Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JXQ3

Protein Details
Accession B6JXQ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-287EQYKDAPPKQGNFRRRRRFDAFKLMDHGKSGNRQHQKRKRNFHRQDKEKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
249-287NFRRRRRFDAFKLMDHGKSGNRQHQKRKRNFHRQDKEKK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 12.333, cyto 9.5, mito_nucl 9.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR002344  Lupus_La  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005844  C:polysome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0033592  F:RNA strand annealing activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0042780  P:tRNA 3'-end processing  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
GO:0061818  P:tRNA folding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
PS50102  RRM  
CDD cd08029  LA_like_fungal  
cd12291  RRM1_La  
Amino Acid Sequences MSSAAETPATTAPAPEKVAETPVAEPVQASTESEASKTEAAPTVATQEAVPPSEEELEILKQVEFYFSDSNFPQDKFLWTTAQKNNGWVPIAVIAAFKRMKRFQPLEKVVGALRKSKELLEVDEKGENVRRKVPLLPPTKTGAGPILERSVYAKGFGEETATTQFDVEKLFESQSEAVASVRLRRADDNAFKGSVFVEFKTADAMNAFLEKVKVTPLQWNGQDLTIMSKKAYVDMKAEQYKDAPPKQGNFRRRRRFDAFKLMDHGKSGNRQHQKRKRNFHRQDKEKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.21
4 0.2
5 0.23
6 0.23
7 0.22
8 0.19
9 0.23
10 0.22
11 0.19
12 0.18
13 0.16
14 0.17
15 0.15
16 0.15
17 0.12
18 0.14
19 0.15
20 0.15
21 0.16
22 0.15
23 0.15
24 0.15
25 0.15
26 0.16
27 0.16
28 0.16
29 0.16
30 0.17
31 0.17
32 0.17
33 0.14
34 0.14
35 0.15
36 0.15
37 0.16
38 0.13
39 0.14
40 0.15
41 0.15
42 0.12
43 0.13
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.12
51 0.1
52 0.12
53 0.14
54 0.14
55 0.18
56 0.17
57 0.22
58 0.23
59 0.23
60 0.22
61 0.2
62 0.23
63 0.23
64 0.25
65 0.25
66 0.25
67 0.33
68 0.35
69 0.42
70 0.39
71 0.39
72 0.39
73 0.36
74 0.35
75 0.26
76 0.22
77 0.16
78 0.16
79 0.12
80 0.11
81 0.09
82 0.13
83 0.15
84 0.15
85 0.19
86 0.23
87 0.26
88 0.34
89 0.39
90 0.42
91 0.51
92 0.55
93 0.52
94 0.49
95 0.46
96 0.39
97 0.39
98 0.32
99 0.27
100 0.23
101 0.22
102 0.22
103 0.21
104 0.24
105 0.21
106 0.23
107 0.23
108 0.24
109 0.23
110 0.23
111 0.23
112 0.19
113 0.24
114 0.23
115 0.19
116 0.22
117 0.21
118 0.22
119 0.26
120 0.31
121 0.34
122 0.38
123 0.38
124 0.37
125 0.39
126 0.39
127 0.34
128 0.29
129 0.22
130 0.16
131 0.15
132 0.13
133 0.12
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.07
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.11
168 0.13
169 0.14
170 0.15
171 0.16
172 0.2
173 0.25
174 0.3
175 0.32
176 0.31
177 0.3
178 0.29
179 0.28
180 0.25
181 0.21
182 0.17
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.15
188 0.14
189 0.11
190 0.1
191 0.11
192 0.08
193 0.09
194 0.09
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.19
203 0.22
204 0.28
205 0.29
206 0.32
207 0.3
208 0.28
209 0.28
210 0.21
211 0.23
212 0.19
213 0.19
214 0.16
215 0.17
216 0.17
217 0.21
218 0.24
219 0.2
220 0.21
221 0.25
222 0.34
223 0.37
224 0.38
225 0.35
226 0.34
227 0.38
228 0.43
229 0.43
230 0.42
231 0.41
232 0.46
233 0.56
234 0.64
235 0.67
236 0.69
237 0.76
238 0.8
239 0.82
240 0.85
241 0.83
242 0.84
243 0.82
244 0.83
245 0.77
246 0.71
247 0.7
248 0.66
249 0.57
250 0.49
251 0.43
252 0.36
253 0.4
254 0.43
255 0.46
256 0.52
257 0.6
258 0.7
259 0.77
260 0.83
261 0.86
262 0.9
263 0.91
264 0.92
265 0.94
266 0.94
267 0.95