Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JWM4

Protein Details
Accession B6JWM4    Localization Confidence Low Confidence Score 6.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-65RPITQCESCRRARKTRRLHIKCNCASRDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 11.166, nucl 5, cyto_nucl 4.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001083  Cu_fist_DNA-bd_dom  
IPR036395  Cu_fist_DNA-bd_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005507  F:copper ion binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006878  P:intracellular copper ion homeostasis  
GO:0006879  P:intracellular iron ion homeostasis  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00649  Copper-fist  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50073  COPPER_FIST_2  
Amino Acid Sequences MVIRDNHKMACMKCIRGHRASGCNHTDRELFVVRPKGRPITQCESCRRARKTRRLHIKCNCASRDKDVQQARQQLDQQVKQVFVETHKRNAPAAPYSSCCRSNAGHMNNAPCHSDAPAAVRLPSIVTPDAASPANTLPYVSVLRPPTTQAYMPPLTEEGVVVPGHLLPPGAPKLQPPATILPSHEPPAVLPSQLVHSASPSDGYGAIPNGGAQHTEVYPFITNSEAAITAAAAAHNFYPQPAQPLSFALLGNGEYLPVVALPNQAPNTYAGVGHVPEQPIPAVSVLDKIQLADHLEEFPRCAKPSSQCSCGENCQCVGCLTHPNNATTLAALNHISVLHMENAVPPKVPTPQPSQASPLHYPQPSQQQPQHYPVPPLTSVGSLLDESSSRKAFPQVGEAKKAQPDNFLHVALVPQTQTTPQTCSSNAPKQLFPAPTGRMSSHFYELPPPFPSHAAPGSIAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.59
3 0.58
4 0.65
5 0.62
6 0.64
7 0.64
8 0.67
9 0.65
10 0.62
11 0.59
12 0.54
13 0.48
14 0.41
15 0.4
16 0.35
17 0.3
18 0.31
19 0.4
20 0.39
21 0.43
22 0.47
23 0.48
24 0.51
25 0.55
26 0.56
27 0.56
28 0.62
29 0.66
30 0.69
31 0.68
32 0.71
33 0.74
34 0.74
35 0.75
36 0.77
37 0.79
38 0.82
39 0.86
40 0.89
41 0.89
42 0.92
43 0.9
44 0.9
45 0.87
46 0.85
47 0.8
48 0.75
49 0.69
50 0.66
51 0.67
52 0.59
53 0.61
54 0.59
55 0.61
56 0.62
57 0.68
58 0.63
59 0.58
60 0.59
61 0.56
62 0.57
63 0.52
64 0.5
65 0.44
66 0.42
67 0.36
68 0.35
69 0.31
70 0.28
71 0.35
72 0.32
73 0.37
74 0.4
75 0.42
76 0.4
77 0.41
78 0.4
79 0.36
80 0.37
81 0.33
82 0.33
83 0.35
84 0.39
85 0.38
86 0.34
87 0.31
88 0.28
89 0.33
90 0.39
91 0.39
92 0.41
93 0.43
94 0.47
95 0.47
96 0.47
97 0.4
98 0.31
99 0.28
100 0.22
101 0.2
102 0.15
103 0.16
104 0.19
105 0.18
106 0.18
107 0.17
108 0.16
109 0.16
110 0.16
111 0.15
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.1
120 0.11
121 0.12
122 0.11
123 0.11
124 0.08
125 0.11
126 0.12
127 0.11
128 0.16
129 0.17
130 0.19
131 0.19
132 0.21
133 0.22
134 0.22
135 0.22
136 0.19
137 0.24
138 0.24
139 0.23
140 0.22
141 0.19
142 0.17
143 0.17
144 0.15
145 0.08
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.04
155 0.08
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.19
161 0.21
162 0.23
163 0.22
164 0.23
165 0.25
166 0.26
167 0.26
168 0.24
169 0.23
170 0.24
171 0.21
172 0.17
173 0.15
174 0.17
175 0.16
176 0.13
177 0.11
178 0.09
179 0.1
180 0.12
181 0.12
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.06
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.12
232 0.13
233 0.14
234 0.13
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.06
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.03
247 0.05
248 0.06
249 0.09
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.11
261 0.12
262 0.11
263 0.1
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.08
269 0.06
270 0.06
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.11
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.11
283 0.11
284 0.12
285 0.14
286 0.15
287 0.15
288 0.16
289 0.18
290 0.24
291 0.34
292 0.38
293 0.4
294 0.41
295 0.42
296 0.44
297 0.48
298 0.45
299 0.36
300 0.32
301 0.28
302 0.26
303 0.23
304 0.21
305 0.16
306 0.21
307 0.21
308 0.26
309 0.27
310 0.27
311 0.28
312 0.27
313 0.25
314 0.17
315 0.16
316 0.11
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.11
329 0.14
330 0.15
331 0.15
332 0.14
333 0.15
334 0.2
335 0.23
336 0.24
337 0.29
338 0.37
339 0.4
340 0.41
341 0.45
342 0.43
343 0.46
344 0.45
345 0.41
346 0.4
347 0.37
348 0.37
349 0.37
350 0.44
351 0.43
352 0.47
353 0.47
354 0.5
355 0.55
356 0.59
357 0.62
358 0.54
359 0.53
360 0.48
361 0.48
362 0.39
363 0.35
364 0.31
365 0.23
366 0.21
367 0.18
368 0.17
369 0.12
370 0.12
371 0.11
372 0.1
373 0.12
374 0.16
375 0.16
376 0.15
377 0.16
378 0.2
379 0.24
380 0.25
381 0.32
382 0.37
383 0.41
384 0.47
385 0.48
386 0.48
387 0.49
388 0.53
389 0.44
390 0.42
391 0.4
392 0.42
393 0.42
394 0.38
395 0.33
396 0.28
397 0.28
398 0.22
399 0.21
400 0.14
401 0.12
402 0.12
403 0.14
404 0.18
405 0.18
406 0.21
407 0.23
408 0.26
409 0.27
410 0.33
411 0.4
412 0.45
413 0.51
414 0.51
415 0.48
416 0.49
417 0.55
418 0.5
419 0.45
420 0.42
421 0.38
422 0.38
423 0.41
424 0.38
425 0.35
426 0.37
427 0.38
428 0.35
429 0.33
430 0.3
431 0.36
432 0.37
433 0.37
434 0.36
435 0.35
436 0.32
437 0.33
438 0.33
439 0.3
440 0.31
441 0.29