Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1E280

Protein Details
Accession A0A0D1E280    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-50LVNAQGPNWKKRKQERAQTARFIQTQHydrophilic
997-1022QRLQALKRDDDKGRRKPRNPIETSYLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-198KSRSETRKRLPSHGIIRATLRRKKLAERASHPQRR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0090502  P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG uma:UMAG_03277  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MVAQKRPAPSVGSSSKSQPASTADLVNAQGPNWKKRKQERAQTARFIQTQPSTTVSPSASSSRSVSKDSTPIPAHFSSAASAAASSSKLPTSIELESLVSSRAFQIQSFLRSIKSAKSATTTRAWQLLPRHARRRAASHNLLRLPSRLRSKALAELRSSTTQAKSRSETRKRLPSHGIIRATLRRKKLAERASHPQRRWLETHLWHAKRFRMTTEKGKGKERDQGNECGRWGFVLAETTMMKSHRASWRSAKEFVTVHDASYYSVFRVGVRIAAHDASSAEHFDVELLQHLHKSLAAAGFADAPNLGVNKSSSSAHVLDTILTLSKACLTSTATGEDLINSCLAASSLEAALAPVRIVLLSGTRQFTRTVPQQDPYTYACKEALIFTHPAADLHMRRALKAANFVMIDEKKNILFDLEAPAAQIVEAYASQLDSAPDPWLAAGGKDSSLSKLEKKRRRLAYQTGSTKMKSEQAMDTSSDVAINPMLLNDKADMMRKQGFNIFELIGPRAASLLQAVLRLSQGPSHHTDEASLRQLLNKQHGEMTAMVEVQVNDPRLSYPPRLKPLSTEVTASSRVANTLSSQESSGDNLFWMGADPPRFSKGEIDSRRALNIIPGARLKPDTRDNIVPVVLIRDRLVQNPSLDRFTLIVPRGWGLAFFMSLVATHQSGASSGARVLGQHQLKHQRLELAALSAAAGAKNQKAKADMLSYPHNWLGTQAYAVGEKEAAVVRQDTWGRRPKGKRTEYTFPTHKDWEAFRKANTAEQVRAKLSRDRTGVARPYPFGGSQHWEWMVGNSEYLFGHVSTGQHEGAEKTQPWLVASAASTSLTKEAVFSVSHFASAMVALKLHAVRKGTVMPLSSLMLAPSFEDHLSWVHHLDPIDHPAAVANRNSTGAQKMDKQHLKMLIDRRCEIMQLGRSAPQSSACKSKLRKAVAPTENVWDNYLASAADPEEMHDRSADWNHAVGTVLDGDYSLGNGKGFGIGAITLRAWLQLEEREQRLQALKRDDDKGRRKPRNPIETSYLLLMREPGTDVVRAVTASLKLLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.47
3 0.45
4 0.42
5 0.36
6 0.34
7 0.36
8 0.36
9 0.34
10 0.27
11 0.29
12 0.29
13 0.3
14 0.26
15 0.19
16 0.23
17 0.26
18 0.35
19 0.4
20 0.46
21 0.52
22 0.62
23 0.73
24 0.77
25 0.83
26 0.85
27 0.88
28 0.9
29 0.89
30 0.85
31 0.81
32 0.75
33 0.65
34 0.61
35 0.55
36 0.49
37 0.43
38 0.4
39 0.34
40 0.31
41 0.34
42 0.28
43 0.24
44 0.24
45 0.25
46 0.23
47 0.24
48 0.26
49 0.29
50 0.31
51 0.33
52 0.33
53 0.33
54 0.39
55 0.38
56 0.44
57 0.41
58 0.39
59 0.42
60 0.4
61 0.38
62 0.32
63 0.3
64 0.23
65 0.2
66 0.19
67 0.13
68 0.12
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.14
78 0.17
79 0.17
80 0.18
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.17
85 0.16
86 0.12
87 0.11
88 0.11
89 0.15
90 0.15
91 0.14
92 0.19
93 0.22
94 0.26
95 0.28
96 0.28
97 0.24
98 0.26
99 0.28
100 0.28
101 0.3
102 0.28
103 0.26
104 0.32
105 0.34
106 0.36
107 0.4
108 0.39
109 0.35
110 0.39
111 0.38
112 0.37
113 0.41
114 0.46
115 0.51
116 0.56
117 0.63
118 0.64
119 0.71
120 0.7
121 0.72
122 0.71
123 0.71
124 0.72
125 0.7
