Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A397HNI7

Protein Details
Accession A0A397HNI7    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-250NNEARVFNPEKKKRKREGYEEGDYTHydrophilic
363-392LQRLQEKESSKRKKERRKENEKKRKEIVRLBasic
695-718MEAKGRKKMKAAQRLEKLRKKSALHydrophilic
733-758AISKLMSKAAKKKPKQQVKLVVAKGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-14HGKGRLDK
19-20AK
236-241KKKRKR
371-387SSKRKKERRKENEKKRK
486-487KK
673-716KAAAAAIKEKLRAINARPIKKVMEAKGRKKMKAAQRLEKLRKKS
738-794MSKAAKKKPKQQVKLVVAKGANRGISGRPRGVKGKYKIVDSRMKKDIRAQKRLAKKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MAIQKKHGKGRLDKWYRLAKEKGYRARAAFKLIQLNKKYGFLEKSKVLLDLCAAPGSWCQVAAECMPTQSIIVGVDLAPIKPIPRVITFQSDITTEKCRATIRQHLKHWKADTVLHDGAPNVGTAWVQDAFSQAELVLQSMKLATEFLVEGGTFVTKVFRSKDYNPLLWVFKQLFTSVEATKPPSSRNVSAEIFVVCRGFKAPKRIDPKFLDPKHVFAELTDATPNNEARVFNPEKKKRKREGYEEGDYTQFKEIPVTEFINTTDPIAILGTYNKLSFQQSPGGDLALATLNRLEETTDEIRTCCEDLKILGKKEFRNLLRWRLKIREKFGLVVKKGQSKTDEPEEVAEIAPMDEELAIQEELQRLQEKESSKRKKERRKENEKKRKEIVRLQMHMTTPMDIGMEQLGPGGDDATFSLKRVERDGARDVIASGKVAENESDSEDDQTESDMDESDEEGDQLERELDSLYEQYQERREDRDSKVRAKKARKDYEADEWDGFSDSGKEDDEESEEEGESQAVVKPAAPNSGTLSNKAAMFFDQDIFQDLGDLDDVEDEDSAIEMQEDDKSAKKDSGSEKQAPKDAKKKAQVTEDFSDSEPEELDDPRKKNGQLDIDIITAEAMALAQQMATGEKKSQDIVDDGFNRYTFRDVDGLPEWFLDDENKHSKLQRPITKAAAAAIKEKLRAINARPIKKVMEAKGRKKMKAAQRLEKLRKKSALLADDEALSERDKSQAISKLMSKAAKKKPKQQVKLVVAKGANRGISGRPRGVKGKYKIVDSRMKKDIRAQKRLAKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.77
3 0.74
4 0.73
5 0.7
6 0.68
7 0.69
8 0.73
9 0.75
10 0.72
11 0.73
12 0.69
13 0.72
14 0.65
15 0.63
16 0.58
17 0.54
18 0.57
19 0.57
20 0.62
21 0.57
22 0.6
23 0.55
24 0.54
25 0.51
26 0.47
27 0.47
28 0.42
29 0.46
30 0.43
31 0.44
32 0.41
33 0.42
34 0.35
35 0.29
36 0.26
37 0.23
38 0.21
39 0.18
40 0.16
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.16
45 0.13
46 0.12
47 0.12
48 0.15
49 0.15
50 0.18
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.15
55 0.14
56 0.12
57 0.11
58 0.08
59 0.07
60 0.08
61 0.07
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.16
70 0.16
71 0.19
72 0.23
73 0.26
74 0.33
75 0.34
76 0.34
77 0.33
78 0.3
79 0.29
80 0.27
81 0.29
82 0.23
83 0.22
84 0.24
85 0.25
86 0.28
87 0.34
88 0.42
89 0.48
90 0.55
91 0.64
92 0.72
93 0.76
94 0.79
95 0.75
96 0.69
97 0.61
98 0.57
99 0.51
100 0.48
101 0.44
102 0.36
103 0.33
104 0.28
105 0.27
106 0.22
107 0.18
108 0.1
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.08
143 0.08
144 0.12
145 0.15
146 0.19
147 0.26
148 0.3
149 0.4
150 0.44
151 0.45
152 0.45
153 0.45
154 0.44
155 0.38
156 0.4
157 0.32
158 0.27
159 0.26
160 0.24
161 0.21
162 0.19
163 0.22
164 0.18
165 0.19
