FuNGI

A0A2H3CWJ3

Protein Details

Accession

A0A2H3CWJ3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
244-267	NPDFVPKDLKKRKRDPPLPPSRLF	Hydrophilic
687-709	LHEGRLQLRKKNQRSRVTIDPSR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
253-257	KKRKR

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 12.333, cyto 8, cyto_pero 4.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN

Amino Acid Sequences

MSIARSTLTDFDPKALSEYNRFLVIDGDDSSTDEDVSIPIHKNSQNHSLDAVKNRSLSHRTETCGVHRDIYHPDHEQWLQEMLDLSKMLRPASRMPFRTMTKFAGLMPEDWTLWKVKCKLGEEEFVVVSLLASVTSEHQVRSAFVPVVGRRWVYLETTKPAALQTLLKSTLGVIQVPDSGALKLLPVPREEWLAMLSSNRKVIERKVGTWVCIRTGKMKGAVGVVSGRYTWGVSVLLIPRIHDNPDFVPKDLKKRKRDPPLPPSRLFDVAHVKAKYGDSSVKRHQRCPHLFYFFGGWYHYDLCIVDRPLTGVGLAGDIPLEVAGLFLQSQHPLLKEAVYFMPRPAEWHFHVADYVFVTSISKDGTIWELTPNTIEVEYADGTGLHTVSYQDVHKIFKIGDFVEVQKEKVGWVQYMDSREPAVEILEQIYDINTGLKANLFSAHANSLRKIRSPTFHPQPTIGSDAKFSFDVCSGIVPWKGVPVTARRSDCGPAKNGIISDVLRGQPTASGLKLLVRLEPETNGQSLTEIICDYDDVTELVSSLPLLAYLPLRYSQRAFLPLRSYHDLCLAPYTTPLQLILKAWDGAYPAVPDEENTCHKKETDWAAPECTINFFPGCNSHSTLVTPPSPTVKPNDPVSPFHLSPSPSIAANDAAHWSLNCKLKGLGIRVYLDNIRGKNKDVVVTLELHEGRLQLRKKNQRSRVTIDPSRISPIHPRTRDYGRWVVIQGEHGGKHVRAIQFKRLSKEKLEWELFVVVPRNKEIDMVTGEEIYVSHDSLCLAPESVESKQLNKSLAQRRKGSRDV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.28
3	0.29
4	0.29
5	0.33
6	0.33
7	0.34
8	0.33
9	0.3
10	0.27
11	0.25
12	0.22
13	0.18
14	0.18
15	0.16
16	0.17
17	0.18
18	0.16
19	0.14
20	0.12
21	0.1
22	0.09
23	0.1
24	0.13
25	0.14
26	0.15
27	0.22
28	0.25
29	0.3
30	0.35
31	0.43
32	0.42
33	0.41
34	0.43
35	0.43
36	0.45
37	0.49
38	0.5
39	0.43
40	0.42
41	0.43
42	0.46
43	0.45
44	0.43
45	0.43
46	0.42
47	0.43
48	0.47
49	0.49
50	0.48
51	0.51
52	0.48
53	0.43
54	0.4
55	0.39
56	0.4
57	0.41
58	0.39
59	0.36
60	0.36
61	0.37
62	0.38
63	0.36
64	0.3
65	0.29
66	0.24
67	0.21
68	0.21
69	0.16
70	0.17
71	0.16
72	0.14
73	0.14
74	0.15
75	0.15
76	0.16
77	0.18
78	0.24
79	0.34
80	0.43
81	0.43
82	0.48
83	0.55
84	0.58
85	0.61
86	0.57
87	0.51
88	0.45
89	0.43
90	0.37
91	0.37
92	0.33
93	0.28
94	0.26
95	0.24
96	0.21
97	0.21
98	0.22
99	0.18
100	0.18
101	0.25
102	0.25
103	0.28
104	0.34
105	0.37
106	0.44
107	0.45
108	0.48
109	0.44
110	0.43
111	0.39
112	0.33
113	0.29
114	0.21
115	0.16
116	0.1
117	0.07
118	0.04
119	0.04
120	0.05
121	0.06
122	0.1
123	0.11
124	0.11
125	0.13
126	0.14
127	0.15
128	0.17
129	0.18
130	0.16
131	0.16
132	0.22
133	0.21
134	0.24
135	0.25
136	0.24
137	0.2
138	0.22
139	0.22
140	0.2
141	0.25
142	0.25
143	0.27
144	0.3
145	0.29
146	0.28
147	0.26
148	0.24
149	0.2
150	0.19
151	0.18
152	0.2
153	0.21
154	0.2
155	0.2
156	0.19
157	0.21
158	0.18
159	0.16
160	0.12
161	0.12
162	0.12
163	0.12
164	0.13
165	0.1
166	0.09
167	0.09
168	0.08
169	0.07
170	0.11
171	0.15
172	0.16
173	0.16
174	0.17
175	0.18
176	0.22
177	0.21
178	0.18
179	0.14
180	0.14
181	0.13