126 0.72
127 0.69
128 0.67
129 0.6
130 0.54
131 0.49
132 0.46
133 0.47
134 0.42
135 0.41
136 0.42
137 0.44
138 0.49
139 0.52
140 0.5
141 0.43
142 0.44
143 0.45
144 0.44
145 0.42
146 0.36
147 0.34
148 0.35
149 0.37
150 0.38
151 0.38
152 0.45
153 0.54
154 0.61
155 0.65
156 0.69
157 0.74
158 0.74
159 0.76
160 0.74
161 0.72
162 0.71
163 0.7
164 0.64
165 0.56
166 0.57
167 0.58
168 0.6
169 0.57
170 0.53
171 0.52
172 0.52
173 0.58
174 0.62
175 0.62
176 0.63
177 0.63
178 0.69
179 0.74
180 0.79
181 0.72
182 0.71
183 0.68
184 0.64
185 0.6
186 0.55
187 0.53
188 0.49
189 0.58
190 0.6
191 0.57
192 0.56
193 0.57
194 0.57
195 0.55
196 0.52
197 0.48
198 0.46
199 0.49
200 0.55
201 0.61
202 0.64
203 0.6
204 0.67
205 0.66
206 0.61
207 0.64
208 0.59
209 0.58
210 0.54
211 0.6
212 0.56
213 0.54
214 0.51
215 0.44
216 0.38
217 0.29
218 0.25
219 0.16
220 0.12
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.13
227 0.13
228 0.14
229 0.12
230 0.2
231 0.25
232 0.27
233 0.31
234 0.39
235 0.48
236 0.52
237 0.55
238 0.5
239 0.46
240 0.44
241 0.41
242 0.4
243 0.3
244 0.25
245 0.23
246 0.21
247 0.18
248 0.19
249 0.18
250 0.1
251 0.12
252 0.12
253 0.1
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.14
261 0.14
262 0.12
263 0.12
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.08
272 0.07
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.11
287 0.11
288 0.1
289 0.08
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.06
295 0.07
296 0.08
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.14
301 0.15
302 0.14
303 0.16
304 0.15
305 0.14
306 0.13
307 0.13
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.06
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.1
317 0.12
318 0.13
319 0.15
320 0.13
321 0.13
322 0.13
323 0.13
324 0.12
325 0.1
326 0.09
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.07
348 0.1
349 0.12
350 0.13
351 0.14
352 0.15
353 0.16
354 0.21
355 0.26
356 0.3
357 0.3
358 0.33
359 0.35
360 0.35
361 0.37
362 0.34
363 0.31
364 0.25
365 0.24
366 0.21
367 0.18
368 0.18
369 0.15
370 0.14
371 0.12
372 0.13
373 0.11
374 0.14
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.17
379 0.15
380 0.16
381 0.21
382 0.18
383 0.19
384 0.2
385 0.21
386 0.18
387 0.22
388 0.2
389 0.18
390 0.18
391 0.18
392 0.22
393 0.21
394 0.21
395 0.17
396 0.18
397 0.15
398 0.15
399 0.15
400 0.1
401 0.08
402 0.08
403 0.11
404 0.11
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.09
409 0.09
410 0.08
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.04
419 0.05
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.1
436 0.11
437 0.17
438 0.25
439 0.35
440 0.42
441 0.5
442 0.58
