Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3DMD1

Protein Details
Accession A0A2H3DMD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
403-423QSGSSQKEKKRLNPRDPLRVWHydrophilic
430-475DQDLVKDYKTNKKRKRDGQDSPNKKRKLSSSPKKKQVVRVKKMTEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
440-471NKKRKRDGQDSPNKKRKLSSSPKKKQVVRVKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041177  GEN1_C  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
Gene Ontology GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006974  P:DNA damage response  
Pfam View protein in Pfam  
PF18380  GEN1_C  
PF00867  XPG_I  
CDD cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences MATPTTSATNTTHGWHLLEKYSTQKSLTELPPTEDFRLGIDVQPWFCHSDRSVGGENPRLRLLFYRCKLLLAYPILPLFIFDRQPQRHPQNHILTEELTTAFIPIIEAFGFEWRYAPGDPLTELAHLNRKGIIDAVLTDDVAIWVFGAWTVWRNPSSSHPQVRSADKQTTYKVYHCDKQKRRSMMLMIILCASWCDAPTARRLATTPLANELYKAAAAETIQLQDFLPGWRTALCEESKLVPPGDFPELSLYITPEVSTTPEAYPTTIKEPSLLKLAGLCESLFEWGWPEEILVRFYRWLWGPVVFRVSRRRFKCPDDEVLGFFGGNGQLMEEIVGERGQDDETKEYRVQVDTKVLMSMTEAGLKRTRTPKGKELALDEDGTGEEEPNIDEHEEGHEHTPEHQSGSSQKEKKRLNPRDPLRVWIPAELVDQDLVKDYKTNKKRKRDGQDSPNKKRKLSSSPKKKQVVRVKKMTEELARKEGLSSLLAFGFTKLSSAGRVAAPERES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.27
4 0.28
5 0.28
6 0.28
7 0.32
8 0.37
9 0.37
10 0.35
11 0.33
12 0.32
13 0.39
14 0.4
15 0.42
16 0.38
17 0.4
18 0.45
19 0.47
20 0.47
21 0.39
22 0.35
23 0.28
24 0.31
25 0.27
26 0.23
27 0.22
28 0.23
29 0.22
30 0.23
31 0.24
32 0.23
33 0.23
34 0.25
35 0.22
36 0.26
37 0.27
38 0.31
39 0.34
40 0.34
41 0.39
42 0.43
43 0.45
44 0.4
45 0.41
46 0.35
47 0.32
48 0.35
49 0.38
50 0.4
51 0.39
52 0.45
53 0.43
54 0.44
55 0.43
56 0.38
57 0.38
58 0.32
59 0.32
60 0.26
61 0.26
62 0.25
63 0.24
64 0.23
65 0.18
66 0.16
67 0.17
68 0.18
69 0.28
70 0.32
71 0.37
72 0.46
73 0.53
74 0.57
75 0.62
76 0.67
77 0.67
78 0.68
79 0.64
80 0.57
81 0.49
82 0.43
83 0.36
84 0.27
85 0.18
86 0.13
87 0.12
88 0.09
89 0.08
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.12
102 0.12
103 0.14
104 0.12
105 0.12
106 0.13
107 0.13
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.14
112 0.21
113 0.2
114 0.2
115 0.21
116 0.2
117 0.19
118 0.19
119 0.18
120 0.11
121 0.11
122 0.14
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.06
137 0.08
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.15
142 0.21
143 0.29
144 0.35
145 0.41
146 0.41
147 0.46
148 0.5
149 0.54
150 0.54
151 0.51
152 0.49
153 0.45
154 0.45
155 0.41
156 0.44
157 0.41
158 0.37
159 0.39
160 0.38
161 0.41
162 0.47
163 0.55
164 0.58
165 0.65
166 0.7
167 0.69
168 0.67
169 0.66
170 0.6
171 0.54
172 0.51
173 0.43
174 0.35
175 0.28
176 0.25
177 0.2
178 0.17
179 0.12
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.09
185 0.13
186 0.16
187 0.16
188 0.17
189 0.17
190 0.19
191 0.22
192 0.23
193 0.2
194 0.2
195 0.22
196 0.21
197 0.2
198 0.17
199 0.13
200 0.11
201 0.11
202 0.07
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.07
214 0.08
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.12
224 0.14
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.16
232 0.13
233 0.11
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.1
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.08
247 0.07
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.15
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.15
258 0.16
259 0.19
260 0.17
261 0.13
262 0.14
263 0.14
264 0.13
265 0.12
266 0.11
267 0.07
268 0.08
269 0.09
270 0.07
271 0.06
272 0.07
273 0.06
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.14
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.16
289 0.17
290 0.18
291 0.23
292 0.21
293 0.24
294 0.32
295 0.38
296 0.43
297 0.46
298 0.53
299 0.53
300 0.58
301 0.64
302 0.59
303 0.58
304 0.54
305 0.52
306 0.44
307 0.41
308 0.35
309 0.25
310 0.2
311 0.14
312 0.08
313 0.07
314 0.06
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.06
327 0.07
328 0.08
329 0.13
330 0.14
331 0.18
332 0.18
333 0.19
334 0.2
335 0.22
336 0.22
337 0.19
338 0.23
339 0.2
340 0.2
341 0.2
342 0.18
343 0.15
344 0.14
345 0.13
346 0.09
347 0.13
348 0.13
349 0.15
350 0.19
351 0.2
352 0.25
353 0.31
354 0.38
355 0.41
356 0.47
357 0.52
358 0.55
359 0.59
360 0.56
361 0.54
362 0.51
363 0.45
364 0.4
365 0.31
366 0.25
367 0.21
368 0.19
369 0.15
370 0.09
371 0.07
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.1
380 0.11
381 0.13
382 0.14
383 0.15
384 0.16
385 0.18
386 0.23
387 0.2
388 0.22
389 0.2
390 0.2
391 0.23
392 0.3
393 0.38
394 0.4
395 0.44
396 0.5
397 0.56
398 0.64
399 0.7
400 0.73
401 0.73
402 0.77
403 0.81
404 0.83
405 0.78
406 0.74
407 0.67
408 0.63
409 0.55
410 0.46
411 0.39
412 0.3
413 0.3
414 0.24
415 0.21
416 0.15
417 0.14
418 0.12
419 0.14
420 0.13
421 0.12
422 0.15
423 0.19
424 0.29
425 0.39
426 0.5
427 0.55
428 0.66
429 0.77
430 0.83
431 0.89
432 0.89
433 0.9
434 0.91
435 0.92
436 0.92
437 0.93
438 0.92
439 0.85
440 0.76
441 0.72
442 0.69
443 0.69
444 0.69
445 0.7
446 0.71
447 0.79
448 0.86
449 0.89
450 0.88
451 0.87
452 0.87
453 0.87
454 0.86
455 0.85
456 0.82
457 0.79
458 0.77
459 0.74
460 0.71
461 0.68
462 0.64
463 0.6
464 0.54
465 0.48
466 0.44
467 0.39
468 0.32
469 0.25
470 0.2
471 0.16
472 0.16
473 0.16
474 0.16
475 0.14
476 0.14
477 0.12
478 0.12
479 0.11
480 0.11
481 0.12
482 0.13
483 0.16
484 0.15
485 0.19
486 0.21