHEPEHAETSARKTRRRRGGRRVISEERIEEDEGDEAKTKGKQYKSDPFVVSDMEEDDEEPEASKPSSTEKTEDDNKKEEPGEKVEAQAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.11
4 0.13
5 0.17
6 0.16
7 0.15
8 0.14
9 0.14
10 0.15
11 0.15
12 0.14
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.13
17 0.14
18 0.13
19 0.11
20 0.1
21 0.12
22 0.12
23 0.16
24 0.15
25 0.14
26 0.14
27 0.18
28 0.17
29 0.19
30 0.22
31 0.2
32 0.2
33 0.22
34 0.23
35 0.2
36 0.25
37 0.27
38 0.25
39 0.24
40 0.3
41 0.29
42 0.3
43 0.31
44 0.31
45 0.28
46 0.29
47 0.31
48 0.26
49 0.24
50 0.24
51 0.23
52 0.2
53 0.17
54 0.15
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.1
61 0.1
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.14
72 0.13
73 0.12
74 0.11
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.08
84 0.11
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.13
89 0.16
90 0.2
91 0.2
92 0.22
93 0.29
94 0.33
95 0.4
96 0.42
97 0.43
98 0.4
99 0.47
100 0.45
101 0.44
102 0.46
103 0.45
104 0.42
105 0.38
106 0.37
107 0.32
108 0.34
109 0.29
110 0.26
111 0.2
112 0.2
113 0.25
114 0.34
115 0.32
116 0.36
117 0.36
118 0.36
119 0.37
120 0.39
121 0.35
122 0.3
123 0.34
124 0.25
125 0.23
126 0.2
127 0.19
128 0.17
129 0.15
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.13
134 0.17
135 0.2
136 0.23
137 0.27
138 0.28
139 0.26
140 0.29
141 0.3
142 0.26
143 0.25
144 0.22
145 0.19
146 0.18
147 0.16
148 0.12
149 0.14
150 0.17
151 0.16
152 0.17
153 0.17
154 0.17
155 0.23
156 0.26
157 0.23
158 0.2
159 0.18
160 0.17
161 0.18
162 0.18
163 0.12
164 0.09
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.11
169 0.14
170 0.18
171 0.25
172 0.33
173 0.34
174 0.39
175 0.45
176 0.5
177 0.52
178 0.55
179 0.59
180 0.61
181 0.64
182 0.6
183 0.61
184 0.53
185 0.48
186 0.45
187 0.44
188 0.36
189 0.37
190 0.37
191 0.33
192 0.33
193 0.32
194 0.33
195 0.26
196 0.28
197 0.24
198 0.25
199 0.21
200 0.21
201 0.22
202 0.19
203 0.17
204 0.14
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.15
209 0.16
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.14
214 0.16
215 0.17
216 0.15
217 0.17
218 0.17
219 0.19
220 0.21
221 0.21
222 0.24
223 0.26
224 0.29
225 0.26
226 0.26
227 0.23
228 0.21
229 0.21
230 0.16
231 0.13
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.11
237 0.12
238 0.14
239 0.15
240 0.19
241 0.19
242 0.22
243 0.23
244 0.21
245 0.24
246 0.25
247 0.25
248 0.24
249 0.25
250 0.21
251 0.2
252 0.2
253 0.16
254 0.13
255 0.12
256 0.09
257 0.07
258 0.08
259 0.09
260 0.11
261 0.12
262 0.17
263 0.18
264 0.2
265 0.23
266 0.23
267 0.26
268 0.32
269 0.31
270 0.32
271 0.33
272 0.37
273 0.34
274 0.35
275 0.3
276 0.21
277 0.21
278 0.15
279 0.11
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.06
284 0.1
285 0.12
286 0.13
287 0.15
288 0.16
289 0.2
290 0.26
291 0.27
292 0.24
293 0.28
294 0.27
295 0.26
296 0.27
297 0.24
298 0.18
299 0.18
300 0.16
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.08
306 0.08
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.07
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.12
320 0.15
321 0.18
322 0.2
323 0.23
324 0.24
325 0.26
326 0.28
327 0.3
328 0.27
329 0.26
