Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JXC1

Protein Details
Accession B6JXC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
550-576IRGTPSQKEIEKRRRKVAEKRRSAVGSHydrophilic
583-602ETPVRRTSSRFRRPNIISQIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
557-571KEIEKRRRKVAEKRR
Subcellular Location(s) nucl 8, cyto 6, mito_nucl 6, mito 4, plas 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
Gene Ontology GO:0005096  F:GTPase activator activity  
GO:0090630  P:activation of GTPase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00566  RabGAP-TBC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50086  TBC_RABGAP  
Amino Acid Sequences MSHLAARPPTFTFVEDDDKSTSSELDVLSSEGSKRIPTHQKTPSDIVLDQVLELYNRHDIENAAHDSLSVTSSGSDMDESMYSFPDVPPDMADATATERPPELPDVNTLPYNSLALHTKLPVTPVAHTAPATTPSTPVTPSPSHQPSVRTSTTSLHPPVVASRQHHLGLPTIPLNISDNKSLKDILPRSCLAVQKDEGPLTRTALNTAKDLTLPSDRDLYGFKKVTQFTTKEQYNAWFSTYRDFMARREHKWDSLLTESNIDISTWPVTQFPSRGHKVQRYVRKGIPPVYRGAAWFYYSGGHELLREHRGIYESLWKHACVHKPKDADLIERDLHRTFPENIYFRSTPESVAGEYSEAPMISKLRRVLMSFAMYSPENGYCQSLNFLAGLFLLFMSEEKAFWMLVVTCRKYLPRMHDANLEGANIDQSVLMAAVRDNLPAVWSRIGLSFDGVPMNDIIDKLPPITLVTAAWFMCAFVGVLPTETTLRLWDCFFYEGSKVLFLSALSIFRLGEAEIKSKSEQIDVFQVIQDLPKSILDANTFIALCFRRNIRGTPSQKEIEKRRRKVAEKRRSAVGSTSSDNPETPVRRTSSRFRRPNIISQIQSHLKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.33
4 0.31
5 0.3
6 0.3
7 0.27
8 0.23
9 0.16
10 0.17
11 0.14
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.14
17 0.14
18 0.13
19 0.14
20 0.16
21 0.17
22 0.26
23 0.36
24 0.4
25 0.49
26 0.56
27 0.62
28 0.65
29 0.69
30 0.64
31 0.58
32 0.52
33 0.45
34 0.39
35 0.32
36 0.25
37 0.21
38 0.17
39 0.12
40 0.12
41 0.13
42 0.15
43 0.15
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.19
48 0.25
49 0.27
50 0.23
51 0.21
52 0.21
53 0.21
54 0.21
55 0.18
56 0.11
57 0.08
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.13
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.15
77 0.15
78 0.14
79 0.14
80 0.11
81 0.14
82 0.17
83 0.17
84 0.15
85 0.15
86 0.16
87 0.18
88 0.23
89 0.2
90 0.17
91 0.21
92 0.24
93 0.26
94 0.27
95 0.25
96 0.21
97 0.2
98 0.2
99 0.16
100 0.14
101 0.15
102 0.15
103 0.17
104 0.16
105 0.18
106 0.18
107 0.19
108 0.21
109 0.19
110 0.19
111 0.21
112 0.22
113 0.22
114 0.21
115 0.21
116 0.19
117 0.21
118 0.21
119 0.18
120 0.17
121 0.17
122 0.18
123 0.18
124 0.18
125 0.2
126 0.2
127 0.22
128 0.3
129 0.32
130 0.33
131 0.34
132 0.37
133 0.36
134 0.41
135 0.41
136 0.34
137 0.32
138 0.33
139 0.34
140 0.37
141 0.34
142 0.27
143 0.26
144 0.24
145 0.25
146 0.27
147 0.28
148 0.24
149 0.26
150 0.28
151 0.29
152 0.29
153 0.27
154 0.24
155 0.21
156 0.21
157 0.19
158 0.16
159 0.15
160 0.14
161 0.16
162 0.17
163 0.18
164 0.21
165 0.21
166 0.22
167 0.23
168 0.24
169 0.23
170 0.28
171 0.31
172 0.3
173 0.32
174 0.32
175 0.34
176 0.37
177 0.39
178 0.32
179 0.32
180 0.28
181 0.27
182 0.29
183 0.27
184 0.25
185 0.23
186 0.22
187 0.19
188 0.21
189 0.17
190 0.18
191 0.21
192 0.21
193 0.19
194 0.2
195 0.18
196 0.16
197 0.17
198 0.16
199 0.16
200 0.16
201 0.17
202 0.18
203 0.18
204 0.18
205 0.2
206 0.2
207 0.23
208 0.23
209 0.23
210 0.26
211 0.27
212 0.31
213 0.34
214 0.35
215 0.32
216 0.39
217 0.39
218 0.34
219 0.34
220 0.33
221 0.31
222 0.29
223 0.27
224 0.21
225 0.2
226 0.22
227 0.22
