Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JVP1

Protein Details
Accession B6JVP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-64STNWRKRKLSHWSTSRNQTLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:1990477  C:MTREC complex  
GO:0016604  C:nuclear body  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0033621  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, meiosis-specific transcripts  
Pfam View protein in Pfam  
PF14608  zf-CCCH_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MAGTNSEEQKLLEQIASLAGAINKYKYSQEQIHHQSAQKPDGANSTNWRKRKLSHWSTSRNQTLVNNPPPSPSIKGAAAKTQDDVSSMSEDATEASMFVARKDRHMQLIHKSIYEQDAQARQASMETARAKLNEKRKAVAEKKTQQKLTDPNNHLLTIQELPFIINDKDPKFIECMDTLAQLPKHIYHEGRAYVLMNRSMYKFVGTSPYSVYCRYYNMVGYCAKGGKCMYVHDPAHKYVCPRFLSGNCPNGEQCSLSHDRDEKRTPACRYFLKGKCTNPVCRYAHVHYNESVPVCPDFSEYGMCENGLHCKMKHILKCTEYALKGACHNAKCRLYHPPKELESTEKKEGAVSAEKMQGEQKQDSESSSTASGATPIFISL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.13
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.11
8 0.12
9 0.13
10 0.14
11 0.15
12 0.18
13 0.21
14 0.27
15 0.32
16 0.36
17 0.45
18 0.52
19 0.58
20 0.6
21 0.59
22 0.58
23 0.57
24 0.56
25 0.5
26 0.43
27 0.37
28 0.4
29 0.38
30 0.36
31 0.38
32 0.46
33 0.5
34 0.53
35 0.57
36 0.53
37 0.54
38 0.6
39 0.63
40 0.62
41 0.65
42 0.7
43 0.73
44 0.78
45 0.83
46 0.79
47 0.69
48 0.61
49 0.55
50 0.53
51 0.54
52 0.54
53 0.49
54 0.44
55 0.45
56 0.44
57 0.43
58 0.4
59 0.32
60 0.28
61 0.28
62 0.33
63 0.32
64 0.37
65 0.37
66 0.33
67 0.32
68 0.3
69 0.25
70 0.21
71 0.21
72 0.16
73 0.15
74 0.14
75 0.13
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.08
81 0.05
82 0.06
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.18
87 0.17
88 0.22
89 0.28
90 0.3
91 0.34
92 0.39
93 0.42
94 0.42
95 0.51
96 0.47
97 0.42
98 0.4
99 0.35
100 0.33
101 0.3
102 0.22
103 0.18
104 0.2
105 0.21
106 0.21
107 0.2
108 0.17
109 0.16
110 0.16
111 0.12
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.17
116 0.18
117 0.22
118 0.27
119 0.36
120 0.38
121 0.39
122 0.4
123 0.43
124 0.52
125 0.54
126 0.57
127 0.58
128 0.58
129 0.66
130 0.7
131 0.68
132 0.6
133 0.59
134 0.59
135 0.58
136 0.6
137 0.54
138 0.52
139 0.51
140 0.5
141 0.44
142 0.35
143 0.28
144 0.2
145 0.17
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.12
151 0.1
152 0.1
153 0.13
154 0.14
155 0.17
156 0.17
157 0.18
158 0.17
159 0.17
160 0.17
161 0.13
162 0.15
163 0.12
164 0.13
165 0.12
166 0.14
167 0.13
168 0.12
169 0.12
170 0.11
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.13
175 0.17
176 0.17
177 0.17
178 0.16
179 0.14
180 0.14
181 0.15
182 0.15
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.14
187 0.13
188 0.11
189 0.1
190 0.09
191 0.15
192 0.14
193 0.14
194 0.15
195 0.18
196 0.19
197 0.19
198 0.21
199 0.15
200 0.17
201 0.17
202 0.16
203 0.16
204 0.15
205 0.18
206 0.16
207 0.16
208 0.16
209 0.17
210 0.16
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.14
215 0.16
216 0.18
217 0.23
218 0.24
219 0.28
220 0.31
221 0.31
222 0.33
223 0.32
224 0.31
225 0.28
226 0.33
227 0.29
228 0.28
229 0.3
230 0.3
231 0.37
232 0.4
233 0.43
234 0.36
235 0.36
236 0.34
237 0.32
238 0.31
239 0.23
240 0.18
241 0.18
242 0.22
243 0.21
244 0.24
245 0.28
246 0.3
247 0.36
248 0.4
249 0.38
250 0.4
251 0.47
252 0.49
253 0.49
254 0.51
255 0.48
256 0.49
257 0.55
258 0.54
259 0.55
260 0.56
261 0.54
262 0.58
263 0.61
264 0.64
265 0.57
266 0.6
267 0.54
268 0.52
269 0.55
270 0.5
271 0.53
272 0.48
273 0.47
274 0.39
275 0.39
276 0.38
277 0.33
278 0.28
279 0.21
280 0.18
281 0.16
282 0.15
283 0.14
284 0.12
285 0.12
286 0.14
287 0.13
288 0.14
289 0.14
290 0.14
291 0.13
292 0.12
293 0.17
294 0.19
295 0.21
296 0.19
297 0.24
298 0.3
299 0.37
300 0.42
301 0.43
302 0.46
303 0.46
304 0.49
305 0.49
306 0.5
307 0.43
308 0.4
309 0.36
310 0.31
311 0.31
312 0.35
313 0.37
314 0.33
315 0.37
316 0.44
317 0.47
318 0.47
319 0.48
320 0.52
321 0.55
322 0.6
323 0.62
324 0.62
325 0.6
326 0.63
327 0.62
328 0.6
329 0.6
330 0.58
331 0.57
332 0.5
333 0.47
334 0.42
335 0.41
336 0.38
337 0.35
338 0.31
339 0.29
340 0.32
341 0.32
342 0.32
343 0.35
344 0.34
345 0.33
346 0.34
347 0.31
348 0.3
349 0.31
350 0.32
351 0.32
352 0.28
353 0.25
354 0.23
355 0.21
356 0.18
357 0.17
358 0.17
359 0.13
360 0.13