FuNGI

A0A397HVC2

Protein Details

Accession

A0A397HVC2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
536-557	DLSENRRKRRRIERRTVTQESP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
541-547	RRKRRRI

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009057 Homeobox-like_sf IPR039601 Rrn5 IPR001005 SANT/Myb
Gene Ontology	GO:0000500 C:RNA polymerase I upstream activating factor complex GO:0042790 P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I
CDD	cd00167 SANT

Amino Acid Sequences

MSSSSVYEPDDDEEASDSDIESRYPDTKFAASSPPIQDFERLNSAESEDPDTPEVIPRATKGTRAQILDTLRTSLGIGCVDAYTAEFAEAVNDTVPSNVGSENYNATQNGVAIWTSEEKEILFSMLDRKGKNGAAEIAQAISSKSELEVQEHLKLLHRGLERQHLRDPHSRTIVLGEVPAALEISHECCKALDDYAELLALEEQRAEDVAGRKLHQKVWIVDREIAEMVEKQLEERDETPLPGSSVYVTAEFFNLNKWIRLSERFFMNAGGPRLEDNWLNVACADETPSITADALADFYALAISVTRRLVHSTLFFAMSRLRNMRETGNRKARIVRSRDVKTALNVLNMPQDRFDFWVGLARRCSLQVADLRHKKGWHSELLDYDEVEDILSGKVPVDASLDARSASRRRSESRAPHVTIEDDENESDVYSSASSVLSSPETTPIDEPSVHFEDEHAEEIDQVNNASEEMRLWRLMGQPVPSGVSSLASNTEQGSKLRKPIGERKTKEDLVDWRDRTLYRSDWEEYGHDIHDLYEDLSENRRKRRRIERRTVTQESPVSIASDRDHEMGDNNDSQGPGNHAVKDELRAENDADGDGALQIEGADDAMDIEDSVHNESDSAGSGDARMDIETGPLDQGPGQDFRQDRAEYSSNEASASDSELSDGEQEHPPSSPKPESEAIASEPQDSGPIKREAIGVDLSEQSAVEVAYDSDSDATSGEESDSDQKPHVHTRNHVGGVPVNEIEGPSIKHESSHFDYNDSSKPERASASDLESDEGSELDQKPNIHPQNENRNDRIPVRQDSGPVVKEENIKFSQSEESGSEYEVDSQVESDEEGKPNPHLRAPSQPVIKPEPRLRGTDSDSYLDSDETDSDEDSPTHPQGGIKLEPNRESSQLDMAHKEPASEPDSDSESGSSSDDDGSRDKHERHQNERLNTELKNESEDNLSSGSDDDLPYDRHQKREDTYSSSEDEDEKNNLPLHSQPLSPVV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.15
3	0.14
4	0.11
5	0.12
6	0.12
7	0.12
8	0.11
9	0.14
10	0.17
11	0.18
12	0.2
13	0.21
14	0.23
15	0.25
16	0.26
17	0.3
18	0.29
19	0.35
20	0.38
21	0.39
22	0.39
23	0.39
24	0.4
25	0.35
26	0.38
27	0.39
28	0.35
29	0.31
30	0.3
31	0.32
32	0.31
33	0.3
34	0.31
35	0.24
36	0.26
37	0.26
38	0.25
39	0.23
40	0.24
41	0.24
42	0.19
43	0.19
44	0.19
45	0.25
46	0.25
47	0.3
48	0.31
49	0.38
50	0.43
51	0.44
52	0.45
53	0.44
54	0.47
55	0.47
56	0.42
57	0.36
58	0.29
59	0.27
60	0.25
61	0.2
62	0.18
63	0.13
64	0.12
65	0.1
66	0.1
67	0.1
68	0.09
69	0.09
70	0.08
71	0.07
72	0.07
73	0.06
74	0.06
75	0.08
76	0.08
77	0.08
78	0.07
79	0.08
80	0.08
81	0.08
82	0.09
83	0.08
84	0.09
85	0.08
86	0.09
87	0.1
88	0.12
89	0.16
90	0.17
91	0.19
92	0.18
93	0.18
94	0.18
95	0.16
96	0.15
97	0.12
98	0.1
99	0.08
100	0.1
101	0.12
102	0.13
103	0.13
104	0.13
105	0.12
106	0.14
107	0.14
108	0.12
109	0.1
110	0.09
111	0.15
112	0.2
113	0.25
114	0.24
115	0.26
116	0.3
117	0.32
118	0.32
119	0.3
120	0.27
121	0.24
122	0.25
123	0.24
124	0.2
125	0.18
126	0.16
127	0.13
128	0.11
129	0.09
