Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JZI5

Protein Details
Accession B6JZI5    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MSSMRNAVQRRNHKERSQPYERKKFGLHydrophilic
34-62YLQRAQDYKTKQKKLKRLREKALERNPDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-26RKKFG
29-32EKKK
42-54KTKQKKLKRLREK
188-248YKKEKEKAAKELLLRKQRDEKLKLAEEKTQVHRLLQGKGGRRKVTTSSGKQVYKWRNERKK
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSMRNAVQRRNHKERSQPYERKKFGLLEKKKDYLQRAQDYKTKQKKLKRLREKALERNPDEFYYEMVNKKTKDGVPITEREDSTINMDAIKILKTQDAGWIRMHREIEQSKIEQLESQMHTVGALRMDGERRKHTLFVDTEDEARTFDPAEHFNTYEELLDRTENRLRADQLEEGNLAIDAFSRRLYKKEKEKAAKELLLRKQRDEKLKLAEEKTQVHRLLQGKGGRRKVTTSSGKQVYKWRNERKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.83
3 0.82
4 0.83
5 0.83
6 0.84
7 0.86
8 0.82
9 0.76
10 0.7
11 0.67
12 0.66
13 0.66
14 0.65
15 0.64
16 0.68
17 0.68
18 0.69
19 0.68
20 0.64
21 0.63
22 0.63
23 0.63
24 0.61
25 0.62
26 0.64
27 0.65
28 0.7
29 0.71
30 0.71
31 0.68
32 0.72
33 0.78
34 0.83
35 0.86
36 0.86
37 0.87
38 0.87
39 0.9
40 0.9
41 0.9
42 0.89
43 0.87
44 0.79
45 0.73
46 0.66
47 0.55
48 0.48
49 0.38
50 0.29
51 0.24
52 0.24
53 0.23
54 0.24
55 0.27
56 0.26
57 0.27
58 0.32
59 0.28
60 0.31
61 0.31
62 0.34
63 0.34
64 0.37
65 0.39
66 0.38
67 0.36
68 0.32
69 0.3
70 0.24
71 0.22
72 0.21
73 0.17
74 0.13
75 0.13
76 0.12
77 0.11
78 0.12
79 0.09
80 0.07
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.16
85 0.17
86 0.19
87 0.21
88 0.24
89 0.25
90 0.27
91 0.28
92 0.22
93 0.26
94 0.25
95 0.25
96 0.25
97 0.24
98 0.22
99 0.22
100 0.21
101 0.15
102 0.15
103 0.17
104 0.15
105 0.15
106 0.14
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.08
116 0.12
117 0.15
118 0.17
119 0.2
120 0.21
121 0.23
122 0.23
123 0.26
124 0.24
125 0.24
126 0.25
127 0.23
128 0.23
129 0.22
130 0.21
131 0.15
132 0.14
133 0.11
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.14
145 0.13
146 0.1
147 0.09
148 0.1
149 0.11
150 0.14
151 0.18
152 0.19
153 0.21
154 0.23
155 0.23
156 0.24
157 0.26
158 0.25
159 0.23
160 0.22
161 0.2
162 0.17
163 0.16
164 0.13
165 0.1
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.08
171 0.12
172 0.13
173 0.19
174 0.26
175 0.34
176 0.44
177 0.53
178 0.62
179 0.68
180 0.72
181 0.75
182 0.76
183 0.72
184 0.67
185 0.67
186 0.65
187 0.65
188 0.62
189 0.58
190 0.6
191 0.62
192 0.66
193 0.62
194 0.59
195 0.59
196 0.65
197 0.66
198 0.6
199 0.6
200 0.55
201 0.57
202 0.57
203 0.56
204 0.48
205 0.42
206 0.46
207 0.43
208 0.42
209 0.42
210 0.42
211 0.44
212 0.52
213 0.59
214 0.57
215 0.55
216 0.56
217 0.54
218 0.58
219 0.59
220 0.57
221 0.59
222 0.63
223 0.64
224 0.64
225 0.68
226 0.68
227 0.69
228 0.72