Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HXN0

Protein Details
Accession A0A397HXN0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
195-218IEKVDGKKVKKDPKKKSKDDDSAFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-212EKVDGKKVKKDPKKKSK
325-332KNGKKRKQ
342-350ENKKPKKPK
391-403KVASGLSKKKRKS
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 13.333, cyto 11, mito_nucl 8.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MVSSTALTTKVESGSPYQLEKSQVARASSALLKHIKSKQEEQEKTATKKTLIGDNDEDSDEDSPLKNEAVWLVLTTKKHVVDKNRLKPGKISIPHSLNASPSLSICLITADPQRSVKNIVADPSFPQNLSSRIDRIIGYSKLKARYQSFESRRQLLSEHDVFLADDRIIMRLVNTLGKVFYKSSKRPIPIRIAEIEKVDGKKVKKDPKKKSKDDDSAFASPAIVAKEIEKTLNCAAVQLAPATTAAIRVGSSKFTPEQLAENVEAVVKGLTDKFITKGWRNIKALHIKGANTMAMPIWLASELWVDEGDVVEDAEEDVKAIEGAKNGKKRKQTGDDEKLLEENKKPKKPKADEDDDALSMAARKEKLQQQKAKALEDGNESGNKKVTAGGKVASGLSKKKRKSIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.28
4 0.28
5 0.3
6 0.33
7 0.34
8 0.34
9 0.34
10 0.36
11 0.35
12 0.33
13 0.3
14 0.31
15 0.3
16 0.28
17 0.28
18 0.28
19 0.28
20 0.35
21 0.41
22 0.44
23 0.47
24 0.54
25 0.58
26 0.64
27 0.67
28 0.64
29 0.68
30 0.68
31 0.67
32 0.65
33 0.59
34 0.49
35 0.5
36 0.48
37 0.46
38 0.4
39 0.41
40 0.38
41 0.37
42 0.38
43 0.34
44 0.31
45 0.24
46 0.23
47 0.17
48 0.14
49 0.13
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.15
61 0.16
62 0.18
63 0.22
64 0.24
65 0.29
66 0.34
67 0.4
68 0.47
69 0.58
70 0.64
71 0.7
72 0.7
73 0.66
74 0.65
75 0.64
76 0.63
77 0.57
78 0.53
79 0.5
80 0.52
81 0.51
82 0.5
83 0.43
84 0.34
85 0.31
86 0.27
87 0.19
88 0.15
89 0.16
90 0.13
91 0.13
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.12
96 0.17
97 0.16
98 0.18
99 0.21
100 0.22
101 0.22
102 0.25
103 0.25
104 0.25
105 0.25
106 0.26
107 0.24
108 0.24
109 0.25
110 0.27
111 0.25
112 0.19
113 0.2
114 0.18
115 0.2
116 0.22
117 0.22
118 0.19
119 0.19
120 0.21
121 0.19
122 0.2
123 0.23
124 0.23
125 0.24
126 0.26
127 0.3
128 0.33
129 0.35
130 0.37
131 0.35
132 0.36
133 0.4
134 0.46
135 0.47
136 0.52
137 0.55
138 0.54
139 0.51
140 0.47
141 0.41
142 0.34
143 0.35
144 0.27
145 0.24
146 0.2
147 0.2
148 0.19
149 0.18
150 0.16
151 0.09
152 0.08
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.11
166 0.1
167 0.16
168 0.21
169 0.24
170 0.32
171 0.38
172 0.42
173 0.45
174 0.5
175 0.52
176 0.48
177 0.49
178 0.44
179 0.4
180 0.37
181 0.33
182 0.29
183 0.23
184 0.2
185 0.19
186 0.2
187 0.18
188 0.24
189 0.31
190 0.39
191 0.46
192 0.56
193 0.65
194 0.72
195 0.82
196 0.83
197 0.84
198 0.84
199 0.85
200 0.77
201 0.71
202 0.65
203 0.57
204 0.49
205 0.4
206 0.3
207 0.2
208 0.18
209 0.14
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.09
214 0.09
215 0.11
216 0.09
217 0.12
218 0.12
219 0.15
220 0.14
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.09
226 0.08
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.09
238 0.09
239 0.11
240 0.12
241 0.13
242 0.14
243 0.13
244 0.15
245 0.15
246 0.17
247 0.15
248 0.15
249 0.14
250 0.13
251 0.11
252 0.09
253 0.07
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.08
260 0.09
261 0.12
262 0.18
263 0.21
264 0.29
265 0.35
266 0.42
267 0.44
268 0.45
269 0.5
270 0.54
271 0.52
272 0.5
273 0.46
274 0.38
275 0.38
276 0.37
277 0.3
278 0.2
279 0.19
280 0.13
281 0.1
282 0.1
283 0.07
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.06
308 0.07
309 0.09
310 0.16
311 0.23
312 0.32
313 0.39
314 0.45
315 0.52
316 0.58
317 0.65
318 0.69
319 0.73
320 0.75
321 0.78
322 0.79
323 0.73
324 0.67
325 0.61
326 0.53
327 0.46
328 0.41
329 0.41
330 0.43
331 0.5
332 0.56
333 0.6
334 0.69
335 0.75
336 0.79
337 0.8
338 0.79
339 0.73
340 0.73
341 0.69
342 0.58
343 0.49
344 0.39
345 0.28
346 0.21
347 0.19
348 0.18
349 0.15
350 0.16
351 0.23
352 0.32
353 0.42
354 0.51
355 0.58
356 0.62
357 0.7
358 0.73
359 0.69
360 0.64
361 0.56
362 0.5
363 0.47
364 0.41
365 0.36
366 0.37
367 0.35
368 0.33
369 0.34
370 0.3
371 0.25
372 0.27
373 0.29
374 0.28
375 0.29
376 0.28
377 0.26
378 0.27
379 0.28
380 0.27
381 0.27
382 0.31
383 0.39
384 0.47
385 0.5