130	0.08
131	0.08
132	0.12
133	0.12
134	0.15
135	0.2
136	0.22
137	0.25
138	0.26
139	0.27
140	0.27
141	0.28
142	0.25
143	0.28
144	0.27
145	0.27
146	0.3
147	0.4
148	0.4
149	0.43
150	0.49
151	0.47
152	0.51
153	0.55
154	0.58
155	0.56
156	0.56
157	0.52
158	0.45
159	0.43
160	0.39
161	0.31
162	0.25
163	0.17
164	0.12
165	0.11
166	0.11
167	0.08
168	0.05
169	0.05
170	0.06
171	0.1
172	0.12
173	0.13
174	0.13
175	0.13
176	0.15
177	0.16
178	0.17
179	0.13
180	0.12
181	0.13
182	0.13
183	0.13
184	0.11
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.08
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.1
195	0.13
196	0.18
197	0.2
198	0.21
199	0.27
200	0.3
201	0.33
202	0.35
203	0.37
204	0.37
205	0.43
206	0.49
207	0.46
208	0.47
209	0.45
210	0.41
211	0.36
212	0.3
213	0.23
214	0.17
215	0.15
216	0.13
217	0.12
218	0.1
219	0.13
220	0.14
221	0.15
222	0.16
223	0.19
224	0.18
225	0.19
226	0.2
227	0.18
228	0.18
229	0.15
230	0.14
231	0.1
232	0.1
233	0.1
234	0.1
235	0.09
236	0.09
237	0.1
238	0.1
239	0.09
240	0.1
241	0.14
242	0.14
243	0.15
244	0.16
245	0.17
246	0.2
247	0.27
248	0.3
249	0.29
250	0.31
251	0.31
252	0.31
253	0.29
254	0.29
255	0.28
256	0.25
257	0.21
258	0.18
259	0.17
260	0.18
261	0.19
262	0.16
263	0.13
264	0.16
265	0.15
266	0.15
267	0.14
268	0.14
269	0.12
270	0.12
271	0.13
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.1
276	0.1
277	0.09
278	0.09
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.05
283	0.05
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.03
289	0.03
290	0.04
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.09
295	0.12
296	0.13
297	0.14
298	0.15
299	0.16
300	0.16
301	0.17
302	0.17
303	0.15
304	0.2
305	0.19
306	0.22
307	0.22
308	0.23
309	0.23
310	0.25
311	0.31
312	0.36
313	0.4
314	0.46
315	0.53
316	0.53
317	0.53
318	0.58
319	0.59
320	0.58
321	0.58
322	0.55
323	0.54
324	0.56
325	0.58
326	0.54
327	0.48
328	0.41
329	0.42
330	0.36
331	0.29
332	0.26
333	0.23
334	0.26
335	0.25
336	0.24
337	0.18
338	0.17
339	0.16
340	0.18
341	0.18
342	0.11
343	0.11
344	0.18
345	0.18
346	0.2
347	0.21
348	0.19
349	0.19
350	0.19
351	0.19
352	0.12
353	0.15
354	0.16
355	0.22
356	0.31
357	0.36
358	0.39
359	0.41
360	0.41
361	0.39
362	0.42
363	0.39
364	0.35
365	0.33
366	0.32
367	0.32
368	0.36
369	0.34
370	0.27
371	0.24
372	0.18
373	0.14
374	0.11
375	0.08
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.05
382	0.05
383	0.06
384	0.07
385	0.07
386	0.08
387	0.1
388	0.1
389	0.09
390	0.1
391	0.13
392	0.14
393	0.17
394	0.21
395	0.24
396	0.28
397	0.34
398	0.42
399	0.47
400	0.54
401	0.59
402	0.55
403	0.53
404	0.49
405	0.44
406	0.36
407	0.29