182	0.15
183	0.17
184	0.16
185	0.19
186	0.19
187	0.2
188	0.21
189	0.25
190	0.33
191	0.33
192	0.33
193	0.4
194	0.41
195	0.41
196	0.44
197	0.41
198	0.35
199	0.35
200	0.34
201	0.29
202	0.32
203	0.33
204	0.31
205	0.31
206	0.28
207	0.26
208	0.25
209	0.2
210	0.18
211	0.15
212	0.12
213	0.11
214	0.1
215	0.08
216	0.08
217	0.07
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.09
222	0.11
223	0.15
224	0.15
225	0.16
226	0.18
227	0.19
228	0.21
229	0.18
230	0.19
231	0.17
232	0.26
233	0.27
234	0.25
235	0.32
236	0.32
237	0.43
238	0.51
239	0.57
240	0.58
241	0.66
242	0.75
243	0.78
244	0.85
245	0.84
246	0.85
247	0.87
248	0.85
249	0.79
250	0.73
251	0.65
252	0.6
253	0.5
254	0.43
255	0.4
256	0.36
257	0.4
258	0.36
259	0.33
260	0.31
261	0.31
262	0.27
263	0.21
264	0.24
265	0.21
266	0.28
267	0.37
268	0.44
269	0.46
270	0.53
271	0.57
272	0.61
273	0.64
274	0.64
275	0.62
276	0.58
277	0.55
278	0.5
279	0.46
280	0.36
281	0.3
282	0.24
283	0.17
284	0.14
285	0.14
286	0.13
287	0.1
288	0.09
289	0.1
290	0.13
291	0.13
292	0.13
293	0.12
294	0.13
295	0.12
296	0.12
297	0.11
298	0.07
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.04
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.02
309	0.02
310	0.02
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.04
315	0.05
316	0.06
317	0.07
318	0.07
319	0.09
320	0.1
321	0.1
322	0.1
323	0.11
324	0.12
325	0.14
326	0.14
327	0.12
328	0.14
329	0.13
330	0.16
331	0.16
332	0.19
333	0.18
334	0.22
335	0.22
336	0.2
337	0.2
338	0.17
339	0.16
340	0.12
341	0.1
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.05
346	0.06
347	0.05
348	0.05
349	0.04
350	0.05
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.09
355	0.09
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.08
360	0.07
361	0.07
362	0.05
363	0.06
364	0.07
365	0.06
366	0.06
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.06
376	0.06
377	0.08
378	0.1
379	0.11
380	0.11
381	0.12
382	0.11
383	0.11
384	0.13
385	0.1
386	0.11
387	0.11
388	0.12
389	0.16
390	0.16
391	0.15
392	0.14
393	0.14
394	0.12
395	0.14
396	0.14
397	0.09
398	0.09
399	0.11
400	0.13
401	0.16
402	0.16
403	0.14
404	0.13
405	0.13
406	0.12
407	0.1
408	0.08
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.04
420	0.04
421	0.04
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.06
426	0.07
427	0.07
428	0.08
429	0.11
430	0.14
431	0.14
432	0.15
433	0.19
434	0.19
435	0.21
436	0.24
437	0.24
438	0.25
439	0.3
440	0.38
441	0.42
442	0.45
443	0.44
444	0.41
445	0.4
446	0.39
447	0.37
448	0.29
449	0.21
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.16
454	0.14
455	0.1
456	0.1
457	0.1
458	0.08
459	0.08
460	0.07
461	0.1
462	0.1
463	0.09
464	0.08
465	0.1
466	0.09
467	0.09
468	0.11
469	0.14
470	0.2
471	0.26
472	0.27
473	0.26
474	0.28
475	0.32
476	0.35
477	0.33
478	0.3
479	0.25
