Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JVB6

Protein Details
Accession B6JVB6    Localization Confidence High Confidence Score 25.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-33RDAPVQYKQSSRKSKRAWRKNIDLEDVEHydrophilic
63-88LGDERIAKKTKKKLKPLKIDEILNKRBasic
106-126GVLPSKRKKVMSKKELNRLKAHydrophilic
270-302VTLRDTPKRKTRAQRNKEKRRREQEREEQRLKQBasic
343-362VTELKVRKRRLGKHAIPEAPHydrophilic
398-430IPAAVPVSKRSRYKRKLKEKHSHKDLHKLKRTVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-79AKKTKKKLKPL
111-126KRKKVMSKKELNRLKA
276-292PKRKTRAQRNKEKRRRE
405-427SKRSRYKRKLKEKHSHKDLHKLK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011687  Nop53/GLTSCR2  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF07767  Nop53  
Amino Acid Sequences MGLKSRDAPVQYKQSSRKSKRAWRKNIDLEDVERGLEKVREEEVQGGIIAEKSNDALFVVDTLGDERIAKKTKKKLKPLKIDEILNKRSAIEAPVQHIKSGMVTNGVLPSKRKKVMSKKELNRLKALVRKGDGNLKASAALNDKNTNANHGLYDVWDDNVHPESIIPVKRPKTLDHEPVKLVENVEQAPAVVVADPGMSYNPDAQAWMSLLERKGQEEAAKEQMRLEREKQEARVRLIAASKQEDFRVDIPDEDASSESEQEEKQKTSEVTLRDTPKRKTRAQRNKEKRRREQEREEQRLKQMQELEKQIEKAPEMATEIANLEPSSSSETLELVQKTTTTVVTELKVRKRRLGKHAIPEAPLELKLGDELSGSLRQLKPEGNLFVDRFRSAQARGLIPAAVPVSKRSRYKRKLKEKHSHKDLHKLKRTVLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.73
3 0.77
4 0.79
5 0.79
6 0.85
7 0.87
8 0.9
9 0.91
10 0.89
11 0.92
12 0.91
13 0.89
14 0.85
15 0.78
16 0.7
17 0.65
18 0.55
19 0.45
20 0.35
21 0.28
22 0.23
23 0.22
24 0.19
25 0.16
26 0.17
27 0.18
28 0.19
29 0.22
30 0.2
31 0.19
32 0.17
33 0.15
34 0.13
35 0.13
36 0.12
37 0.09
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.16
55 0.24
56 0.28
57 0.36
58 0.45
59 0.56
60 0.65
61 0.75
62 0.79
63 0.82
64 0.89
65 0.89
66 0.9
67 0.85
68 0.83
69 0.8
70 0.79
71 0.72
72 0.63
73 0.54
74 0.43
75 0.38
76 0.32
77 0.26
78 0.23
79 0.21
80 0.24
81 0.32
82 0.32
83 0.3
84 0.3
85 0.28
86 0.24
87 0.22
88 0.18
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.16
93 0.17
94 0.17
95 0.19
96 0.25
97 0.31
98 0.36
99 0.4
100 0.45
101 0.55
102 0.65
103 0.72
104 0.76
105 0.77
106 0.82
107 0.85
108 0.79
109 0.73
110 0.65
111 0.6
112 0.56
113 0.51
114 0.46
115 0.4
116 0.39
117 0.37
118 0.42
119 0.39
120 0.35
121 0.32
122 0.26
123 0.26
124 0.24
125 0.24
126 0.19
127 0.18
128 0.18
129 0.19
130 0.2
131 0.22
132 0.22
133 0.24
134 0.22
135 0.2
136 0.17
137 0.16
138 0.15
139 0.11
140 0.14
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.13
152 0.15
153 0.16
154 0.21
155 0.24
156 0.29
157 0.31
158 0.32
159 0.35
160 0.41
161 0.48
162 0.47
163 0.48
164 0.45
165 0.45
166 0.44
167 0.36
168 0.3
169 0.23
170 0.19
171 0.15
172 0.15
173 0.13
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.06
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.08
197 0.08
198 0.11
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.12
203 0.14
204 0.14
205 0.16
206 0.21
207 0.22
208 0.21
209 0.23
210 0.25
211 0.26
212 0.27
213 0.27
214 0.25
215 0.28
216 0.31
217 0.34
218 0.38
219 0.4
220 0.39
221 0.39
222 0.33
223 0.31
224 0.3
225 0.27
226 0.23
227 0.22
228 0.2
229 0.18
230 0.18
231 0.17
232 0.17
233 0.17
234 0.18
235 0.15
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.12
241 0.11
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.13
249 0.16
250 0.15
251 0.15
252 0.18
253 0.18
254 0.2
255 0.24
256 0.22
257 0.24
258 0.29
259 0.35
260 0.39
261 0.45
262 0.48
263 0.52
264 0.57
265 0.6
266 0.64
267 0.7
268 0.73
269 0.78
270 0.84
271 0.86
272 0.91
273 0.93
274 0.93
275 0.93
276 0.92
277 0.93
278 0.91
279 0.9
280 0.89
281 0.91
282 0.9
283 0.85
284 0.77
285 0.73
286 0.7
287 0.6
288 0.54
289 0.5
290 0.45
291 0.45
292 0.46
293 0.45
294 0.4
295 0.41
296 0.39
297 0.34
298 0.29
299 0.26
300 0.21
301 0.18
302 0.17
303 0.17
304 0.14
305 0.12
306 0.13
307 0.11
308 0.11
309 0.1
310 0.08
311 0.07
312 0.08
313 0.12
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.13
319 0.18
320 0.18
321 0.14
322 0.14
323 0.13
324 0.14
325 0.15
326 0.14
327 0.1
328 0.12
329 0.13
330 0.14
331 0.21
332 0.27
333 0.36
334 0.43
335 0.45
336 0.52
337 0.59
338 0.66
339 0.69
340 0.74
341 0.72
342 0.74
343 0.81
344 0.76
345 0.69
346 0.61
347 0.54
348 0.44
349 0.36
350 0.27
351 0.17
352 0.13
353 0.12
354 0.11
355 0.09
356 0.07
357 0.07
358 0.1
359 0.12
360 0.12
361 0.18
362 0.19
363 0.2
364 0.23
365 0.25
366 0.25
367 0.29
368 0.32
369 0.3
370 0.34
371 0.34
372 0.36
373 0.36
374 0.34
375 0.28
376 0.28
377 0.28
378 0.24
379 0.3
380 0.29
381 0.29
382 0.29
383 0.3
384 0.27
385 0.23
386 0.24
387 0.19
388 0.17
389 0.15
390 0.19
391 0.26
392 0.32
393 0.41
394 0.48
395 0.58
396 0.66
397 0.77
398 0.82
399 0.87
400 0.9
401 0.93
402 0.94
403 0.94
404 0.95
405 0.94
406 0.93
407 0.87
408 0.88
409 0.86
410 0.86
411 0.85
412 0.79