Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HMK3

Protein Details
Accession A0A397HMK3    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-178KLIGRHKRKRTEEDGQHVKRKEGRREKRSRRLRDMEDGADEGEGKSRRRDRKKRDPTPEDEELBasic
193-214MDEALKKPTKRRFRKQDGIDLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-170GRHKRKRTEEDGQHVKRKEGRREKRSRRLRDMEDGADEGEGKSRRRDRKKRD
185-189RRRAL
191-191R
195-207EALKKPTKRRFRK
439-452MRARQIAASKGSRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDSPEIKPGSPTGAVSDHEPHTDLPEEPVKAPTPGGDDDNNEEAQEEGAASVTPAAESITEDHADDAADKEDAGVDSDEESILSEVDEAQFEDFDPENVDIEDRPQLAIDEDNLKLIGRHKRKRTEEDGQHVKRKEGRREKRSRRLRDMEDGADEGEGKSRRRDRKKRDPTPEDEELLDPATRRRRALDRAMDEALKKPTKRRFRKQDGIDLEQMADAEIEDMRKRMTHAAQMDANNRREGRPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLMTALGKLPINKETLIASGIGKVIVFYTKSKRPEPGIKRMAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYQEAEYDPRKVTTRTTSAQASVAEARSRELLPPRLANRARAEITHTSYTIVPRPTVVQESKFARPLGASGEDRFRRMRARQIAASKGSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.25
4 0.29
5 0.26
6 0.26
7 0.27
8 0.23
9 0.24
10 0.26
11 0.23
12 0.22
13 0.27
14 0.28
15 0.27
16 0.31
17 0.28
18 0.27
19 0.27
20 0.23
21 0.22
22 0.22
23 0.25
24 0.23
25 0.24
26 0.29
27 0.32
28 0.3
29 0.25
30 0.23
31 0.19
32 0.17
33 0.14
34 0.09
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.05
39 0.06
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.06
46 0.09
47 0.11
48 0.12
49 0.12
50 0.13
51 0.13
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.09
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.08
68 0.09
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.09
89 0.11
90 0.14
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.13
104 0.18
105 0.26
106 0.33
107 0.42
108 0.5
109 0.6
110 0.68
111 0.75
112 0.78
113 0.78
114 0.77
115 0.78
116 0.8
117 0.77
118 0.76
119 0.69
120 0.64
121 0.61
122 0.6
123 0.61
124 0.62
125 0.66
126 0.69
127 0.79
128 0.86
129 0.9
130 0.92
131 0.91
132 0.9
133 0.88
134 0.83
135 0.8
136 0.74
137 0.66
138 0.57
139 0.47
140 0.37
141 0.28
142 0.23
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.2
148 0.28
149 0.38
150 0.49
151 0.6
152 0.65
153 0.75
154 0.85
155 0.89
156 0.91
157 0.89
158 0.85
159 0.83
160 0.76
161 0.66
162 0.56
163 0.46
164 0.35
165 0.28
166 0.22
167 0.14
168 0.15
169 0.21
170 0.21
171 0.21
172 0.25
173 0.29
174 0.35
175 0.44
176 0.48
177 0.44
178 0.46
179 0.47
180 0.44
181 0.39
182 0.36
183 0.33
184 0.29
185 0.26
186 0.29
187 0.37
188 0.46
189 0.56
190 0.63
191 0.68
192 0.74
193 0.83
194 0.81
195 0.82
196 0.77
197 0.72
198 0.63
199 0.52
200 0.42
201 0.32
202 0.27
203 0.17
204 0.11
205 0.06
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.1
215 0.11
216 0.16
217 0.17
218 0.2
219 0.23
220 0.26
221 0.31
222 0.34
223 0.34
224 0.31
225 0.3
226 0.28
227 0.27
228 0.25
229 0.24
230 0.27
231 0.34
232 0.37
233 0.4
234 0.41
235 0.4
236 0.43
237 0.43
238 0.35
239 0.26
240 0.21
241 0.19
242 0.18
243 0.18
244 0.14
245 0.12
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.12
250 0.13
251 0.14
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.07
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.12
280 0.12
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.14
295 0.14
296 0.16
297 0.16
298 0.16
299 0.13
300 0.14
301 0.13
302 0.12
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.09
312 0.11
313 0.17
314 0.24
315 0.29
316 0.32
317 0.36
318 0.41
319 0.5
320 0.55
321 0.59
322 0.61
323 0.6
324 0.61
325 0.61
326 0.56
327 0.49
328 0.42
329 0.33
330 0.33
331 0.3
332 0.26
333 0.24
334 0.23
335 0.24
336 0.24
337 0.24
338 0.19
339 0.21
340 0.25
341 0.31
342 0.38
343 0.37
344 0.4
345 0.42
346 0.43
347 0.43
348 0.41
349 0.35
350 0.28
351 0.32
352 0.36
353 0.41
354 0.39
355 0.4
356 0.38
357 0.39
358 0.4
359 0.34
360 0.32
361 0.31
362 0.35
363 0.36
364 0.39
365 0.39
366 0.38
367 0.39
368 0.35
369 0.3
370 0.27
371 0.26
372 0.24
373 0.21
374 0.21
375 0.21
376 0.22
377 0.23
378 0.26
379 0.3
380 0.33
381 0.4
382 0.42
383 0.49
384 0.51
385 0.53
386 0.52
387 0.52
388 0.49
389 0.42
390 0.46
391 0.42
392 0.46
393 0.42
394 0.37
395 0.32
396 0.32
397 0.35
398 0.34
399 0.31
400 0.25
401 0.23
402 0.26
403 0.28
404 0.34
405 0.34
406 0.32
407 0.36
408 0.41
409 0.45
410 0.47
411 0.43
412 0.36
413 0.32
414 0.31
415 0.29
416 0.3
417 0.27
418 0.26
419 0.36
420 0.37
421 0.4
422 0.41
423 0.39
424 0.41
425 0.44
426 0.51
427 0.51
428 0.56
429 0.61
430 0.67
431 0.71
432 0.7