443 0.64
444 0.7
445 0.71
446 0.72
447 0.71
448 0.72
449 0.69
450 0.65
451 0.59
452 0.52
453 0.46
454 0.38
455 0.33
456 0.25
457 0.22
458 0.19
459 0.19
460 0.2
461 0.19
462 0.19
463 0.15
464 0.14
465 0.11
466 0.09
467 0.07
468 0.06
469 0.05
470 0.04
471 0.04
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.07
477 0.08
478 0.1
479 0.11
480 0.13
481 0.18
482 0.17
483 0.18
484 0.21
485 0.21
486 0.19
487 0.2
488 0.17
489 0.14
490 0.14
491 0.14
492 0.11
493 0.1
494 0.09
495 0.07
496 0.07
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.07
506 0.07
507 0.08
508 0.08
509 0.1
510 0.14
511 0.17
512 0.18
513 0.17
514 0.18
515 0.18
516 0.2
517 0.2
518 0.17
519 0.13
520 0.14
521 0.18
522 0.19
523 0.24
524 0.22
525 0.2
526 0.2
527 0.21
528 0.21
529 0.17
530 0.17
531 0.11
532 0.1
533 0.09
534 0.09
535 0.09
536 0.08
537 0.1
538 0.1
539 0.09
540 0.09
541 0.1
542 0.11
543 0.15
544 0.18
545 0.23
546 0.28
547 0.34
548 0.36
549 0.36
550 0.36
551 0.39
552 0.4
553 0.33
554 0.28
555 0.23
556 0.24
557 0.25
558 0.22
559 0.17
560 0.12
561 0.11
562 0.1
563 0.09
564 0.08
565 0.09
566 0.1
567 0.1
568 0.1
569 0.11
570 0.11
571 0.12
572 0.12
573 0.09
574 0.08
575 0.07
576 0.07
577 0.06
578 0.06
579 0.05
580 0.07
581 0.08
582 0.09
583 0.1
584 0.13
585 0.13
586 0.14
587 0.17
588 0.19
589 0.28
590 0.31
591 0.35
592 0.35
593 0.36
594 0.36
595 0.32
596 0.27
597 0.19
598 0.19
599 0.16
600 0.15
601 0.16
602 0.16
603 0.16
604 0.19
605 0.17
606 0.18
607 0.23
608 0.25
609 0.27
610 0.29
611 0.3
612 0.29
613 0.28
614 0.24
615 0.18
616 0.17
617 0.13
618 0.12
619 0.11
620 0.14
621 0.14
622 0.17
623 0.18
624 0.17
625 0.19
626 0.23
627 0.24
628 0.21
629 0.2
630 0.19
631 0.18
632 0.17
633 0.2
634 0.17
635 0.16
636 0.15
637 0.15
638 0.15
639 0.14
640 0.13
641 0.08
642 0.07
643 0.06
644 0.06
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.05
649 0.06
650 0.05
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.08
656 0.08
657 0.07
658 0.07
659 0.08
660 0.08
661 0.09
662 0.1
663 0.15
664 0.17
665 0.18
666 0.25
667 0.33
668 0.36
669 0.38
670 0.37
671 0.33
672 0.31
673 0.32
674 0.27
675 0.18
676 0.16
677 0.13
678 0.12
679 0.09
680 0.09
681 0.06
682 0.06
683 0.06
684 0.09
685 0.13
686 0.14
687 0.15
688 0.16
689 0.18
690 0.2
691 0.23
692 0.22
693 0.22
694 0.27
695 0.26
696 0.27
697 0.27
698 0.24
699 0.2
700 0.19
701 0.17
702 0.12
703 0.12
704 0.09
705 0.09
706 0.1
707 0.1
708 0.09
709 0.07
710 0.07
711 0.08
712 0.08
713 0.07
714 0.08
715 0.08
716 0.08
717 0.13
718 0.17
719 0.18
720 0.25
721 0.34
722 0.37
723 0.45
724 0.52
725 0.57
726 0.65
727 0.71
728 0.72
729 0.71
730 0.77
731 0.73
732 0.74
733 0.71
