Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397HDJ5

Protein Details
Accession A0A397HDJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
281-307EEIEKPLSKREMKRRAKKARLEAGDGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
286-300PLSKREMKRRAKKAR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.833, cyto 8, cyto_mito 5.833, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016195  Pol/histidinol_Pase-like  
IPR002738  RNase_P_p30  
Gene Ontology GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01876  RNase_P_p30  
Amino Acid Sequences MFYDLNVPYSSDDPEISDTLSFLSELGYTTVALSQTISGKLPSNLAPPPAPPNAPKNLKLLSRVNLTLSDPAQNQRLASLAQVYDLVALRPTNEKALLNACTNLECDLISLDLSVRLPFYFKFKMLSAAIERGVRLEICYGPGVTGSGLEARRNLIGNAMSLIRATRGRGIVVSSEARRALGVRAPWDVINLTCVWGLSQELGKEAVCEEARKVTALAKLKRTSWRGVIDIVDGGQKSKSQAVESGMGQKGTPSKKKGVSQAGTGDNLKRKASLGSEAAVEEIEKPLSKREMKRRAKKARLEAGDGGGNAAGSGATVASG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.18
4 0.16
5 0.14
6 0.13
7 0.13
8 0.11
9 0.08
10 0.08
11 0.07
12 0.08
13 0.09
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.11
18 0.1
19 0.1
20 0.09
21 0.1
22 0.12
23 0.14
24 0.14
25 0.14
26 0.16
27 0.17
28 0.19
29 0.19
30 0.21
31 0.22
32 0.24
33 0.24
34 0.23
35 0.28
36 0.29
37 0.3
38 0.29
39 0.33
40 0.39
41 0.44
42 0.44
43 0.44
44 0.45
45 0.45
46 0.48
47 0.48
48 0.43
49 0.43
50 0.41
51 0.38
52 0.34
53 0.33
54 0.3
55 0.25
56 0.24
57 0.21
58 0.22
59 0.24
60 0.23
61 0.21
62 0.18
63 0.18
64 0.14
65 0.13
66 0.14
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.12
78 0.12
79 0.13
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.19
84 0.21
85 0.19
86 0.19
87 0.18
88 0.16
89 0.17
90 0.16
91 0.12
92 0.09
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.13
107 0.14
108 0.14
109 0.17
110 0.17
111 0.21
112 0.21
113 0.23
114 0.19
115 0.19
116 0.2
117 0.18
118 0.18
119 0.14
120 0.14
121 0.11
122 0.09
123 0.09
124 0.07
125 0.08
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.04
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.11
158 0.1
159 0.12
160 0.14
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.14
175 0.13
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.11
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.13
198 0.14
199 0.14
200 0.14
201 0.13
202 0.18
203 0.26
204 0.3
205 0.34
206 0.36
207 0.4
208 0.47
209 0.48
210 0.46
211 0.44
212 0.44
213 0.38
214 0.37
215 0.34
216 0.27
217 0.24
218 0.2
219 0.17
220 0.13
221 0.12
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.14
226 0.15
227 0.14
228 0.17
229 0.19
230 0.22
231 0.22
232 0.28
233 0.26
234 0.25
235 0.23
236 0.22
237 0.26
238 0.3
239 0.36
240 0.34
241 0.4
242 0.46
243 0.52
244 0.59
245 0.62
246 0.57
247 0.55
248 0.57
249 0.53
250 0.5
251 0.46
252 0.43
253 0.39
254 0.39
255 0.35
256 0.29
257 0.27
258 0.27
259 0.28
260 0.28
261 0.24
262 0.22
263 0.23
264 0.22
265 0.21
266 0.18
267 0.15
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.11
273 0.16
274 0.23
275 0.31
276 0.4
277 0.5
278 0.6
279 0.69
280 0.79
281 0.85
282 0.89
283 0.91
284 0.91
285 0.91
286 0.9
287 0.85
288 0.81
289 0.73
290 0.65
291 0.59
292 0.49
293 0.39
294 0.28
295 0.22
296 0.15
297 0.12
298 0.08
299 0.04
300 0.04