Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6K5B4

Protein Details
Accession B6K5B4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-68TETSDQTTSAPKRRRRRKPVIQNEDFCGHydrophilic
104-125SWYCNKCMYKKNETPKRPRGMWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-58PKRRRRRK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 11.333, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0032221  C:Rpd3S/Clr6-CII complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15535  PHD1_Rco1  
Amino Acid Sequences MKSPKKPSAPKSLTSSRTSSPAPAGTPNSTPAKKSKSRTGTETSDQTTSAPKRRRRRKPVIQNEDFCGACGGQGLFLCCESCPRSFHLSCLNPPLSRNDIPEGSWYCNKCMYKKNETPKRPRGMWSLLMDDQDDSNPVCFKLPQQIVTEFHGITVGRLGQYKEENTTLDYGEIAELLSDQSMMNLAHCGHCHRPSIGSCKITGCDLCETFYHTGDCAEYMPVCEHPDSAKQIWRIPRYTVAIKDSEKGTWFLEKQKFTDDPSSPEDEYEDPPLPVSCIYNLDAVAIVQDFLINAKRDAVQRRKTQHLERLPTEPRALMIWAMQKFSNNSKLPRVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.63
3 0.53
4 0.52
5 0.48
6 0.42
7 0.37
8 0.35
9 0.32
10 0.33
11 0.35
12 0.33
13 0.34
14 0.36
15 0.39
16 0.38
17 0.38
18 0.4
19 0.45
20 0.5
21 0.54
22 0.6
23 0.61
24 0.65
25 0.69
26 0.69
27 0.67
28 0.65
29 0.64
30 0.57
31 0.48
32 0.43
33 0.37
34 0.38
35 0.38
36 0.41
37 0.44
38 0.5
39 0.6
40 0.7
41 0.81
42 0.83
43 0.88
44 0.9
45 0.93
46 0.95
47 0.95
48 0.94
49 0.86
50 0.79
51 0.72
52 0.6
53 0.49
54 0.39
55 0.28
56 0.18
57 0.16
58 0.12
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.09
66 0.13
67 0.14
68 0.16
69 0.16
70 0.2
71 0.28
72 0.28
73 0.31
74 0.37
75 0.39
76 0.39
77 0.45
78 0.44
79 0.36
80 0.37
81 0.39
82 0.36
83 0.34
84 0.34
85 0.3
86 0.28
87 0.27
88 0.32
89 0.3
90 0.28
91 0.31
92 0.29
93 0.27
94 0.32
95 0.33
96 0.33
97 0.39
98 0.42
99 0.47
100 0.54
101 0.63
102 0.67
103 0.75
104 0.8
105 0.81
106 0.81
107 0.74
108 0.7
109 0.65
110 0.6
111 0.57
112 0.49
113 0.44
114 0.38
115 0.35
116 0.32
117 0.25
118 0.2
119 0.14
120 0.13
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.16
129 0.18
130 0.2
131 0.23
132 0.25
133 0.27
134 0.29
135 0.3
136 0.21
137 0.19
138 0.18
139 0.15
140 0.12
141 0.1
142 0.08
143 0.06
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.11
148 0.12
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.13
154 0.11
155 0.1
156 0.09
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.11
176 0.14
177 0.17
178 0.18
179 0.18
180 0.21
181 0.23
182 0.3
183 0.32
184 0.29
185 0.27
186 0.27
187 0.27
188 0.25
189 0.22
190 0.17
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.14
195 0.17
196 0.17
197 0.18
198 0.16
199 0.13
200 0.13
201 0.12
202 0.12
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.11
213 0.16
214 0.2
215 0.21
216 0.25
217 0.26
218 0.31
219 0.38
220 0.41
221 0.39
222 0.37
223 0.4
224 0.4
225 0.42
226 0.4
227 0.36
228 0.36
229 0.35
230 0.35
231 0.31
232 0.28
233 0.25
234 0.23
235 0.21
236 0.22
237 0.22
238 0.29
239 0.34
240 0.35
241 0.35
242 0.39
243 0.39
244 0.38
245 0.44
246 0.37
247 0.35
248 0.38
249 0.41
250 0.36
251 0.34
252 0.32
253 0.26
254 0.26
255 0.26
256 0.23
257 0.18
258 0.19
259 0.19
260 0.17
261 0.16
262 0.15
263 0.11
264 0.13
265 0.14
266 0.15
267 0.14
268 0.14
269 0.13
270 0.12
271 0.11
272 0.08
273 0.07
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.14
282 0.18
283 0.24
284 0.34
285 0.43
286 0.47
287 0.55
288 0.62
289 0.69
290 0.74
291 0.77
292 0.77
293 0.77
294 0.77
295 0.72
296 0.73
297 0.69
298 0.65
299 0.58
300 0.48
301 0.39
302 0.32
303 0.3
304 0.22
305 0.21
306 0.24
307 0.24
308 0.25
309 0.25
310 0.27
311 0.3
312 0.36
313 0.41
314 0.4
315 0.43