Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HZ40

Protein Details
Accession A0A397HZ40    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MGKSRPHKKKASKSREKSVLRAGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-19KSRPHKKKASKSREKSV
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 10, cyto_nucl 9.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF13424  TPR_12  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50293  TPR_REGION  
Amino Acid Sequences MGKSRPHKKKASKSREKSVLRAGGSVSKQKMSEDPAKLLEQAIILLQTGQPDAALATAQQAFSSAPANSPGQLSALNTIGEIYVELGDINAARECFLRAVELDPNGTIPESEGGGAEKFLWLAQLSEAGGRDSVQWFEKGVSALRTIIQQLEEKQDPQTAAELGEKKKKMANALCGVAEIYMTDLSWEEDAENQCESLITEALLVDPQAPEVLQTLASIRISQLRQDDARAALSRSLELWKDLPPEDPKVPEFATRVSLARLLMEVAMELEALEVLERLILEDDQSVEAWYLGGWCLYLLAEKRQAPKDAEAEASPESQRLASLVASREWLKQSLTLYDLVQYEDERLKEHAVELVQEMNKEIGEDMEDDSNAEDDEGEGGDWEDDFEGESDEDHEMAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.92
3 0.87
4 0.82
5 0.81
6 0.77
7 0.67
8 0.59
9 0.51
10 0.48
11 0.47
12 0.48
13 0.41
14 0.37
15 0.36
16 0.36
17 0.38
18 0.37
19 0.42
20 0.39
21 0.4
22 0.41
23 0.42
24 0.4
25 0.37
26 0.3
27 0.21
28 0.17
29 0.14
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.09
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.05
43 0.08
44 0.09
45 0.1
46 0.09
47 0.1
48 0.1
49 0.11
50 0.13
51 0.1
52 0.1
53 0.13
54 0.14
55 0.14
56 0.15
57 0.14
58 0.13
59 0.13
60 0.13
61 0.12
62 0.13
63 0.12
64 0.11
65 0.11
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.04
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.07
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.12
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.14
92 0.13
93 0.13
94 0.1
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.18
139 0.19
140 0.19
141 0.19
142 0.2
143 0.19
144 0.17
145 0.17
146 0.12
147 0.11
148 0.15
149 0.18
150 0.19
151 0.26
152 0.26
153 0.26
154 0.28
155 0.28
156 0.32
157 0.31
158 0.36
159 0.32
160 0.34
161 0.32
162 0.3
163 0.29
164 0.21
165 0.16
166 0.09
167 0.06
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.06
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.11
208 0.11
209 0.14
210 0.15
211 0.17
212 0.17
213 0.18
214 0.19
215 0.15
216 0.18
217 0.16
218 0.15
219 0.14
220 0.14
221 0.13
222 0.12
223 0.13
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.15
229 0.15
230 0.18
231 0.19
232 0.24
233 0.24
234 0.25
235 0.24
236 0.24
237 0.24
238 0.23
239 0.21
240 0.18
241 0.19
242 0.18
243 0.18
244 0.16
245 0.16
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.09
250 0.08
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.07
286 0.08
287 0.12
288 0.19
289 0.22
290 0.29
291 0.33
292 0.37
293 0.37
294 0.4
295 0.4
296 0.36
297 0.35
298 0.29
299 0.27
300 0.24
301 0.24
302 0.19
303 0.16
304 0.15
305 0.12
306 0.12
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.17
314 0.19
315 0.22
316 0.23
317 0.23
318 0.2
319 0.21
320 0.22
321 0.22
322 0.23
323 0.21
324 0.19
325 0.21
326 0.2
327 0.18
328 0.17
329 0.15
330 0.17
331 0.19
332 0.19
333 0.17
334 0.18
335 0.19
336 0.19
337 0.19
338 0.19
339 0.16
340 0.17
341 0.17
342 0.21
343 0.21
344 0.2
345 0.21
346 0.17
347 0.17
348 0.16
349 0.15
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.11
354 0.12
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.1
361 0.08
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.11