166 0.18
167 0.22
168 0.25
169 0.26
170 0.25
171 0.29
172 0.34
173 0.35
174 0.36
175 0.38
176 0.35
177 0.35
178 0.34
179 0.28
180 0.22
181 0.19
182 0.17
183 0.11
184 0.1
185 0.11
186 0.16
187 0.19
188 0.29
189 0.34
190 0.42
191 0.51
192 0.55
193 0.61
194 0.61
195 0.66
196 0.67
197 0.63
198 0.64
199 0.56
200 0.56
201 0.51
202 0.46
203 0.36
204 0.25
205 0.29
206 0.2
207 0.2
208 0.18
209 0.15
210 0.14
211 0.17
212 0.17
213 0.13
214 0.15
215 0.14
216 0.13
217 0.22
218 0.26
219 0.31
220 0.42
221 0.5
222 0.59
223 0.69
224 0.78
225 0.79
226 0.85
227 0.86
228 0.85
229 0.86
230 0.83
231 0.8
232 0.72
233 0.65
234 0.57
235 0.48
236 0.4
237 0.31
238 0.24
239 0.16
240 0.15
241 0.14
242 0.14
243 0.17
244 0.17
245 0.16
246 0.16
247 0.17
248 0.18
249 0.17
250 0.15
251 0.12
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.06
257 0.06
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.1
263 0.12
264 0.13
265 0.14
266 0.19
267 0.18
268 0.21
269 0.21
270 0.19
271 0.17
272 0.15
273 0.14
274 0.1
275 0.1
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.07
282 0.05
283 0.11
284 0.13
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.16
290 0.16
291 0.11
292 0.1
293 0.09
294 0.1
295 0.18
296 0.23
297 0.24
298 0.28
299 0.32
300 0.33
301 0.38
302 0.44
303 0.38
304 0.41
305 0.43
306 0.49
307 0.52
308 0.54
309 0.53
310 0.54
311 0.61
312 0.59
313 0.6
314 0.57
315 0.5
316 0.5
317 0.52
318 0.51
319 0.44
320 0.43
321 0.41
322 0.41
323 0.41
324 0.4
325 0.37
326 0.32
327 0.35
328 0.35
329 0.33
330 0.26
331 0.26
332 0.25
333 0.22
334 0.19
335 0.14
336 0.08
337 0.07
338 0.06
339 0.05
340 0.04
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.1
352 0.09
353 0.1
354 0.14
355 0.16
356 0.24
357 0.34
358 0.43
359 0.49
360 0.58
361 0.67
362 0.73
363 0.81
364 0.84
365 0.84
366 0.86
367 0.9
368 0.92
369 0.94
370 0.91
371 0.88
372 0.84
373 0.8
374 0.75
375 0.72
376 0.7
377 0.68
378 0.62
379 0.58
380 0.54
381 0.46
382 0.42
383 0.34
384 0.25
385 0.15
386 0.13
387 0.11
388 0.07
389 0.07
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.11
405 0.13
406 0.14
407 0.16
408 0.2
409 0.18
410 0.22
411 0.25
412 0.23
413 0.21
414 0.21
415 0.19
416 0.17
417 0.15
418 0.11
419 0.09
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.07
435 0.06
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.04
450 0.04
451 0.05
452 0.04
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.09
457 0.09
458 0.11
459 0.16
460 0.19
461 0.2
462 0.23
463 0.27
464 0.31
465 0.36
466 0.43
467 0.44
468 0.51
469 0.58
470 0.61
471 0.65
472 0.68
473 0.72
474 0.74
475 0.78
476 0.72
477 0.68
478 0.65
479 0.67