228 0.19
229 0.18
230 0.18
231 0.18
232 0.27
233 0.31
234 0.3
235 0.36
236 0.38
237 0.36
238 0.37
239 0.36
240 0.29
241 0.28
242 0.28
243 0.21
244 0.21
245 0.19
246 0.18
247 0.17
248 0.13
249 0.09
250 0.07
251 0.08
252 0.07
253 0.08
254 0.07
255 0.08
256 0.1
257 0.11
258 0.14
259 0.21
260 0.23
261 0.28
262 0.32
263 0.36
264 0.43
265 0.49
266 0.55
267 0.54
268 0.57
269 0.56
270 0.57
271 0.55
272 0.55
273 0.52
274 0.44
275 0.4
276 0.36
277 0.32
278 0.26
279 0.26
280 0.19
281 0.14
282 0.12
283 0.11
284 0.1
285 0.1
286 0.11
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.08
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.11
295 0.11
296 0.13
297 0.12
298 0.12
299 0.18
300 0.17
301 0.2
302 0.21
303 0.2
304 0.21
305 0.26
306 0.32
307 0.31
308 0.35
309 0.38
310 0.39
311 0.4
312 0.45
313 0.41
314 0.37
315 0.31
316 0.3
317 0.26
318 0.25
319 0.26
320 0.2
321 0.19
322 0.16
323 0.18
324 0.16
325 0.17
326 0.23
327 0.23
328 0.23
329 0.29
330 0.29
331 0.26
332 0.28
333 0.25
334 0.2
335 0.19
336 0.19
337 0.13
338 0.13
339 0.13
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.11
350 0.12
351 0.14
352 0.16
353 0.17
354 0.18
355 0.2
356 0.22
357 0.19
358 0.18
359 0.18
360 0.16
361 0.16
362 0.15
363 0.12
364 0.1
365 0.1
366 0.11
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.08
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.04
378 0.04
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.08
390 0.07
391 0.12
392 0.19
393 0.2
394 0.2
395 0.22
396 0.23
397 0.25
398 0.29
399 0.31
400 0.34
401 0.37
402 0.38
403 0.43
404 0.43
405 0.43
406 0.39
407 0.31
408 0.22
409 0.18
410 0.16
411 0.1
412 0.09
413 0.05
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.06
421 0.06
422 0.07
423 0.07
424 0.06
425 0.08
426 0.09
427 0.11
428 0.1
429 0.1
430 0.11
431 0.13
432 0.14
433 0.13
434 0.13
435 0.11
436 0.11
437 0.12
438 0.11
439 0.09
440 0.08
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.08
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.08
454 0.09
455 0.11
456 0.11
457 0.11
458 0.1
459 0.09
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.04
464 0.06
465 0.06
466 0.07
467 0.07
468 0.08
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.1
473 0.11
474 0.12
475 0.13
476 0.13
477 0.14
478 0.15
479 0.15
480 0.15
481 0.15
482 0.16
483 0.16
484 0.16
485 0.14
486 0.13
487 0.13
488 0.1
489 0.12
490 0.11
491 0.11
492 0.1
493 0.11
494 0.11
495 0.1
496 0.11
497 0.09
498 0.12
499 0.13
500 0.17
501 0.17
502 0.2
503 0.21
504 0.23
505 0.24
506 0.23
507 0.22
508 0.21
509 0.27
510 0.26
511 0.26
512 0.24
513 0.24
514 0.2
515 0.21
516 0.19
517 0.13
518 0.12
519 0.12
520 0.13
521 0.13
522 0.16
523 0.16
524 0.17
525 0.17
526 0.19
527 0.18
528 0.17
529 0.2
530 0.18
531 0.18
532 0.21
533 0.22
534 0.27
535 0.3
536 0.34
537 0.37
538 0.46
539 0.52
540 0.54
541 0.58
542 0.57
543 0.6
544 0.65
545 0.68
546 0.69
547 0.73
548 0.74
549 0.77
550 0.81
551 0.85
552 0.87
553 0.87
554 0.87
555 0.87
556 0.84
557 0.82
558 0.75
559 0.68
560 0.63
561 0.58
562 0.52
563 0.45
564 0.46
565 0.41
566 0.39
567 0.37
568 0.34
569 0.36
570 0.34
571 0.34
572 0.36
573 0.37
574 0.41
575 0.47
576 0.55
577 0.58
578 0.65
579 0.71
580 0.7
581 0.76
582 0.76
583 0.8
584 0.8
585 0.77
586 0.71
587 0.66
588 0.69