Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3DVT0

Protein Details
Accession A0A2H3DVT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
439-463DANHQPKPSGRPNSRGKVRRRLASVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
449-458RPNSRGKVRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MQVPFDNGTDISGLTFNPFAEDGSSLPTSSIDGNSVSPDAESRSPTLRRGSGSDYTTASTSSSTSSIFTDGKRSGHVRSQTEVPTTLHPLRYNTPGPSDANVTRPTLTRRVNVGSLVDVSVNSSREDVVESGVEEPDQMVVLVHEVSAKDSLAGVSLKYGISLADLRRSNHLWTSDSIHLRKVLYIPLDKCSRPQDLITSGEPSDISLMSTASDATDSNGYRPDLSTLNRHTTANGHDPNPKHHTIAGRSPSLKLRRVPVSQLSFFPPSASKLNSPIRLTKPPSTPIQSRPSIHTRYTSSPPNSLGTLLTALPIPASTRDTIIARLSLDSSTSSSYSDREREAEDGERLELDDVPIERRRYASEDQISSFSPMTPRPSYRTTHGIKSSSSPPPSPTRIRGGIATESAHARGYHPLHGSTVHVRNVQLEPSPGMQLPIHDANHQPKPSGRPNSRGKVRRRLASVDFDVEPDALIDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.1
4 0.12
5 0.12
6 0.11
7 0.12
8 0.13
9 0.11
10 0.16
11 0.17
12 0.14
13 0.14
14 0.14
15 0.14
16 0.15
17 0.15
18 0.11
19 0.12
20 0.13
21 0.14
22 0.15
23 0.13
24 0.12
25 0.12
26 0.15
27 0.16
28 0.18
29 0.19
30 0.26
31 0.28
32 0.32
33 0.38
34 0.37
35 0.37
36 0.4
37 0.43
38 0.42
39 0.42
40 0.41
41 0.36
42 0.34
43 0.31
44 0.27
45 0.21
46 0.15
47 0.13
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.15
54 0.17
55 0.17
56 0.22
57 0.23
58 0.24
59 0.28
60 0.29
61 0.3
62 0.35
63 0.42
64 0.39
65 0.4
66 0.45
67 0.43
68 0.44
69 0.42
70 0.36
71 0.32
72 0.35
73 0.36
74 0.34
75 0.33
76 0.34
77 0.34
78 0.39
79 0.39
80 0.35
81 0.34
82 0.34
83 0.33
84 0.31
85 0.33
86 0.29
87 0.3
88 0.3
89 0.28
90 0.26
91 0.27
92 0.3
93 0.33
94 0.35
95 0.34
96 0.37
97 0.39
98 0.39
99 0.37
100 0.33
101 0.26
102 0.23
103 0.2
104 0.15
105 0.11
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.11
113 0.12
114 0.11
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.06
142 0.06
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.05
148 0.07
149 0.1
150 0.1
151 0.16
152 0.19
153 0.2
154 0.23
155 0.25
156 0.25
157 0.26
158 0.27
159 0.22
160 0.22
161 0.26
162 0.29
163 0.32
164 0.31
165 0.29
166 0.29
167 0.27
168 0.27
169 0.22
170 0.19
171 0.17
172 0.22
173 0.22
174 0.25
175 0.29
176 0.27
177 0.29
178 0.31
179 0.3
180 0.26
181 0.26
182 0.24
183 0.24
184 0.27
185 0.25
186 0.23
187 0.2
188 0.19
189 0.18
190 0.14
191 0.12
192 0.08
193 0.07
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.05
201 0.04
202 0.05
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.11
207 0.12
208 0.11
209 0.12
210 0.13
211 0.12
212 0.14
213 0.19
214 0.2
215 0.24
216 0.25
217 0.25
218 0.24
219 0.23
220 0.26
221 0.27
222 0.27
223 0.24
224 0.27
225 0.28
226 0.33
227 0.37
228 0.34
229 0.27
230 0.27
231 0.29
232 0.28
233 0.34
234 0.33
235 0.3
236 0.3
237 0.31
238 0.35
239 0.36
240 0.37
241 0.32
242 0.33
243 0.36
244 0.37
245 0.39
246 0.39
247 0.39
248 0.36
249 0.36
250 0.34
251 0.3
252 0.28
253 0.26
254 0.2
255 0.17
256 0.18
257 0.19
258 0.16
259 0.21
260 0.27
261 0.31
262 0.32
263 0.36
264 0.38
265 0.43
266 0.47
267 0.46
268 0.44
269 0.43
270 0.46
271 0.45
272 0.44
273 0.44
274 0.47
275 0.45
276 0.43
277 0.45
278 0.47
279 0.45
280 0.42
281 0.4
282 0.37
283 0.37
284 0.4
285 0.43
286 0.38
287 0.37
288 0.37
289 0.35
290 0.31
291 0.27
292 0.22
293 0.15
294 0.14
295 0.11
296 0.09
297 0.08
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.11
307 0.12
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.12
323 0.16
324 0.18
325 0.18
326 0.18
327 0.2
328 0.2
329 0.22
330 0.24
331 0.22
332 0.2
333 0.19
334 0.17
335 0.16
336 0.15
337 0.12
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.13
342 0.18
343 0.19
344 0.19
345 0.2
346 0.23
347 0.26
348 0.29
349 0.34
350 0.36
351 0.37
352 0.38
353 0.39
354 0.38
355 0.34
356 0.31
357 0.23
358 0.18
359 0.18
360 0.23
361 0.26
362 0.28
363 0.31
364 0.35
365 0.38
366 0.4
367 0.47
368 0.45
369 0.48
370 0.51
371 0.48
372 0.45
373 0.46
374 0.48
375 0.47
376 0.47
377 0.4
378 0.39
379 0.44
380 0.49
381 0.51
382 0.49
383 0.48
384 0.48
385 0.48
386 0.47
387 0.43
388 0.39
389 0.35
390 0.31
391 0.25
392 0.23
393 0.22
394 0.21
395 0.17
396 0.15
397 0.21
398 0.22
399 0.26
400 0.27
401 0.27
402 0.27
403 0.27
404 0.3
405 0.31
406 0.34
407 0.33
408 0.33
409 0.32
410 0.35
411 0.36
412 0.34
413 0.29
414 0.25
415 0.23
416 0.23
417 0.25
418 0.21
419 0.22
420 0.2
421 0.18
422 0.22
423 0.26
424 0.25
425 0.25
426 0.31
427 0.36
428 0.44
429 0.44
430 0.41
431 0.4
432 0.47
433 0.54
434 0.59
435 0.58
436 0.59
437 0.68
438 0.76
439 0.82
440 0.82
441 0.82
442 0.82
443 0.84
444 0.82
445 0.78
446 0.75
447 0.71
448 0.71
449 0.67
450 0.6
451 0.53
452 0.45
453 0.41
454 0.33
455 0.27