480 0.61
481 0.55
482 0.44
483 0.34
484 0.31
485 0.27
486 0.23
487 0.13
488 0.1
489 0.07
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.07
494 0.08
495 0.1
496 0.1
497 0.11
498 0.11
499 0.1
500 0.1
501 0.09
502 0.08
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.07
509 0.09
510 0.1
511 0.13
512 0.13
513 0.12
514 0.15
515 0.22
516 0.22
517 0.21
518 0.23
519 0.22
520 0.22
521 0.22
522 0.19
523 0.12
524 0.14
525 0.14
526 0.13
527 0.12
528 0.11
529 0.14
530 0.13
531 0.13
532 0.1
533 0.09
534 0.09
535 0.08
536 0.08
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.03
549 0.04
550 0.05
551 0.06
552 0.07
553 0.11
554 0.13
555 0.15
556 0.16
557 0.16
558 0.22
559 0.28
560 0.36
561 0.4
562 0.46
563 0.51
564 0.53
565 0.58
566 0.57
567 0.57
568 0.57
569 0.58
570 0.58
571 0.61
572 0.64
573 0.64
574 0.68
575 0.67
576 0.65
577 0.6
578 0.54
579 0.47
580 0.41
581 0.38
582 0.28
583 0.23
584 0.16
585 0.13
586 0.12
587 0.11
588 0.17
589 0.22
590 0.23
591 0.27
592 0.32
593 0.32
594 0.35
595 0.41
596 0.42
597 0.38
598 0.39
599 0.37
600 0.33
601 0.31
602 0.27
603 0.2
604 0.12
605 0.09
606 0.05
607 0.03
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.04
614 0.06
615 0.07
616 0.08
617 0.1
618 0.12
619 0.13
620 0.14
621 0.15
622 0.15
623 0.16
624 0.17
625 0.22
626 0.23
627 0.25
628 0.26
629 0.25
630 0.24
631 0.23
632 0.24
633 0.17
634 0.17
635 0.17
636 0.16
637 0.21
638 0.23
639 0.24
640 0.21
641 0.2
642 0.19
643 0.15
644 0.16
645 0.13
646 0.12
647 0.17
648 0.23
649 0.25
650 0.27
651 0.3
652 0.37
653 0.44
654 0.53
655 0.55
656 0.56
657 0.59
658 0.62
659 0.6
660 0.53
661 0.47
662 0.42
663 0.35
664 0.31
665 0.31
666 0.29
667 0.27
668 0.29
669 0.27
670 0.27
671 0.31
672 0.32
673 0.37
674 0.43
675 0.49
676 0.51
677 0.52
678 0.49
679 0.51
680 0.54
681 0.52
682 0.54
683 0.57
684 0.63
685 0.7
686 0.76
687 0.71
688 0.7
689 0.7
690 0.7
691 0.7
692 0.71
693 0.71
694 0.74
695 0.83
696 0.87
697 0.87
698 0.84
699 0.82
700 0.78
701 0.71
702 0.69
703 0.66
704 0.61
705 0.58
706 0.54
707 0.47
708 0.41
709 0.38
710 0.31
711 0.24
712 0.19
713 0.15
714 0.12
715 0.13
716 0.13
717 0.15
718 0.2
719 0.27
720 0.29
721 0.32
722 0.35
723 0.38
724 0.43
725 0.47
726 0.47
727 0.5
728 0.58
729 0.64
730 0.68
731 0.73
732 0.79
733 0.84
734 0.87
735 0.87
736 0.87
737 0.86
738 0.88
739 0.8
740 0.76
741 0.68
742 0.62
743 0.57
744 0.5
745 0.41
746 0.32
747 0.32
748 0.31
749 0.37
750 0.4
751 0.42
752 0.43
753 0.47
754 0.54
755 0.6
756 0.63
757 0.61
758 0.65
759 0.62
760 0.65
761 0.67
762 0.68
763 0.7
764 0.67
765 0.69
766 0.67
767 0.66
768 0.61
769 0.64
770 0.67
771 0.67
772 0.7
773 0.7
774 0.7