480	0.25
481	0.26
482	0.23
483	0.21
484	0.17
485	0.14
486	0.13
487	0.14
488	0.13
489	0.12
490	0.12
491	0.11
492	0.1
493	0.12
494	0.12
495	0.09
496	0.09
497	0.09
498	0.11
499	0.13
500	0.13
501	0.13
502	0.13
503	0.14
504	0.14
505	0.15
506	0.16
507	0.14
508	0.14
509	0.13
510	0.12
511	0.1
512	0.1
513	0.09
514	0.07
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.05
521	0.06
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.04
529	0.04
530	0.04
531	0.03
532	0.04
533	0.04
534	0.05
535	0.06
536	0.07
537	0.1
538	0.12
539	0.13
540	0.15
541	0.17
542	0.18
543	0.26
544	0.26
545	0.27
546	0.32
547	0.33
548	0.38
549	0.41
550	0.39
551	0.33
552	0.36
553	0.33
554	0.27
555	0.28
556	0.22
557	0.16
558	0.17
559	0.18
560	0.13
561	0.13
562	0.14
563	0.11
564	0.12
565	0.12
566	0.13
567	0.13
568	0.13
569	0.13
570	0.13
571	0.13
572	0.12
573	0.12
574	0.1
575	0.09
576	0.09
577	0.09
578	0.09
579	0.1
580	0.14
581	0.19
582	0.22
583	0.24
584	0.24
585	0.25
586	0.25
587	0.29
588	0.33
589	0.35
590	0.38
591	0.38
592	0.4
593	0.41
594	0.4
595	0.34
596	0.3
597	0.21
598	0.17
599	0.15
600	0.12
601	0.12
602	0.15
603	0.17
604	0.17
605	0.19
606	0.19
607	0.19
608	0.21
609	0.23
610	0.23
611	0.23
612	0.22
613	0.2
614	0.24
615	0.24
616	0.25
617	0.28
618	0.3
619	0.33
620	0.36
621	0.42
622	0.4
623	0.42
624	0.46
625	0.47
626	0.41
627	0.38
628	0.37
629	0.31
630	0.29
631	0.3
632	0.26
633	0.2
634	0.2
635	0.19
636	0.18
637	0.17
638	0.17
639	0.14
640	0.13
641	0.13
642	0.13
643	0.14
644	0.17
645	0.23
646	0.22
647	0.22
648	0.22
649	0.26
650	0.32
651	0.34
652	0.33
653	0.3
654	0.32
655	0.32
656	0.34
657	0.31
658	0.3
659	0.31
660	0.29
661	0.32
662	0.31
663	0.34
664	0.36
665	0.37
666	0.37
667	0.33
668	0.34
669	0.29
670	0.3
671	0.28
672	0.29
673	0.26
674	0.23
675	0.23
676	0.2
677	0.2
678	0.25
679	0.28
680	0.29
681	0.39
682	0.5
683	0.59
684	0.69
685	0.77
686	0.79
687	0.83
688	0.82
689	0.83
690	0.81
691	0.76
692	0.73
693	0.67
694	0.59
695	0.58
696	0.51
697	0.44
698	0.44
699	0.48
700	0.52
701	0.5
702	0.52
703	0.51
704	0.59
705	0.62
706	0.6
707	0.59
708	0.51
709	0.51
710	0.49
711	0.47
712	0.4
713	0.36
714	0.33
715	0.28
716	0.25
717	0.24
718	0.26
719	0.23
720	0.24
721	0.28
722	0.29
723	0.34
724	0.38
725	0.47
726	0.53
727	0.58
728	0.63
729	0.65
730	0.64
731	0.62
732	0.65
733	0.63
734	0.64
735	0.62
736	0.55
737	0.5
738	0.48
739	0.42
740	0.38
741	0.37
742	0.3
743	0.29
744	0.3
745	0.29
746	0.26
747	0.28
748	0.25
749	0.23
750	0.22
751	0.24
752	0.23
753	0.21
754	0.2
755	0.19
756	0.17
757	0.16
758	0.14
759	0.11
760	0.1
761	0.1
762	0.11
763	0.12
764	0.13
765	0.11
766	0.1
767	0.1
768	0.13
769	0.16
770	0.16
771	0.24
772	0.24
773	0.26
774	0.31
775	0.34
776	0.34
777	0.35
778	0.44
779	0.47
780	0.55
781	0.6
782	0.63
783	0.69

A0A2H3CWJ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer