Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JXN8

Protein Details
Accession B6JXN8    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-43MLRRKRDRRAAKKDSEMAVDVSLSRRRETPRSRKKEPPISVVIHydrophilic
110-137TGDTSSTARRNREKRKRKAAAHAKKADAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-13RRKRDRRAAKK
25-35RRRETPRSRKK
118-134RRNREKRKRKAAAHAKK
Subcellular Location(s) mito 14.5, mito_nucl 12.833, nucl 10, cyto_nucl 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001611  Leu-rich_rpt  
IPR032675  LRR_dom_sf  
IPR040736  Mex67_RRM  
IPR032710  NTF2-like_dom_sf  
IPR018222  Nuclear_transport_factor_2_euk  
IPR030217  NXF_fam  
IPR005637  TAP_C_dom  
IPR009060  UBA-like_sf  
Gene Ontology GO:0042272  C:nuclear RNA export factor complex  
GO:0140602  C:nucleolar ring  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF18444  RRM_9  
PF03943  TAP_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51450  LRR  
PS50177  NTF2_DOMAIN  
PS51281  TAP_C  
CDD cd14342  UBA_TAP-C  
Amino Acid Sequences MLRRKRDRRAAKKDSEMAVDVSLSRRRETPRSRKKEPPISVVITGHTKASEDDLINFVWRKAKVRLLNVTYSPASVTAVVKAVEFPRLNSLNGVAFAGDCLAIRRTDGGTGDTSSTARRNREKRKRKAAAHAKKADATLGLSSSANETIQNLKRFLEQRYNAEAKMLDLSAMHEDQFLRQMGILAEASTKSKMFPALMKVASMYFKDVQSVNLTKNNITSVTPITTLAQTWPKLLNLCLSDNNITTLADLDPWAGKSKLACLQELVLLGNPIVTVTFAGKPEAYMTEIVTRFPNLKMLDGAVVPPNLMAAKHQLAFPTHSGFFDSEETQKLVLSFLGAFFNGWDGDRKTTIQQMYSPTARFSVSVNSSVPRSSRQNASHANTEMGQRWSSYKRRSRNLMYVKSAPEQTLRLSQGQDDILKTVTALPETKHDMSDASQWLIESWNITLPSCGPAIKIIVHGRFEEPKNKHLARSFDRFLLILPGGPTGVQVINDMLVLRPYVGPGAWQNTLPQPTQPVVVQPAQPAPVAPVPVTASGTPVAPATPAQVLPVEQQQQMQLQIQRELVARVKAETGLNDVFAEMCCQQNNWDYNRAIAAFTELKQRGVIPPEAFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.74
3 0.65
4 0.55
5 0.46
6 0.37
7 0.28
8 0.25
9 0.27
10 0.24
11 0.24
12 0.28
13 0.33
14 0.43
15 0.53
16 0.59
17 0.65
18 0.73
19 0.79
20 0.84
21 0.88
22 0.89
23 0.85
24 0.81
25 0.78
26 0.74
27 0.7
28 0.6
29 0.53
30 0.47
31 0.4
32 0.33
33 0.25
34 0.21
35 0.17
36 0.2
37 0.21
38 0.18
39 0.19
40 0.2
41 0.2
42 0.23
43 0.23
44 0.21
45 0.22
46 0.23
47 0.26
48 0.3
49 0.38
50 0.41
51 0.49
52 0.57
53 0.56
54 0.6
55 0.56
56 0.56
57 0.48
58 0.41
59 0.34
60 0.24
61 0.2
62 0.16
63 0.15
64 0.12
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.15
69 0.15
70 0.21
71 0.2
72 0.2
73 0.26
74 0.28
75 0.28
76 0.27
77 0.27
78 0.22
79 0.22
80 0.21
81 0.13
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.07
86 0.06
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.11
92 0.11
93 0.13
94 0.14
95 0.15
96 0.15
97 0.17
98 0.18
99 0.16
100 0.16
101 0.16
102 0.21
103 0.24
104 0.3
105 0.38
106 0.47
107 0.57
108 0.68
109 0.77
110 0.82
111 0.88
112 0.91
113 0.89
114 0.9
115 0.9
116 0.9
117 0.9
118 0.86
119 0.78
120 0.71
121 0.63
122 0.53
123 0.42
124 0.33
125 0.23
126 0.16
127 0.14
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.1
133 0.09
134 0.1
135 0.17
136 0.23
137 0.26
138 0.26
139 0.26
140 0.32
141 0.35
142 0.38
143 0.4
144 0.37
145 0.4
146 0.47
147 0.49
148 0.43
149 0.41
150 0.37
151 0.27
152 0.26
153 0.2
154 0.12
155 0.09
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.15
164 0.14
165 0.11
166 0.1
167 0.12
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.1
179 0.11
180 0.11
181 0.14
182 0.17
183 0.22
184 0.22
185 0.22
186 0.21
187 0.21
188 0.21
189 0.19
190 0.18
191 0.14
192 0.14
193 0.16
194 0.15
195 0.15
196 0.19
197 0.21
198 0.2
199 0.23
200 0.24
201 0.22
202 0.23
203 0.23
204 0.18
205 0.17
206 0.16
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.13
