Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HZB0

Protein Details
Accession A0A397HZB0    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
293-319ETDREHKSTKRRSPSPQKPPAKKSKGLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
299-337KSTKRRSPSPQKPPAKKSKGLGIIGGTKKIKQKSPTPPP
504-528DRKREELKRQLEAKSKAPVKKKRRF
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
Amino Acid Sequences MSRQDILNRADEDATTIDPSEDPDQFEVLLGKIGEALSSEPESTASLEHGLREDSMKLTVSTKLPAPLRPLIWTIYLSKEPQSSTSQHLVLPLLRAEAGWESRQRTLLDHLSKKDWVLGKLFDKIESMGMDLSTIFPGITGLRKAHGDTLLSQAAKYIKGVAPFDEPEWLDEVAKSSPDSVFAADILAEVSGSEETRGIDRLGPPPDRWWEKLAATRAITLAPPELEEATKTVEKKPTKNVSKMDTDTDTGNDDLNDDDEFERQETPPRLKKAKEPERQSPATTATTAGIDSETDREHKSTKRRSPSPQKPPAKKSKGLGIIGGTKKIKQKSPTPPPPSPPRDLASPTSKIQEDEATDSGSDHKARLSPPPPRASTTAKPSASATTAPKPRELGVIGGKKKEPPPQQQIPQPSLSPEAPPSTTNPLAAEPKLKQVGKLGMIGGKARKTSEVPPSASSQTRAETTTPPPPAKSEGDEEVSQQGAVKRSPSPVKPPQQETEQERADRKREELKRQLEAKSKAPVKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.16
3 0.15
4 0.14
5 0.13
6 0.17
7 0.19
8 0.19
9 0.2
10 0.2
11 0.2
12 0.2
13 0.2
14 0.18
15 0.14
16 0.15
17 0.12
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.1
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.12
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.11
33 0.12
34 0.13
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.15
39 0.16
40 0.16
41 0.14
42 0.15
43 0.16
44 0.15
45 0.16
46 0.2
47 0.2
48 0.21
49 0.22
50 0.27
51 0.28
52 0.3
53 0.35
54 0.36
55 0.35
56 0.36
57 0.35
58 0.31
59 0.3
60 0.29
61 0.25
62 0.25
63 0.27
64 0.25
65 0.26
66 0.27
67 0.26
68 0.28
69 0.3
70 0.28
71 0.31
72 0.34
73 0.32
74 0.3
75 0.31
76 0.29
77 0.26
78 0.25
79 0.19
80 0.15
81 0.14
82 0.13
83 0.12
84 0.14
85 0.15
86 0.17
87 0.21
88 0.23
89 0.25
90 0.29
91 0.28
92 0.27
93 0.3
94 0.35
95 0.4
96 0.43
97 0.45
98 0.45
99 0.45
100 0.43
101 0.43
102 0.38
103 0.31
104 0.29
105 0.3
106 0.29
107 0.35
108 0.35
109 0.3
110 0.27
111 0.25
112 0.23
113 0.18
114 0.17
115 0.11
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.09
120 0.07
121 0.07
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.09
127 0.1
128 0.11
129 0.12
130 0.14
131 0.15
132 0.17
133 0.18
134 0.17
135 0.16
136 0.21
137 0.23
138 0.22
139 0.21
140 0.2
141 0.2
142 0.19
143 0.17
144 0.16
145 0.14
146 0.18
147 0.19
148 0.18
149 0.2
150 0.21
151 0.21
152 0.2
153 0.19
154 0.16
155 0.18
156 0.16
157 0.13
158 0.12
159 0.14
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.11
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.05
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.08
185 0.07
186 0.09
187 0.12
188 0.17
189 0.21
190 0.23
191 0.23
192 0.26
193 0.32
194 0.34
195 0.34
196 0.31
197 0.3
198 0.3
