Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HJ08

Protein Details
Accession A0A397HJ08    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-50AEESKGRFAKRRKTHTRADDLSHydrophilic
62-86EDDSKTKLKGKPKSKSQTTKHSNDSHydrophilic
126-154SATAKSTKLKKKPLDKTRPPKKNKTGVIYHydrophilic
292-315KVLQGIQKKNEEKRKKKAEIEGEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
132-149TKLKKKPLDKTRPPKKNK
299-308KKNEEKRKKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MTTRKRNEFLDIVSDDDEGSDRGYDSEAAEESKGRFAKRRKTHTRADDLSDEESDIGSSESEDDSKTKLKGKPKSKSQTTKHSNDSDDEDEDEDADADDDGEKMPVDQYLDTTVTQSPSQSPSTSSATAKSTKLKKKPLDKTRPPKKNKTGVIYLSSLPPYLKPFALKSMLETRGFAPITKVFLTPEVPSTSAPRRRSNKRKSYADGWVEFASKKTAKICAETLNATIVGGKKGGWYHDDVWNMKYLKGFKWADLMEQVQRERSEREAKRRIEDTRARKEDKVFLQGVEQGKVLQGIQKKNEEKRKKKAEIEGEAAADAAASDLKIRRLFKQNEVKMGRDKIKDNSTLEDDAKRVLSKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.25
3 0.21
4 0.19
5 0.12
6 0.11
7 0.09
8 0.08
9 0.09
10 0.1
11 0.11
12 0.1
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.14
17 0.16
18 0.16
19 0.22
20 0.24
21 0.25
22 0.32
23 0.39
24 0.49
25 0.57
26 0.67
27 0.71
28 0.76
29 0.83
30 0.84
31 0.86
32 0.8
33 0.76
34 0.69
35 0.61
36 0.56
37 0.47
38 0.37
39 0.27
40 0.22
41 0.16
42 0.12
43 0.09
44 0.06
45 0.06
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.09
50 0.1
51 0.12
52 0.16
53 0.19
54 0.25
55 0.3
56 0.38
57 0.47
58 0.57
59 0.64
60 0.71
61 0.79
62 0.82
63 0.87
64 0.85
65 0.87
66 0.85
67 0.82
68 0.79
69 0.74
70 0.65
71 0.58
72 0.56
73 0.48
74 0.41
75 0.35
76 0.28
77 0.22
78 0.2
79 0.18
80 0.12
81 0.09
82 0.07
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.1
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.15
106 0.17
107 0.16
108 0.17
109 0.19
110 0.23
111 0.24
112 0.23
113 0.22
114 0.23
115 0.26
116 0.26
117 0.3
118 0.35
119 0.41
120 0.49
121 0.56
122 0.6
123 0.68
124 0.76
125 0.8
126 0.82
127 0.84
128 0.87
129 0.89
130 0.91
131 0.89
132 0.89
133 0.87
134 0.85
135 0.8
136 0.75
137 0.71
138 0.64
139 0.59
140 0.51
141 0.42
142 0.34
143 0.28
144 0.23
145 0.16
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.13
152 0.16
153 0.19
154 0.18
155 0.19
156 0.24
157 0.27
158 0.26
159 0.25
160 0.22
161 0.24
162 0.24
163 0.21
164 0.16
165 0.13
166 0.15
167 0.15
168 0.15
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.12
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.16
178 0.22
179 0.28
180 0.32
181 0.38
182 0.45
183 0.55
184 0.65
185 0.72
186 0.75
187 0.77
188 0.8
189 0.77
190 0.75
191 0.73
192 0.68
193 0.58
194 0.5
195 0.41
196 0.36
197 0.3
198 0.25
199 0.21
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.2
204 0.2
205 0.23
206 0.25
207 0.25
208 0.26
209 0.26
210 0.25
211 0.2
212 0.18
213 0.15
214 0.15
215 0.11
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.15
224 0.17
225 0.22
226 0.26
227 0.26
228 0.26
229 0.31
230 0.3
231 0.27
232 0.27
233 0.25
234 0.22
235 0.29
236 0.29
237 0.24
238 0.29
239 0.29
240 0.27
241 0.28
242 0.28
243 0.23
244 0.26
245 0.26
246 0.23
247 0.24
248 0.24
249 0.23
250 0.27
251 0.34
252 0.36
253 0.46
254 0.52
255 0.55
256 0.59
257 0.63
258 0.61
259 0.6
260 0.63
261 0.62
262 0.64
263 0.69
264 0.67
265 0.64
266 0.65
267 0.63
268 0.59
269 0.56
270 0.46
271 0.39
272 0.36
273 0.38
274 0.36
275 0.29
276 0.24
277 0.17
278 0.17
279 0.17
280 0.15
281 0.14
282 0.18
283 0.23
284 0.28
285 0.37
286 0.44
287 0.53
288 0.63
289 0.7
290 0.73
291 0.78
292 0.84
293 0.84
294 0.84
295 0.85
296 0.84
297 0.8
298 0.76
299 0.68
300 0.57
301 0.48
302 0.4
303 0.3
304 0.2
305 0.12
306 0.07
307 0.05
308 0.04
309 0.07
310 0.09
311 0.14
312 0.2
313 0.22
314 0.29
315 0.39
316 0.45
317 0.52
318 0.61
319 0.62
320 0.67
321 0.69
322 0.67
323 0.65
324 0.68
325 0.66
326 0.6
327 0.59
328 0.57
329 0.6
330 0.62
331 0.57
332 0.55
333 0.52
334 0.51
335 0.49
336 0.44
337 0.38
338 0.34
339 0.34
340 0.29