408	0.21
409	0.14
410	0.12
411	0.11
412	0.1
413	0.09
414	0.08
415	0.06
416	0.05
417	0.04
418	0.04
419	0.05
420	0.04
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.07
427	0.1
428	0.11
429	0.11
430	0.12
431	0.12
432	0.13
433	0.13
434	0.13
435	0.15
436	0.16
437	0.16
438	0.15
439	0.14
440	0.15
441	0.16
442	0.17
443	0.11
444	0.09
445	0.09
446	0.1
447	0.1
448	0.08
449	0.07
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.04
455	0.04
456	0.06
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.09
461	0.11
462	0.13
463	0.14
464	0.14
465	0.13
466	0.14
467	0.15
468	0.13
469	0.11
470	0.09
471	0.08
472	0.06
473	0.06
474	0.07
475	0.06
476	0.07
477	0.07
478	0.09
479	0.09
480	0.1
481	0.15
482	0.15
483	0.19
484	0.22
485	0.23
486	0.26
487	0.35
488	0.43
489	0.49
490	0.5
491	0.53
492	0.56
493	0.56
494	0.51
495	0.45
496	0.42
497	0.38
498	0.44
499	0.37
500	0.32
501	0.32
502	0.32
503	0.3
504	0.27
505	0.23
506	0.16
507	0.19
508	0.2
509	0.19
510	0.2
511	0.18
512	0.17
513	0.16
514	0.15
515	0.11
516	0.1
517	0.09
518	0.09
519	0.08
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.11
525	0.17
526	0.2
527	0.29
528	0.36
529	0.39
530	0.47
531	0.58
532	0.64
533	0.7
534	0.77
535	0.78
536	0.81
537	0.87
538	0.84
539	0.74
540	0.68
541	0.58
542	0.48
543	0.39
544	0.3
545	0.22
546	0.16
547	0.16
548	0.11
549	0.12
550	0.12
551	0.11
552	0.11
553	0.1
554	0.11
555	0.12
556	0.13
557	0.12
558	0.11
559	0.11
560	0.11
561	0.11
562	0.11
563	0.12
564	0.14
565	0.14
566	0.14
567	0.14
568	0.16
569	0.16
570	0.18
571	0.18
572	0.16
573	0.16
574	0.16
575	0.16
576	0.15
577	0.15
578	0.12
579	0.09
580	0.07
581	0.06
582	0.05
583	0.04
584	0.03
585	0.03
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.03
590	0.02
591	0.02
592	0.03
593	0.03
594	0.03
595	0.03
596	0.03
597	0.04
598	0.05
599	0.06
600	0.06
601	0.06
602	0.06
603	0.07
604	0.07
605	0.07
606	0.06
607	0.06
608	0.05
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.05
614	0.05
615	0.05
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.06
621	0.06
622	0.06
623	0.07
624	0.08
625	0.11
626	0.11
627	0.15
628	0.15
629	0.17
630	0.23
631	0.22
632	0.21
633	0.25
634	0.28
635	0.25
636	0.3
637	0.3
638	0.24
639	0.24
640	0.23
641	0.18
642	0.14
643	0.15
644	0.1
645	0.08
646	0.08
647	0.08
648	0.08
649	0.08
650	0.08
651	0.09
652	0.11
653	0.12
654	0.13
655	0.14
656	0.15
657	0.16
658	0.21
659	0.21
660	0.19
661	0.23
662	0.25
663	0.25
664	0.25
665	0.26
666	0.23
667	0.25
668	0.24
669	0.2
670	0.18
671	0.17
672	0.18
673	0.17
674	0.15
675	0.16
676	0.17
677	0.17
678	0.18
679	0.19
680	0.17
681	0.18
682	0.18
683	0.13
684	0.13
685	0.13
