Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397H780

Protein Details
Accession A0A397H780    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-292GKSRRNTDGKKEKSRKKLGVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-298KSRRNTDGKKEKSRKKLGVGQRKHK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR018465  Scm3/HJURP  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF10384  Scm3  
Amino Acid Sequences MERPQKRPRLSLAGYGEDSDDIDLQEARAQNDLRLKSIFERIFEKYGKDFTDIGDEIDLQTGKIVVNNGHLQGMSGEDDTGEKDNKDGCLFKEDLPTSAIQISDATLGGSIHVSDTEAETGGDNAKDGEQLQRPLTSLQPLPALRLDRSYDEKQPPETADAGLNLDDDTKSVDSLLDCALIVPNESDEPDTRALPAGSEAFPAKANTTADTSNQSQQLRGDKADEPTESIWRVPEIKGEFSTPIFNRSRPKLPSTAVRSASPPEAGSLWTLPGKSRRNTDGKKEKSRKKLGVGQRKHKHQSSPVVHNWSFAETPDGSESDDPLQEDYQPSPTPKTAIHIRGKKHVQITPSRTNDERRPLLPQQNPDSQLAMNALRGATDTKIANGAASQPQPETIKIHADQCISVDTPISEAEQHADPVIAQASTSAGAKRTPMTPDEAKLIVRMRQIEGKKWKEVLEHFPQRKLISLIQWNQTHWTERHDKPPRLSNPWSKEEVDKLQSFKDQQGLTWPGIRAALPGRSHAEIEFALLRLWAELDDGSKYGFAKLVSEAKPTGNQAQIRRAVTLDYVSVTEPRAPLEEDDHEKEKENV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.49
3 0.42
4 0.32
5 0.29
6 0.21
7 0.16
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.14
13 0.16
14 0.15
15 0.2
16 0.2
17 0.24
18 0.31
19 0.32
20 0.31
21 0.3
22 0.31
23 0.3
24 0.39
25 0.37
26 0.32
27 0.35
28 0.37
29 0.42
30 0.41
31 0.41
32 0.35
33 0.38
34 0.37
35 0.36
36 0.32
37 0.26
38 0.33
39 0.29
40 0.27
41 0.23
42 0.21
43 0.18
44 0.21
45 0.2
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.1
50 0.12
51 0.13
52 0.11
53 0.16
54 0.2
55 0.2
56 0.2
57 0.2
58 0.18
59 0.17
60 0.17
61 0.13
62 0.11
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.14
68 0.14
69 0.12
70 0.14
71 0.17
72 0.19
73 0.22
74 0.22
75 0.21
76 0.25
77 0.28
78 0.28
79 0.35
80 0.33
81 0.32
82 0.31
83 0.29
84 0.25
85 0.24
86 0.21
87 0.12
88 0.12
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.15
116 0.17
117 0.21
118 0.22
119 0.23
120 0.23
121 0.24
122 0.25
123 0.24
124 0.2
125 0.19
126 0.24
127 0.23
128 0.24
129 0.26
130 0.27
131 0.23
132 0.25
133 0.26
134 0.24
135 0.31
136 0.32
137 0.37
138 0.4
139 0.43
140 0.42
141 0.42
142 0.4
143 0.36
144 0.33
145 0.26
146 0.21
147 0.19
148 0.17
149 0.14
150 0.13
151 0.1
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.14
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.12
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.14
195 0.14
196 0.15
197 0.19
198 0.2
199 0.21
200 0.25
201 0.24
202 0.23
203 0.25
204 0.3
205 0.28
206 0.26
207 0.26
208 0.23
209 0.26
210 0.27
211 0.24
212 0.21
213 0.2
214 0.21
215 0.19
216 0.16
217 0.14
218 0.13
219 0.14
220 0.12
221 0.16
222 0.16
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.18
227 0.17
228 0.22
229 0.18
230 0.22
231 0.22
232 0.24
233 0.28
234 0.31
235 0.38
236 0.36
237 0.39
238 0.37
239 0.38
240 0.43
241 0.45
242 0.48