734 0.65
735 0.61
736 0.55
737 0.49
738 0.42
739 0.42
740 0.42
741 0.44
742 0.42
743 0.37
744 0.4
745 0.39
746 0.4
747 0.42
748 0.37
749 0.33
750 0.35
751 0.38
752 0.35
753 0.37
754 0.35
755 0.36
756 0.37
757 0.39
758 0.36
759 0.35
760 0.36
761 0.42
762 0.45
763 0.43
764 0.41
765 0.35
766 0.36
767 0.35
768 0.33
769 0.27
770 0.24
771 0.24
772 0.22
773 0.26
774 0.24
775 0.22
776 0.22
777 0.21
778 0.22
779 0.17
780 0.16
781 0.12
782 0.13
783 0.12
784 0.12
785 0.12
786 0.07
787 0.08
788 0.09
789 0.1
790 0.1
791 0.13
792 0.13
793 0.12
794 0.13
795 0.13
796 0.14
797 0.18
798 0.17
799 0.16
800 0.18
801 0.18
802 0.18
803 0.18
804 0.15
805 0.12
806 0.12
807 0.12
808 0.11
809 0.11
810 0.11
811 0.1
812 0.11
813 0.1
814 0.09
815 0.08
816 0.09
817 0.1
818 0.1
819 0.1
820 0.14
821 0.14
822 0.14
823 0.14
824 0.13
825 0.11
826 0.11
827 0.12
828 0.08
829 0.08
830 0.08
831 0.1
832 0.12
833 0.14
834 0.16
835 0.16
836 0.16
837 0.19
838 0.22
839 0.22
840 0.22
841 0.22
842 0.2
843 0.2
844 0.2
845 0.18
846 0.15
847 0.13
848 0.11
849 0.1
850 0.09
851 0.09
852 0.09
853 0.09
854 0.09
855 0.09
856 0.11
857 0.13
858 0.14
859 0.14
860 0.13
861 0.15
862 0.15
863 0.17
864 0.18
865 0.21
866 0.21
867 0.2
868 0.19
869 0.19
870 0.22
871 0.22
872 0.21
873 0.18
874 0.17
875 0.19
876 0.2
877 0.19
878 0.2
879 0.21
880 0.22
881 0.28
882 0.32
883 0.41
884 0.46
885 0.47
886 0.49
887 0.52
888 0.51
889 0.51
890 0.55
891 0.52
892 0.52
893 0.5
894 0.48
895 0.43
896 0.41
897 0.36
898 0.34
899 0.32
900 0.3
901 0.3
902 0.31
903 0.32
904 0.32
905 0.31
906 0.31
907 0.3
908 0.29
909 0.36
910 0.34
911 0.41
912 0.45
913 0.53
914 0.55
915 0.58
916 0.6
917 0.59
918 0.67
919 0.65
920 0.66
921 0.59
922 0.57
923 0.54
924 0.48
925 0.42
926 0.32
927 0.26
928 0.21
929 0.2
930 0.13
931 0.09
932 0.09
933 0.08
934 0.09
935 0.09
936 0.11
937 0.15
938 0.16
939 0.16
940 0.15
941 0.16
942 0.18
943 0.22
944 0.23
945 0.2
946 0.2
947 0.2
948 0.21
949 0.21
950 0.16
951 0.14
952 0.12
953 0.11
954 0.09
955 0.09
956 0.09
957 0.08
958 0.08
959 0.08
960 0.07
961 0.07
962 0.08
963 0.08
964 0.08
965 0.08
966 0.08
967 0.07
968 0.07
969 0.08
970 0.09
971 0.09
972 0.08
973 0.09
974 0.1
975 0.1
976 0.1
977 0.12
978 0.16
979 0.23
980 0.28
981 0.32
982 0.34
983 0.34
984 0.37
985 0.42
986 0.43
987 0.44
988 0.47
989 0.5
990 0.53
991 0.6
992 0.64
993 0.67
994 0.72
995 0.75
996 0.78
997 0.81
998 0.82
999 0.86
1000 0.88
1001 0.89
1002 0.85
1003 0.81
1004 0.78
1005 0.7
1006 0.66
1007 0.59
1008 0.5
1009 0.39
1010 0.33
1011 0.29
1012 0.22
1013 0.19
1014 0.18
1015 0.17
1016 0.17
1017 0.17
1018 0.17
1019 0.16
1020 0.16
1021 0.15
1022 0.14
1023 0.14
1024 0.13