686	0.12
687	0.11
688	0.1
689	0.07
690	0.07
691	0.06
692	0.04
693	0.04
694	0.04
695	0.05
696	0.05
697	0.05
698	0.05
699	0.06
700	0.06
701	0.05
702	0.06
703	0.05
704	0.06
705	0.06
706	0.05
707	0.07
708	0.13
709	0.14
710	0.15
711	0.16
712	0.18
713	0.21
714	0.31
715	0.36
716	0.35
717	0.38
718	0.45
719	0.51
720	0.5
721	0.48
722	0.4
723	0.37
724	0.34
725	0.32
726	0.24
727	0.17
728	0.15
729	0.14
730	0.13
731	0.11
732	0.1
733	0.1
734	0.13
735	0.12
736	0.14
737	0.15
738	0.21
739	0.25
740	0.32
741	0.29
742	0.29
743	0.31
744	0.33
745	0.37
746	0.35
747	0.32
748	0.27
749	0.28
750	0.28
751	0.28
752	0.27
753	0.26
754	0.23
755	0.25
756	0.26
757	0.25
758	0.24
759	0.22
760	0.21
761	0.16
762	0.14
763	0.1
764	0.11
765	0.12
766	0.13
767	0.16
768	0.17
769	0.19
770	0.29
771	0.34
772	0.32
773	0.37
774	0.44
775	0.53
776	0.61
777	0.64
778	0.58
779	0.58
780	0.59
781	0.56
782	0.56
783	0.5
784	0.46
785	0.45
786	0.43
787	0.4
788	0.42
789	0.45
790	0.38
791	0.33
792	0.3
793	0.28
794	0.34
795	0.33
796	0.34
797	0.3
798	0.3
799	0.28
800	0.28
801	0.3
802	0.23
803	0.24
804	0.19
805	0.21
806	0.2
807	0.21
808	0.2
809	0.15
810	0.16
811	0.15
812	0.14
813	0.1
814	0.1
815	0.09
816	0.09
817	0.09
818	0.09
819	0.11
820	0.13
821	0.14
822	0.15
823	0.19
824	0.24
825	0.26
826	0.28
827	0.29
828	0.31
829	0.4
830	0.46
831	0.5
832	0.51
833	0.52
834	0.53
835	0.57
836	0.59
837	0.57
838	0.56
839	0.58
840	0.54
841	0.55
842	0.55
843	0.53
844	0.54
845	0.53
846	0.49
847	0.42
848	0.4
849	0.38
850	0.34
851	0.27
852	0.22
853	0.16
854	0.13
855	0.12
856	0.12
857	0.11
858	0.11
859	0.13
860	0.12
861	0.13
862	0.17
863	0.16
864	0.17
865	0.17
866	0.17
867	0.19
868	0.24
869	0.27
870	0.3
871	0.36
872	0.4
873	0.42
874	0.47
875	0.46
876	0.43
877	0.41
878	0.36
879	0.36
880	0.35
881	0.35
882	0.33
883	0.31
884	0.35
885	0.33
886	0.32
887	0.27
888	0.27
889	0.27
890	0.25
891	0.25
892	0.22
893	0.26
894	0.25
895	0.25
896	0.2
897	0.18
898	0.18
899	0.17
900	0.14
901	0.12
902	0.13
903	0.13
904	0.15
905	0.17
906	0.19
907	0.24
908	0.29
909	0.31
910	0.38
911	0.48
912	0.54
913	0.6
914	0.68
915	0.72
916	0.73
917	0.74
918	0.7
919	0.64
920	0.56
921	0.53
922	0.47
923	0.39
924	0.37
925	0.35
926	0.31
927	0.31
928	0.3
929	0.26
930	0.22
931	0.21
932	0.16
933	0.15
934	0.15
935	0.13
936	0.13
937	0.13
938	0.15
939	0.18
940	0.22
941	0.32
942	0.34
943	0.39
944	0.43
945	0.48
946	0.5
947	0.57
948	0.58
949	0.55
950	0.57
951	0.54
952	0.53
953	0.48
954	0.44
955	0.37
956	0.35
957	0.31
958	0.3
959	0.27
960	0.29
961	0.3
962	0.29
963	0.28
964	0.29
965	0.32
966	0.3
967	0.29

A0A397HVC2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer