Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6K4V1

Protein Details
Accession B6K4V1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
376-405QFDKKAAAAAKKRTRTPRKRATKKAKKEESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
379-404KKAAAAAKKRTRTPRKRATKKAKKEE
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001719  AP_endonuc_2  
IPR018246  AP_endonuc_F2_Zn_BS  
IPR036237  Xyl_isomerase-like_sf  
IPR013022  Xyl_isomerase-like_TIM-brl  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0017005  F:3'-tyrosyl-DNA phosphodiesterase activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003906  F:DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0008311  F:double-stranded DNA 3'-5' DNA exonuclease activity  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006284  P:base-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01261  AP_endonuc_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00729  AP_NUCLEASE_F2_1  
PS00730  AP_NUCLEASE_F2_2  
PS00731  AP_NUCLEASE_F2_3  
PS51432  AP_NUCLEASE_F2_4  
CDD cd00019  AP2Ec  
Amino Acid Sequences MTSTLKRKIDQETSPEGTDSTSHPKKGNENTTPEKRSSKRLAAARESKSKADKEEESTQKTVLEMSKFLGAHISAAGGVFNAVTNMLNINATCCAFFVKSQRKWVSPELTEDVAEKFRKACADAKFDAKKHALVHGSYLINMANADETKREQAFNCFLDDLKRCERLGVGLYNFHPGSYASCEKSQALKNLADCINRAHEATENVTIVTENMAGQGQCLGGVFDDFAELKSLIKDTSRWRVCLDTCHTFAAGFDIRTQETYEQVIQEFDEKVGVEFVGGWHLNDSKAPLGSNRDLHEHIGLGFLGLEPFRLIVNDPRWDGIPLVLETPAEKPEMWAKEIELLTAMIGKKADDPFVVEKNTELQARGASSRKSMQEQFDKKAAAAAKKRTRTPRKRATKKAKKEES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.51
3 0.42
4 0.35
5 0.3
6 0.27
7 0.29
8 0.3
9 0.32
10 0.36
11 0.4
12 0.48
13 0.56
14 0.62
15 0.6
16 0.63
17 0.69
18 0.75
19 0.75
20 0.72
21 0.71
22 0.64
23 0.66
24 0.66
25 0.64
26 0.63
27 0.65
28 0.69
29 0.69
30 0.75
31 0.73
32 0.74
33 0.69
34 0.66
35 0.66
36 0.61
37 0.56
38 0.53
39 0.51
40 0.48
41 0.55
42 0.57
43 0.57
44 0.55
45 0.5
46 0.44
47 0.39
48 0.35
49 0.3
50 0.24
51 0.19
52 0.19
53 0.23
54 0.22
55 0.22
56 0.21
57 0.17
58 0.15
59 0.14
60 0.13
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.05
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.1
83 0.13
84 0.22
85 0.3
86 0.35
87 0.45
88 0.5
89 0.5
90 0.55
91 0.6
92 0.57
93 0.49
94 0.49
95 0.44
96 0.4
97 0.37
98 0.33
99 0.28
100 0.25
101 0.24
102 0.19
103 0.16
104 0.16
105 0.17
106 0.19
107 0.23
108 0.24
109 0.31
110 0.32
111 0.4
112 0.45
113 0.44
114 0.47
115 0.43
116 0.4
117 0.34
118 0.37
119 0.31
120 0.25
121 0.27
122 0.26
123 0.25
124 0.22
125 0.21
126 0.16
127 0.13
128 0.13
129 0.1
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.09
135 0.12
136 0.13
137 0.15
138 0.14
139 0.19
140 0.23
141 0.23
142 0.23
143 0.2
144 0.19
145 0.23
146 0.24
147 0.24
148 0.24
149 0.26
150 0.24
151 0.24
152 0.24
153 0.21
154 0.22
155 0.21
156 0.17
157 0.17
158 0.18
159 0.21
160 0.2
161 0.18
162 0.15
163 0.12
164 0.13
165 0.15
166 0.18
167 0.16
168 0.17
169 0.18
170 0.19
171 0.24
172 0.26
173 0.24
174 0.25
175 0.25
176 0.24
177 0.29
178 0.3
179 0.25
180 0.22
181 0.2
182 0.19
183 0.18
184 0.17
185 0.13
186 0.12
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.08
195 0.07
196 0.06
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.11
222 0.14
223 0.25
224 0.27
225 0.27
226 0.28
227 0.32
228 0.32
229 0.36
230 0.37
231 0.32
232 0.31
233 0.31
234 0.29
235 0.25
236 0.24
237 0.22
238 0.18
239 0.13
240 0.12
241 0.13
242 0.14
243 0.14
244 0.16
245 0.12
246 0.11
247 0.13
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.12
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.09
268 0.1
269 0.11
270 0.11
271 0.13
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.18
277 0.22
278 0.25
279 0.25
280 0.28
281 0.28
282 0.29
283 0.27
284 0.22
285 0.18
286 0.15
287 0.13
288 0.09
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.07
299 0.14
300 0.19
301 0.23
302 0.24
303 0.25
304 0.26
305 0.26
306 0.25
307 0.2
308 0.18
309 0.14
310 0.15
311 0.14
312 0.13
313 0.13
314 0.14
315 0.14
316 0.12
317 0.11
318 0.12
319 0.19
320 0.22
321 0.23
322 0.22
323 0.21
324 0.27
325 0.27
326 0.25
327 0.19
328 0.16
329 0.14
330 0.18
331 0.17
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.16
336 0.18
337 0.19
338 0.15
339 0.2
340 0.24
341 0.29
342 0.3
343 0.25
344 0.24
345 0.26
346 0.3
347 0.26
348 0.22
349 0.19
350 0.19
351 0.22
352 0.26
353 0.27
354 0.25
355 0.28
356 0.34
357 0.37
358 0.41
359 0.44
360 0.48
361 0.54
362 0.59
363 0.61
364 0.6
365 0.57
366 0.5
367 0.5
368 0.47
369 0.45
370 0.47
371 0.52
372 0.56
373 0.62
374 0.71
375 0.76
376 0.82
377 0.84
378 0.87
379 0.87
380 0.88
381 0.92
382 0.95
383 0.95
384 0.95
385 0.96