Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JY16

Protein Details
Accession B6JY16    Localization Confidence Low Confidence Score 6.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-57EIKGGAYKTKRSRPWKVACFVHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 8.5, cyto_nucl 7, mito 5, nucl 4.5, extr 4, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR027520  Slx1  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0030875  C:rDNA protrusion  
GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0008821  F:crossover junction DNA endonuclease activity  
GO:0106332  F:ds/ssDNA junction-specific dsDNA endonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006261  P:DNA-templated DNA replication  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
GO:0043007  P:maintenance of rDNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF01541  GIY-YIG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
CDD cd10455  GIY-YIG_SLX1  
Amino Acid Sequences MFYCCYLLVSEKAASRSVYIGSTPDPARRLRQHNGEIKGGAYKTKRSRPWKVACFVHGFPTKIAALQFEWVWQHPQSTRHDDLRQHSRVVSVKRQTLLSCVRALGVMLCCEAWSRWGLRVAIFDDAVHRLWLKERLPSNCIQLCSFDDVESLRLADYGGDAGWLDTQRKKRAQLSVQAQCSICVRAILLPCFFLCCPFPDCRMIAHSTCLAASFLQEAQDDEHILPISGTCARCKRLLSWKLLVQASLSPSDEDNGAVGDTGESDDNNERESS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.23
3 0.22
4 0.2
5 0.18
6 0.16
7 0.16
8 0.15
9 0.21
10 0.21
11 0.24
12 0.26
13 0.28
14 0.36
15 0.42
16 0.49
17 0.51
18 0.59
19 0.64
20 0.69
21 0.7
22 0.66
23 0.58
24 0.51
25 0.47
26 0.38
27 0.35
28 0.3
29 0.34
30 0.39
31 0.47
32 0.56
33 0.6
34 0.7
35 0.74
36 0.82
37 0.81
38 0.8
39 0.76
40 0.71
41 0.68
42 0.59
43 0.57
44 0.51
45 0.44
46 0.36
47 0.35
48 0.3
49 0.25
50 0.24
51 0.18
52 0.14
53 0.14
54 0.14
55 0.13
56 0.14
57 0.13
58 0.16
59 0.15
60 0.17
61 0.19
62 0.24
63 0.28
64 0.34
65 0.38
66 0.41
67 0.46
68 0.48
69 0.52
70 0.56
71 0.52
72 0.46
73 0.42
74 0.4
75 0.41
76 0.41
77 0.42
78 0.38
79 0.39
80 0.39
81 0.41
82 0.37
83 0.37
84 0.36
85 0.3
86 0.26
87 0.22
88 0.2
89 0.19
90 0.18
91 0.14
92 0.1
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.1
103 0.13
104 0.14
105 0.14
106 0.16
107 0.16
108 0.16
109 0.15
110 0.12
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.09
115 0.08
116 0.07
117 0.09
118 0.14
119 0.14
120 0.18
121 0.22
122 0.24
123 0.27
124 0.28
125 0.32
126 0.3
127 0.3
128 0.25
129 0.22
130 0.21
131 0.22
132 0.2
133 0.15
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.09
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.05
150 0.06
151 0.08
152 0.12
153 0.18
154 0.25
155 0.29
156 0.33
157 0.37
158 0.45
159 0.48
160 0.52
161 0.56
162 0.57
163 0.56
164 0.55
165 0.49
166 0.42
167 0.38
168 0.3
169 0.21
170 0.13
171 0.11
172 0.11
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.14
177 0.14
178 0.16
179 0.16
180 0.14
181 0.12
182 0.13
183 0.16
184 0.18
185 0.2
186 0.21
187 0.22
188 0.22
189 0.25
190 0.27
191 0.24
192 0.25
193 0.23
194 0.2
195 0.19
196 0.18
197 0.15
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.13
208 0.11
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.09
214 0.1
215 0.13
216 0.14
217 0.18
218 0.23
219 0.25
220 0.29
221 0.31
222 0.36
223 0.42
224 0.49
225 0.5
226 0.52
227 0.54
228 0.58
229 0.56
230 0.5
231 0.4
232 0.36
233 0.32
234 0.28
235 0.24
236 0.18
237 0.18
238 0.19
239 0.17
240 0.14
241 0.12
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.11
252 0.16
253 0.17