330 0.26
331 0.23
332 0.27
333 0.27
334 0.26
335 0.24
336 0.28
337 0.3
338 0.36
339 0.39
340 0.37
341 0.41
342 0.4
343 0.36
344 0.32
345 0.26
346 0.19
347 0.15
348 0.14
349 0.08
350 0.07
351 0.06
352 0.05
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.05
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.09
364 0.1
365 0.11
366 0.13
367 0.12
368 0.13
369 0.15
370 0.14
371 0.18
372 0.25
373 0.26
374 0.28
375 0.27
376 0.27
377 0.24
378 0.23
379 0.2
380 0.11
381 0.11
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.1
394 0.13
395 0.15
396 0.19
397 0.22
398 0.28
399 0.29
400 0.3
401 0.31
402 0.34
403 0.35
404 0.34
405 0.32
406 0.29
407 0.28
408 0.26
409 0.23
410 0.17
411 0.15
412 0.15
413 0.15
414 0.13
415 0.16
416 0.16
417 0.16
418 0.19
419 0.2
420 0.19
421 0.17
422 0.17
423 0.14
424 0.15
425 0.14
426 0.1
427 0.09
428 0.1
429 0.1
430 0.09
431 0.11
432 0.13
433 0.13
434 0.19
435 0.21
436 0.21
437 0.24
438 0.24
439 0.23
440 0.26
441 0.27
442 0.23
443 0.24
444 0.24
445 0.22
446 0.22
447 0.23
448 0.19
449 0.17
450 0.17
451 0.15
452 0.13
453 0.12
454 0.11
455 0.12
456 0.11
457 0.11
458 0.1
459 0.09
460 0.08
461 0.09
462 0.08
463 0.06
464 0.05
465 0.05
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.07
476 0.08
477 0.07
478 0.08
479 0.12
480 0.1
481 0.12
482 0.12
483 0.11
484 0.11
485 0.12
486 0.12
487 0.08
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.1
492 0.09
493 0.09
494 0.09
495 0.08
496 0.08
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.07
503 0.09
504 0.13
505 0.14
506 0.13
507 0.14
508 0.16
509 0.17
510 0.2
511 0.23
512 0.23
513 0.24
514 0.25
515 0.25
516 0.24
517 0.22
518 0.18
519 0.13
520 0.1
521 0.08
522 0.1
523 0.1
524 0.12
525 0.15
526 0.21
527 0.22
528 0.23
529 0.25
530 0.23
531 0.23
532 0.21
533 0.25
534 0.2
535 0.21
536 0.2
537 0.18
538 0.16
539 0.16
540 0.17
541 0.1
542 0.13
543 0.12
544 0.13
545 0.13
546 0.13
547 0.13
548 0.13
549 0.12
550 0.12
551 0.12
552 0.11
553 0.13
554 0.16
555 0.16
556 0.16
557 0.18
558 0.18
559 0.2
560 0.21
561 0.18
562 0.16
563 0.16
564 0.14
565 0.13
566 0.1
567 0.07
568 0.06
569 0.06
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.06
574 0.07
575 0.17
576 0.23
577 0.3
578 0.34
579 0.41
580 0.48
581 0.54
582 0.57
583 0.57
584 0.62
585 0.62
586 0.64
587 0.64
588 0.64
589 0.57
590 0.53
591 0.44
592 0.36
593 0.32
594 0.33
595 0.37
596 0.37
597 0.4
598 0.41
599 0.41
600 0.4
601 0.38
602 0.33
603 0.27
604 0.2
605 0.16
606 0.15
607 0.14
608 0.13
609 0.11
610 0.1
611 0.06
612 0.06
613 0.08
614 0.08
615 0.11
616 0.12
617 0.13
618 0.17
619 0.18
620 0.18
621 0.21
622 0.22
623 0.2
624 0.24
625 0.27
626 0.26
627 0.31
628 0.35
629 0.38
630 0.45
631 0.5
632 0.52
633 0.57
634 0.63
635 0.63
636 0.68
637 0.62
638 0.58
639 0.54
640 0.5
641 0.43
642 0.36
643 0.32
644 0.23
645 0.22
646 0.21
647 0.21
648 0.23
649 0.22
650 0.21
651 0.2
652 0.19
653 0.19
654 0.18
655 0.16
656 0.1
657 0.08
658 0.07
659 0.06
660 0.06
661 0.05
662 0.04
663 0.05
664 0.05
665 0.06
666 0.07
667 0.08
668 0.1
669 0.1
670 0.11
671 0.11
672 0.12
673 0.13
674 0.15
675 0.17
676 0.18
677 0.19
678 0.19
679 0.18
