Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HCY6

Protein Details
Accession A0A397HCY6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
660-686PSGTPSASSKPHKEKKEKEKKRLHFFRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
668-683SKPHKEKKEKEKKRLH
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11, cyto 9.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043154  Sec-1-like_dom1  
IPR043127  Sec-1-like_dom3a  
IPR001619  Sec1-like  
IPR027482  Sec1-like_dom2  
IPR036045  Sec1-like_sf  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00995  Sec1  
Amino Acid Sequences MMYDGADGCPLQWKVLVVDETSRKLIYNATNDDDILNLNVTNVEQIEHRRPPNPDMDALYILSPQTHIVDCLMADFERKRYRRAWLVWTSVLDPQQRARLDRSQMAREQIADFRVMNIDFFPRESRLVTFRDPWSFPVLFHPGCNHLIRGHLQDLAQKVVSLCVSLGEYPIIRYYRPRTPTHEASVLCSHLARFIQNELDQFAQSQRDFPPPSPRPRGVLLLADRSMDMVAPLIHEFTYQSMVHDLLPLKDGDKVTYSTVINSGSGSEEKKDMEINEEDNVWVEYRHQHMKDVLEKLGQDFAKFREANPQFAEDNDKANVNTIKDMLAGLTEFQKGRDAYTLHLNMAQECMKFFQDHKLLEVSSVEQCLATGLDENYKKAKNLAAQLVQLLDDDAVVRPDRLRLLLLYIMYKGGLLAGDIRKLIAHAQLTPQDGQVVSNLDLLGIRVEKPLKDDKQPVQPLFPRKPPAATEIDETSLSRYELNVKLLLEEQVRGTLDPALFPFTRPHTTADGMAQQDALAQASLRSAKPTWARTRGSAEQPRQRIILFMAGGATYGESRACYEASQIFGKDIYLATSHMITPNLFLRQVSDLSADRRRLDIPAERPKPTAPAHLFEKDPPPPPVQQQPAAKKAPHPNLNPPVPTAAMHAMSLGSNAQKAPSGTPSASSKPHKEKKEKEKKRLHFFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.24
3 0.26
4 0.2
5 0.27
6 0.31
7 0.33
8 0.34
9 0.32
10 0.27
11 0.26
12 0.31
13 0.3
14 0.34
15 0.35
16 0.37
17 0.38
18 0.38
19 0.37
20 0.32
21 0.26
22 0.19
23 0.14
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.09
30 0.09
31 0.11
32 0.17
33 0.25
34 0.32
35 0.36
36 0.41
37 0.45
38 0.49
39 0.55
40 0.52
41 0.48
42 0.45
43 0.45
44 0.41
45 0.38
46 0.33
47 0.26
48 0.22
49 0.18
50 0.14
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.12
57 0.11
58 0.12
59 0.12
60 0.1
61 0.13
62 0.15
63 0.22
64 0.31
65 0.33
66 0.37
67 0.39
68 0.48
69 0.53
70 0.57
71 0.59
72 0.57
73 0.62
74 0.6
75 0.58
76 0.52
77 0.47
78 0.46
79 0.39
80 0.33
81 0.3
82 0.34
83 0.34
84 0.35
85 0.37
86 0.4
87 0.42
88 0.47
89 0.5
90 0.49
91 0.51
92 0.52
93 0.47
94 0.42
95 0.39
96 0.35
97 0.3
98 0.26
99 0.22
100 0.18
101 0.2
102 0.18
103 0.16
104 0.14
105 0.16
106 0.14
107 0.16
108 0.17
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.21
113 0.22
114 0.26
115 0.28
116 0.31
117 0.33
118 0.38
119 0.37
120 0.37
121 0.39
122 0.35
123 0.31
124 0.32
125 0.35
126 0.29
127 0.29
128 0.29
129 0.27
130 0.3
131 0.31
132 0.26
133 0.2
134 0.23
135 0.24
136 0.26
137 0.24
138 0.22
139 0.22
140 0.24
141 0.25
142 0.24
143 0.21
144 0.17
145 0.16
146 0.16
147 0.15
148 0.12
149 0.1
150 0.08
151 0.09
152 0.08
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.18
161 0.23
162 0.3
163 0.36
164 0.39
165 0.43
166 0.51
167 0.56
168 0.56
169 0.57
170 0.49
171 0.48
172 0.47
173 0.4
174 0.32
175 0.26
176 0.2
177 0.17
178 0.17
179 0.13
180 0.12
181 0.13
182 0.16
183 0.18
184 0.18
185 0.17
186 0.18
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.17
191 0.15
192 0.17
193 0.17
194 0.24
195 0.26
196 0.27
197 0.36
198 0.39
199 0.48
200 0.53
201 0.52
202 0.49
203 0.49
204 0.51
205 0.42
206 0.41
207 0.35
208 0.32
209 0.31
210 0.27
211 0.24
212 0.21
213 0.19
214 0.12
215 0.09
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.14
232 0.14
233 0.11
234 0.12
235 0.11
236 0.11
237 0.14
238 0.14
239 0.12
240 0.13
241 0.14
242 0.14
243 0.17
244 0.17
245 0.14
246 0.15
247 0.14
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.08
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.11
260 0.14
261 0.14
262 0.15
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.12
267 0.13
