Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JYY5

Protein Details
Accession B6JYY5    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-61DSSNPRPTKIRLKRAREPGLGYHydrophilic
185-208VTPPMHWVRQKRFRKRVSNRTIEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-55KAGPPPSAEPKIHIKAPKANGSGVSKIRIRAARDSSNPRPTKIRLKRAR
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 4, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MVKLKIKAGPPPSAEPKIHIKAPKANGSGVSKIRIRAARDSSNPRPTKIRLKRAREPGLGYDSEASDREEDPYIEEQIMLRMPPGEDCDYVRKAIENREVGRGADIWIKFKDNRRAVIHVNGHMYAAKLVDLPCIIESSKSYDKKVVFKTADISQMLLVEKRIEHEDDVPMDPLKLKDYVYPHGVTPPMHWVRQKRFRKRVSNRTIEAVEAEVDRLLALDEQAETSIHELIDSAQLARESSMALSEDMSFNNTQFRRGETTEREESVSQADLFDGMDEDDLAGQIEQGMLELNQSTTRETTAETHQAADESASDEDEEEEDEDDNDADDETRENKRQNRLVREFISELESSIQKRKRDADEATNPILRNRFLADVNRMVTELELKRAQLEDNTDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.53
3 0.56
4 0.54
5 0.56
6 0.53
7 0.51
8 0.53
9 0.59
10 0.64
11 0.57
12 0.54
13 0.53
14 0.53
15 0.54
16 0.48
17 0.46
18 0.39
19 0.39
20 0.44
21 0.43
22 0.42
23 0.44
24 0.48
25 0.51
26 0.57
27 0.64
28 0.66
29 0.72
30 0.7
31 0.64
32 0.63
33 0.61
34 0.64
35 0.65
36 0.67
37 0.67
38 0.73
39 0.8
40 0.84
41 0.87
42 0.81
43 0.75
44 0.7
45 0.65
46 0.57
47 0.49
48 0.4
49 0.31
50 0.28
51 0.24
52 0.19
53 0.15
54 0.15
55 0.16
56 0.16
57 0.15
58 0.17
59 0.19
60 0.19
61 0.17
62 0.17
63 0.14
64 0.15
65 0.16
66 0.12
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.15
72 0.16
73 0.16
74 0.19
75 0.25
76 0.25
77 0.26
78 0.25
79 0.24
80 0.24
81 0.31
82 0.35
83 0.35
84 0.36
85 0.4
86 0.41
87 0.37
88 0.36
89 0.29
90 0.23
91 0.22
92 0.21
93 0.19
94 0.19
95 0.22
96 0.25
97 0.33
98 0.41
99 0.4
100 0.47
101 0.48
102 0.51
103 0.5
104 0.55
105 0.52
106 0.45
107 0.42
108 0.36
109 0.32
110 0.28
111 0.25
112 0.16
113 0.12
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.14
126 0.22
127 0.24
128 0.25
129 0.29
130 0.32
131 0.39
132 0.43
133 0.44
134 0.37
135 0.36
136 0.38
137 0.36
138 0.38
139 0.3
140 0.27
141 0.18
142 0.19
143 0.18
144 0.15
145 0.12
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.13
153 0.14
154 0.15
155 0.16
156 0.16
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.09
164 0.12
165 0.15
166 0.18
167 0.2
168 0.21
169 0.19
170 0.2
171 0.21
172 0.18
173 0.16
174 0.22
175 0.21
176 0.22
177 0.26
178 0.3
179 0.38
180 0.48
181 0.57
182 0.58
183 0.66
184 0.73
185 0.81
186 0.84
187 0.87
188 0.86
189 0.84
190 0.75
191 0.69
192 0.6
193 0.49
194 0.4
195 0.29
196 0.2
197 0.12
198 0.1
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.16
239 0.15
240 0.17
241 0.17
242 0.2
243 0.23
244 0.25
245 0.32
246 0.3
247 0.37
248 0.38
249 0.38
250 0.38
251 0.33
252 0.31
253 0.26
254 0.22
255 0.15
256 0.12
257 0.1
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.06
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.03
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.04
276 0.03
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.11
286 0.12
287 0.15
288 0.18
289 0.24
290 0.23
291 0.23
292 0.23
293 0.23
294 0.21
295 0.18
296 0.13
297 0.1
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.08
317 0.11
318 0.17
319 0.22
320 0.29
321 0.35
322 0.44
323 0.52
324 0.59
325 0.66
326 0.67
327 0.71
328 0.68
329 0.67
330 0.59
331 0.52
332 0.47
333 0.37
334 0.3
335 0.25
336 0.25
337 0.22
338 0.29
339 0.34
340 0.33
341 0.38
342 0.45
343 0.49
344 0.54
345 0.58
346 0.59
347 0.63
348 0.66
349 0.66
350 0.63
351 0.56
352 0.52
353 0.49
354 0.39
355 0.32
356 0.28
357 0.27
358 0.26
359 0.32
360 0.34
361 0.37
362 0.38
363 0.37
364 0.34
365 0.3
366 0.27
367 0.29
368 0.24
369 0.25
370 0.25
371 0.24
372 0.26
373 0.27
374 0.29
375 0.25