243 0.43
244 0.41
245 0.38
246 0.36
247 0.35
248 0.27
249 0.19
250 0.13
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.17
260 0.22
261 0.23
262 0.27
263 0.32
264 0.41
265 0.44
266 0.53
267 0.56
268 0.59
269 0.68
270 0.74
271 0.76
272 0.77
273 0.82
274 0.77
275 0.72
276 0.72
277 0.71
278 0.72
279 0.72
280 0.73
281 0.71
282 0.74
283 0.74
284 0.68
285 0.62
286 0.57
287 0.59
288 0.55
289 0.56
290 0.52
291 0.54
292 0.51
293 0.48
294 0.42
295 0.34
296 0.28
297 0.2
298 0.18
299 0.11
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.14
318 0.15
319 0.16
320 0.15
321 0.18
322 0.22
323 0.29
324 0.37
325 0.4
326 0.42
327 0.49
328 0.52
329 0.52
330 0.5
331 0.44
332 0.41
333 0.44
334 0.49
335 0.5
336 0.5
337 0.49
338 0.46
339 0.49
340 0.5
341 0.49
342 0.44
343 0.36
344 0.4
345 0.43
346 0.49
347 0.49
348 0.49
349 0.47
350 0.49
351 0.51
352 0.45
353 0.4
354 0.31
355 0.28
356 0.23
357 0.18
358 0.12
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.07
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.09
372 0.11
373 0.12
374 0.13
375 0.14
376 0.12
377 0.15
378 0.16
379 0.17
380 0.17
381 0.15
382 0.19
383 0.2
384 0.22
385 0.23
386 0.23
387 0.22
388 0.2
389 0.21
390 0.16
391 0.14
392 0.12
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.07
398 0.07
399 0.09
400 0.1
401 0.1
402 0.09
403 0.09
404 0.08
405 0.08
406 0.09
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.08
416 0.1
417 0.12
418 0.14
419 0.16
420 0.17
421 0.22
422 0.24
423 0.25
424 0.28
425 0.27
426 0.25
427 0.25
428 0.27
429 0.24
430 0.24
431 0.25
432 0.23
433 0.3
434 0.32
435 0.38
436 0.46
437 0.47
438 0.48
439 0.49
440 0.48
441 0.46
442 0.49
443 0.48
444 0.49
445 0.54
446 0.53
447 0.54
448 0.55
449 0.5
450 0.48
451 0.43
452 0.36
453 0.33
454 0.38
455 0.41
456 0.45
457 0.46
458 0.44
459 0.45
460 0.43
461 0.42
462 0.34
463 0.36
464 0.37
465 0.39
466 0.49
467 0.54
468 0.58
469 0.59
470 0.68
471 0.68
472 0.68
473 0.72
474 0.72
475 0.69
476 0.69
477 0.67
478 0.59
479 0.55
480 0.54
481 0.52
482 0.48
483 0.44
484 0.41
485 0.39
486 0.42
487 0.41
488 0.37
489 0.37
490 0.3
491 0.27
492 0.34
493 0.35
494 0.32
495 0.34
496 0.31
497 0.26
498 0.26
499 0.26
500 0.2
501 0.2
502 0.25
503 0.21
504 0.24
505 0.27
506 0.27
507 0.28
508 0.26
509 0.25
510 0.18
511 0.2
512 0.19
513 0.15
514 0.14
515 0.13
516 0.13
517 0.1
518 0.1
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.09
524 0.1
525 0.1
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.13
530 0.12
531 0.12
532 0.17
533 0.24
534 0.25
535 0.28
536 0.29
537 0.3
538 0.33
539 0.36
540 0.37
541 0.35
542 0.39
543 0.41
544 0.48
545 0.52
546 0.5
547 0.47
548 0.42
549 0.37
550 0.33
551 0.3
552 0.22
553 0.17
554 0.16
555 0.16
556 0.17
557 0.17
558 0.18
559 0.17
560 0.18
561 0.19
562 0.19
563 0.2
564 0.24
565 0.29
566 0.33
567 0.39
568 0.41
569 0.4