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.09
272 0.13
273 0.19
274 0.19
275 0.2
276 0.23
277 0.27
278 0.31
279 0.31
280 0.28
281 0.24
282 0.23
283 0.22
284 0.25
285 0.21
286 0.16
287 0.14
288 0.15
289 0.21
290 0.21
291 0.21
292 0.26
293 0.27
294 0.3
295 0.3
296 0.31
297 0.23
298 0.24
299 0.3
300 0.2
301 0.21
302 0.18
303 0.18
304 0.14
305 0.17
306 0.18
307 0.13
308 0.13
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.07
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.14
325 0.13
326 0.13
327 0.2
328 0.21
329 0.17
330 0.19
331 0.19
332 0.16
333 0.17
334 0.17
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.09
339 0.1
340 0.11
341 0.16
342 0.19
343 0.19
344 0.2
345 0.2
346 0.2
347 0.19
348 0.19
349 0.14
350 0.1
351 0.1
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.04
358 0.05
359 0.05
360 0.1
361 0.11
362 0.12
363 0.16
364 0.17
365 0.17
366 0.17
367 0.19
368 0.18
369 0.22
370 0.26
371 0.24
372 0.24
373 0.24
374 0.23
375 0.2
376 0.16
377 0.12
378 0.07
379 0.04
380 0.05
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.09
390 0.08
391 0.1
392 0.11
393 0.12
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.09
398 0.09
399 0.06
400 0.05
401 0.04
402 0.03
403 0.07
404 0.08
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.11
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.13
415 0.16
416 0.18
417 0.19
418 0.17
419 0.15
420 0.14
421 0.14
422 0.12
423 0.11
424 0.1
425 0.11
426 0.1
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.1
435 0.1
436 0.14
437 0.23
438 0.25
439 0.3
440 0.37
441 0.4
442 0.49
443 0.56
444 0.53
445 0.51
446 0.53
447 0.56
448 0.55
449 0.56
450 0.51
451 0.44
452 0.46
453 0.42
454 0.41
455 0.37
456 0.33
457 0.3
458 0.27
459 0.28
460 0.25
461 0.23
462 0.2
463 0.16
464 0.14
465 0.11
466 0.1
467 0.14
468 0.16
469 0.18
470 0.19
471 0.18
472 0.19
473 0.19
474 0.22
475 0.17
476 0.15
477 0.13
478 0.13
479 0.14
480 0.13
481 0.13
482 0.13
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.15
487 0.14
488 0.15
489 0.18
490 0.19
491 0.23
492 0.24
493 0.27
494 0.26
495 0.27
496 0.28
497 0.27
498 0.27
499 0.24
500 0.23
501 0.2
502 0.15
503 0.15
504 0.13
505 0.11
506 0.06
507 0.05
508 0.05
509 0.07
510 0.1
511 0.1
512 0.13
513 0.13
514 0.19
515 0.25
516 0.34
517 0.4
518 0.46
519 0.48
520 0.49
521 0.56
522 0.56
523 0.6
524 0.61
525 0.61
526 0.62
527 0.64
528 0.62
529 0.56
530 0.5
531 0.41
532 0.33
533 0.3
534 0.21
535 0.17
536 0.15
537 0.14
538 0.14
539 0.12
540 0.11
541 0.05
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.09
547 0.09
548 0.09
549 0.12
550 0.14
551 0.17
552 0.19
553 0.18
554 0.17
555 0.17
556 0.17
557 0.15
558 0.13
559 0.11
560 0.09
561 0.1
562 0.1
563 0.11
564 0.12
565 0.13
566 0.14
567 0.12
568 0.14
569 0.17
570 0.18
571 0.18
572 0.17
573 0.17
574 0.19
575 0.2
576 0.19
577 0.19
578 0.19
579 0.24
580 0.31
581 0.32
582 0.3
583 0.32
584 0.31
585 0.3
586 0.33
587 0.36
588 0.38
589 0.46
590 0.5
591 0.51
592 0.52
593 0.51
594 0.52
595 0.46
596 0.47
597 0.4
598 0.4
599 0.44
600 0.46
601 0.47
602 0.44
603 0.49
604 0.44
605 0.45
606 0.44
607 0.41
608 0.41
609 0.46
610 0.51
611 0.5
612 0.52
613 0.57
614 0.61
615 0.66
616 0.67
617 0.63
618 0.62
619 0.66
620 0.68
621 0.67
622 0.64
623 0.67
624 0.71
625 0.75
626 0.69
627 0.6
628 0.53
629 0.46
630 0.41
631 0.34
632 0.29
633 0.23
634 0.21
635 0.2
636 0.17
637 0.16
638 0.16
639 0.14
640 0.11
641 0.11
642 0.11
643 0.12
644 0.14
645 0.16
646 0.18
647 0.21
648 0.25
649 0.24
650 0.28
651 0.32
652 0.34
653 0.41
654 0.46
655 0.51
656 0.57
657 0.66
658 0.72
659 0.77
660 0.83
661 0.86
662 0.9
663 0.92
664 0.92
665 0.94
666 0.94