680 0.18
681 0.2
682 0.23
683 0.21
684 0.21
685 0.21
686 0.2
687 0.2
688 0.2
689 0.16
690 0.12
691 0.11
692 0.08
693 0.08
694 0.06
695 0.07
696 0.06
697 0.08
698 0.08
699 0.12
700 0.2
701 0.21
702 0.22
703 0.23
704 0.23
705 0.23
706 0.25
707 0.25
708 0.17
709 0.17
710 0.17
711 0.15
712 0.17
713 0.15
714 0.12
715 0.09
716 0.09
717 0.09
718 0.09
719 0.1
720 0.08
721 0.09
722 0.09
723 0.08
724 0.09
725 0.08
726 0.07
727 0.07
728 0.08
729 0.08
730 0.09
731 0.12
732 0.15
733 0.17
734 0.22
735 0.27
736 0.3
737 0.35
738 0.44
739 0.43
740 0.49
741 0.5
742 0.47
743 0.45
744 0.44
745 0.42
746 0.36
747 0.39
748 0.33
749 0.35
750 0.36
751 0.34
752 0.36
753 0.37
754 0.37
755 0.36
756 0.41
757 0.42
758 0.43
759 0.43
760 0.42
761 0.37
762 0.33
763 0.32
764 0.24
765 0.22
766 0.19
767 0.17
768 0.16
769 0.16
770 0.16
771 0.14
772 0.15
773 0.12
774 0.11
775 0.14
776 0.13
777 0.13
778 0.14
779 0.17
780 0.15
781 0.17
782 0.19
783 0.22
784 0.24
785 0.27
786 0.28
787 0.26
788 0.28
789 0.3
790 0.29
791 0.25
792 0.23
793 0.2
794 0.21
795 0.19
796 0.17
797 0.14
798 0.12
799 0.09
800 0.11
801 0.09
802 0.08
803 0.08
804 0.08
805 0.08
806 0.09
807 0.09
808 0.1
809 0.11
810 0.14
811 0.18
812 0.19
813 0.22
814 0.24
815 0.24
816 0.24
817 0.25
818 0.23
819 0.22
820 0.29
821 0.36
822 0.38
823 0.39
824 0.42
825 0.47
826 0.49
827 0.5
828 0.45
829 0.4
830 0.42
831 0.48
832 0.52
833 0.54
834 0.57
835 0.55
836 0.56
837 0.6
838 0.6
839 0.62
840 0.64
841 0.64
842 0.6
843 0.6
844 0.57
845 0.5
846 0.45
847 0.37
848 0.29
849 0.27
850 0.27
851 0.3
852 0.28
853 0.27
854 0.26
855 0.25
856 0.26
857 0.29
858 0.36
859 0.38
860 0.41
861 0.45
862 0.46
863 0.55
864 0.63
865 0.63
866 0.63
867 0.64
868 0.62
869 0.6
870 0.59
871 0.54
872 0.48
873 0.4
874 0.32
875 0.29
876 0.28
877 0.26
878 0.31
879 0.3
880 0.33
881 0.34
882 0.34
883 0.34
884 0.41
885 0.45
886 0.48
887 0.57
888 0.59
889 0.6
890 0.61
891 0.57
892 0.51
893 0.48
894 0.38
895 0.29
896 0.23
897 0.21
898 0.23
899 0.27
900 0.31
901 0.3
902 0.32
903 0.35
904 0.34
905 0.34
906 0.32
907 0.35
908 0.38
909 0.4
910 0.43
911 0.4
912 0.38
913 0.35
914 0.33
915 0.26
916 0.19
917 0.19
918 0.17
919 0.22
920 0.32
921 0.39
922 0.48
923 0.56
924 0.65
925 0.73
926 0.8
927 0.83
928 0.85
929 0.89
930 0.91
931 0.94
932 0.96
933 0.96
934 0.97
935 0.97
936 0.96
937 0.95
938 0.91
939 0.87
940 0.82
941 0.74
942 0.64
943 0.54
944 0.44
945 0.35
946 0.29
947 0.22
948 0.17
949 0.16
950 0.23
951 0.31
952 0.36
953 0.43
954 0.51
955 0.6
956 0.69
957 0.78
958 0.81
959 0.84
960 0.89
961 0.91
962 0.92
963 0.91
964 0.88
965 0.83
966 0.77
967 0.67
968 0.6
969 0.53
970 0.43
971 0.35
972 0.27
973 0.24
974 0.2
975 0.2
976 0.18
977 0.15
978 0.18
979 0.21
980 0.26
981 0.3
982 0.36
983 0.42
984 0.49
985 0.6
986 0.62
987 0.67
988 0.64
989 0.59
990 0.55
991 0.49
992 0.4
993 0.31
994 0.26
995 0.19
996 0.17
997 0.14
998 0.13
999 0.13
1000 0.13
1001 0.12
1002 0.12
1003 0.12
1004 0.13
1005 0.13
1006 0.13
1007 0.18
1008 0.25
1009 0.28
1010 0.31
1011 0.33
1012 0.41
1013 0.5
1014 0.58
1015 0.57
1016 0.56
1017 0.54
1018 0.56
1019 0.56
1020 0.53
1021 0.48
1022 0.46
1023 0.47
1024 0.43