215 0.16
216 0.15
217 0.16
218 0.17
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.18
223 0.16
224 0.18
225 0.18
226 0.19
227 0.19
228 0.18
229 0.19
230 0.16
231 0.13
232 0.11
233 0.1
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.09
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.12
245 0.17
246 0.18
247 0.18
248 0.16
249 0.17
250 0.17
251 0.18
252 0.14
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.04
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.05
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.07
272 0.08
273 0.13
274 0.13
275 0.14
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.17
281 0.12
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.11
287 0.12
288 0.09
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.07
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.12
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.14
306 0.13
307 0.14
308 0.13
309 0.14
310 0.13
311 0.14
312 0.12
313 0.13
314 0.13
315 0.12
316 0.12
317 0.11
318 0.09
319 0.07
320 0.07
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.05
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.13
336 0.18
337 0.19
338 0.18
339 0.19
340 0.21
341 0.25
342 0.26
343 0.25
344 0.21
345 0.21
346 0.2
347 0.18
348 0.14
349 0.16
350 0.15
351 0.17
352 0.17
353 0.17
354 0.17
355 0.18
356 0.18
357 0.16
358 0.19
359 0.2
360 0.27
361 0.29
362 0.35
363 0.41
364 0.44
365 0.45
366 0.41
367 0.39
368 0.33
369 0.32
370 0.28
371 0.23
372 0.2
373 0.15
374 0.18
375 0.23
376 0.29
377 0.37
378 0.42
379 0.49
380 0.56
381 0.63
382 0.66
383 0.7
384 0.73
385 0.7
386 0.68
387 0.64
388 0.59
389 0.54
390 0.49
391 0.39
392 0.31
393 0.26
394 0.22
395 0.23
396 0.22
397 0.22
398 0.21
399 0.21
400 0.21
401 0.22
402 0.21
403 0.16
404 0.14
405 0.13
406 0.12
407 0.12
408 0.11
409 0.1
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.14
414 0.2
415 0.2
416 0.19
417 0.19
418 0.18
419 0.19
420 0.24
421 0.21
422 0.16
423 0.16
424 0.15
425 0.16
426 0.16
427 0.14
428 0.09
429 0.08
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.11
435 0.12
436 0.12
437 0.12
438 0.09
439 0.1
440 0.11
441 0.12
442 0.16
443 0.2
444 0.22
445 0.23
446 0.25
447 0.26
448 0.31
449 0.33
450 0.38
451 0.36
452 0.37
453 0.45
454 0.45
455 0.47
456 0.46
457 0.51
458 0.48
459 0.54
460 0.52
461 0.45
462 0.44
463 0.39
464 0.35
465 0.3
466 0.24
467 0.17
468 0.15
469 0.13
470 0.12
471 0.12
472 0.11
473 0.09
474 0.09
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.09
480 0.09
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.08
488 0.07
489 0.09
490 0.12
491 0.16
492 0.17
493 0.17
494 0.19
495 0.24
496 0.27
497 0.26
498 0.24
499 0.23
500 0.23
501 0.25
502 0.23
503 0.21
504 0.23
505 0.25
506 0.26
507 0.25
508 0.26
509 0.26
510 0.25
511 0.22
512 0.21
513 0.2
514 0.19
515 0.17
516 0.16
517 0.17
518 0.18
519 0.2
520 0.16
521 0.15
522 0.14
523 0.15
524 0.13
525 0.11
526 0.1
527 0.09
528 0.09
529 0.1
530 0.12
531 0.11
532 0.12
533 0.13
534 0.14
535 0.16
536 0.22
537 0.24
538 0.22
539 0.24
540 0.25
541 0.26
542 0.28
543 0.31
544 0.29
545 0.28
546 0.3
547 0.3
548 0.3
549 0.29
550 0.3
551 0.28
552 0.28
553 0.26
554 0.24
555 0.24
556 0.24
557 0.25
558 0.22
559 0.24
560 0.2
561 0.2
562 0.19
563 0.18
564 0.16
565 0.14
566 0.16
567 0.12
568 0.14
569 0.14
570 0.14
571 0.17
572 0.25
573 0.31
574 0.32
575 0.38
576 0.36
577 0.38
578 0.41
579 0.38
580 0.3
581 0.25
582 0.26
583 0.22
584 0.22
585 0.31
586 0.28
587 0.28
588 0.29
589 0.3
590 0.3
591 0.32
592 0.37