Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HLA4

Protein Details
Accession A0A397HLA4    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-35DEIIAERPQKQNRGRRPPQNQGRRRDGVKKBasic
49-70DDRDTRPARGPRRPRGDRYSPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-31NRGRRPPQNQGRRRD
57-63RGPRRPR
200-225GARHRRGRRGGGGYRRSDVSKPPPEH
230-268VPGQRSPVRRSTNGRRQGERRDDKDRGEGRRNPNARPKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MDRSLDEIIAERPQKQNRGRRPPQNQGRRRDGVKKGYIYSDWVHDRYDDDRDTRPARGPRRPRGDRYSPSPDRAPTGAKIRVENLHYDITESDLEDLFTRIGPISNLSLVYDRAGRSEGVAYVTYNRASDARTAISEFDGANAKGQPIRLTLVASGGGKRDRNPFDNVERPKGSLFDRIERPRNARSLSPGNENGDAEGGARHRRGRRGGGGYRRSDVSKPPPEHIDRYVPGQRSPVRRSTNGRRQGERRDDKDRGEGRRNPNARPKKTQEELDQEMDDYWGGANAGAGAADKETVQDEPLQIAPATSAAAGDDDVDMIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.54
3 0.62
4 0.66
5 0.75
6 0.82
7 0.84
8 0.87
9 0.89
10 0.91
11 0.92
12 0.89
13 0.87
14 0.87
15 0.83
16 0.8
17 0.79
18 0.77
19 0.75
20 0.75
21 0.71
22 0.64
23 0.61
24 0.55
25 0.5
26 0.43
27 0.4
28 0.37
29 0.33
30 0.31
31 0.27
32 0.29
33 0.27
34 0.32
35 0.27
36 0.25
37 0.28
38 0.34
39 0.36
40 0.37
41 0.42
42 0.44
43 0.5
44 0.57
45 0.63
46 0.67
47 0.75
48 0.8
49 0.8
50 0.81
51 0.82
52 0.79
53 0.77
54 0.77
55 0.71
56 0.68
57 0.64
58 0.56
59 0.5
60 0.45
61 0.4
62 0.34
63 0.37
64 0.37
65 0.34
66 0.35
67 0.34
68 0.36
69 0.34
70 0.33
71 0.28
72 0.26
73 0.24
74 0.23
75 0.2
76 0.18
77 0.17
78 0.14
79 0.12
80 0.09
81 0.1
82 0.09
83 0.1
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.09
115 0.1
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.1
136 0.09
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.11
145 0.11
146 0.13
147 0.2
148 0.22
149 0.25
150 0.28
151 0.3
152 0.34
153 0.41
154 0.42
155 0.41
156 0.38
157 0.36
158 0.33
159 0.31
160 0.27
161 0.26
162 0.25
163 0.25
164 0.32
165 0.37
166 0.43
167 0.44
168 0.47
169 0.43
170 0.46
171 0.42
172 0.35
173 0.36
174 0.37
175 0.36
176 0.37
177 0.36
178 0.34
179 0.33
180 0.32
181 0.26
182 0.19
183 0.16
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.12
189 0.17
190 0.2
191 0.26
192 0.3
193 0.34
194 0.4
195 0.47
196 0.53
197 0.58
198 0.61
199 0.59
200 0.56
201 0.52
202 0.47
203 0.4
204 0.39
205 0.39
206 0.41
207 0.41
208 0.41
209 0.47
210 0.48
211 0.51
212 0.48
213 0.45
214 0.37
215 0.41
216 0.44
217 0.39
218 0.36
219 0.39
220 0.41
221 0.42
222 0.46
223 0.48
224 0.48
225 0.52
226 0.59
227 0.64
228 0.68
229 0.7
230 0.72
231 0.7
232 0.71
233 0.75
234 0.78
235 0.77
236 0.72
237 0.71
238 0.69
239 0.65
240 0.68
241 0.65
242 0.62
243 0.62
244 0.64
245 0.63
246 0.69
247 0.69
248 0.66
249 0.7
250 0.73
251 0.71
252 0.72
253 0.72
254 0.72
255 0.74
256 0.74
257 0.72
258 0.7
259 0.68
260 0.63
261 0.55
262 0.46
263 0.4
264 0.33
265 0.25
266 0.16
267 0.1
268 0.07
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.11
285 0.12
286 0.14
287 0.15
288 0.17
289 0.15
290 0.15
291 0.14
292 0.12
293 0.11
294 0.09
295 0.08
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07