199 0.35
200 0.35
201 0.32
202 0.28
203 0.27
204 0.24
205 0.22
206 0.19
207 0.14
208 0.11
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.09
217 0.12
218 0.12
219 0.15
220 0.22
221 0.26
222 0.29
223 0.38
224 0.45
225 0.5
226 0.55
227 0.56
228 0.52
229 0.55
230 0.53
231 0.46
232 0.38
233 0.32
234 0.27
235 0.23
236 0.2
237 0.14
238 0.13
239 0.09
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.13
252 0.16
253 0.21
254 0.27
255 0.33
256 0.36
257 0.37
258 0.44
259 0.49
260 0.57
261 0.59
262 0.59
263 0.62
264 0.66
265 0.66
266 0.6
267 0.51
268 0.44
269 0.36
270 0.3
271 0.22
272 0.15
273 0.13
274 0.12
275 0.1
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.13
285 0.19
286 0.28
287 0.37
288 0.44
289 0.52
290 0.58
291 0.67
292 0.76
293 0.81
294 0.82
295 0.83
296 0.85
297 0.84
298 0.86
299 0.87
300 0.83
301 0.76
302 0.67
303 0.65
304 0.62
305 0.54
306 0.47
307 0.38
308 0.39
309 0.35
310 0.37
311 0.29
312 0.26
313 0.31
314 0.33
315 0.36
316 0.33
317 0.41
318 0.48
319 0.58
320 0.66
321 0.68
322 0.69
323 0.71
324 0.77
325 0.73
326 0.66
327 0.59
328 0.51
329 0.47
330 0.46
331 0.44
332 0.39
333 0.37
334 0.34
335 0.34
336 0.32
337 0.28
338 0.26
339 0.24
340 0.2
341 0.2
342 0.19
343 0.17
344 0.16
345 0.16
346 0.17
347 0.16
348 0.15
349 0.11
350 0.12
351 0.14
352 0.15
353 0.23
354 0.28
355 0.34
356 0.41
357 0.48
358 0.49
359 0.49
360 0.53
361 0.52
362 0.51
363 0.51
364 0.53
365 0.46
366 0.44
367 0.42
368 0.4
369 0.34
370 0.31
371 0.28
372 0.27
373 0.33
374 0.34
375 0.34
376 0.34
377 0.33
378 0.33
379 0.29
380 0.25
381 0.27
382 0.35
383 0.36
384 0.38
385 0.39
386 0.4
387 0.44
388 0.48
389 0.49
390 0.49
391 0.56
392 0.62
393 0.67
394 0.7
395 0.72
396 0.68
397 0.62
398 0.53
399 0.45
400 0.4
401 0.34
402 0.29
403 0.25
404 0.23
405 0.22
406 0.22
407 0.24
408 0.27
409 0.27
410 0.25
411 0.24
412 0.25
413 0.27
414 0.27
415 0.29
416 0.23
417 0.3
418 0.36
419 0.35
420 0.32
421 0.34
422 0.39
423 0.35
424 0.36
425 0.31
426 0.26
427 0.27
428 0.29
429 0.28
430 0.25
431 0.24
432 0.23
433 0.25
434 0.25
435 0.3
436 0.37
437 0.4
438 0.4
439 0.41
440 0.44
441 0.46
442 0.45
443 0.42
444 0.35
445 0.3
446 0.29
447 0.29
448 0.27
449 0.27
450 0.3
451 0.35
452 0.39
453 0.39
454 0.38
455 0.39
456 0.42
457 0.41
458 0.4
459 0.37
460 0.34
461 0.37
462 0.36
463 0.35
464 0.32
465 0.28
466 0.24
467 0.22
468 0.21
469 0.2
470 0.2
471 0.21
472 0.22
473 0.29
474 0.37
475 0.4
476 0.46
477 0.53
478 0.62
479 0.68
480 0.72
481 0.7
482 0.69
483 0.73
484 0.7
485 0.69
486 0.65
487 0.62
488 0.63
489 0.64
490 0.63
491 0.59
492 0.57
493 0.58
494 0.61
495 0.66
496 0.69
497 0.7
498 0.73
499 0.75
500 0.78
501 0.77
502 0.73
503 0.68
504 0.68
505 0.68
506 0.66
507 0.7
508 0.73