FuNGI

A0A397GN77

Protein Details

Accession

A0A397GN77

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MPSNKVEKKRKRDSDRHERPSKKPALE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-23	EKKRKRDSDRHERPSKK
481-510	KGGKAEAAARRVARLKVPVEFPKVSRGGRR

Subcellular Location(s)

nucl 11, mito 11, mito_nucl 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MPSNKVEKKRKRDSDRHERPSKKPALELQDLPPLSASVVDEHSELAPVIITTPGVNAPRNLRFTPYLKARANSSSSANRNKGIVSSELLLQSSEHPKLDFVGREAEEDADSQLKHYVAVVDPEKKTWQLVEVRKLTVRGAVRRMKPLTEEEESSEEEEVKTMRTQRTELTNTFGTKQSRKAAQSMAENAQLSNAPAGAANAAESAIISSMPADAVADIASKAAAVQAQVQANKPIPQANLDATHPADVYPIDVLVPNGLATLRQLPGVKEWADTVSAGLPVATTSRYVSRRVEAVVKFGNTTHLQLLRFILLLLELARSLRSGRDPKSSSGPGSKRLPPREELRRILSSASGNPASSTTTTTKPQQQTTSQTDSGSGTLPDPVIDAIRRKFAPQGSHLTKNDITFLHTSICALSLHIPPQPAKDGGASSLGGNSPNELATDPADLRDDLRLESATILQYFRELGCRVDKPRETEFAKWGIKGGKAEAAARRVARLKVPVEFPKVSRGGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.93
2	0.94
3	0.94
4	0.93
5	0.9
6	0.86
7	0.86
8	0.85
9	0.77
10	0.72
11	0.7
12	0.68
13	0.66
14	0.64
15	0.57
16	0.57
17	0.53
18	0.46
19	0.38
20	0.3
21	0.23
22	0.2
23	0.17
24	0.1
25	0.12
26	0.13
27	0.13
28	0.14
29	0.14
30	0.13
31	0.12
32	0.1
33	0.08
34	0.07
35	0.07
36	0.07
37	0.07
38	0.06
39	0.07
40	0.11
41	0.14
42	0.16
43	0.18
44	0.25
45	0.31
46	0.37
47	0.36
48	0.37
49	0.4
50	0.41
51	0.47
52	0.49
53	0.52
54	0.5
55	0.51
56	0.5
57	0.51
58	0.52
59	0.46
60	0.43
61	0.43
62	0.46
63	0.53
64	0.52
65	0.48
66	0.45
67	0.43
68	0.39
69	0.33
70	0.27
71	0.21
72	0.19
73	0.2
74	0.2
75	0.2
76	0.18
77	0.15
78	0.18
79	0.21
80	0.21
81	0.2
82	0.19
83	0.19
84	0.21
85	0.25
86	0.22
87	0.18
88	0.24
89	0.23
90	0.24
91	0.25
92	0.24
93	0.19
94	0.18
95	0.18
96	0.13
97	0.13
98	0.12
99	0.14
100	0.12
101	0.12
102	0.12
103	0.13
104	0.11
105	0.17
106	0.2
107	0.24
108	0.25
109	0.27
110	0.28
111	0.27
112	0.27
113	0.22
114	0.23
115	0.26
116	0.32
117	0.39
118	0.41
119	0.43
120	0.43
121	0.44
122	0.38
123	0.35
124	0.34
125	0.3
126	0.35
127	0.41
128	0.42
129	0.49
130	0.51
131	0.46
132	0.44
133	0.43
134	0.4
135	0.35
136	0.33
137	0.28
138	0.29
139	0.28
140	0.27
141	0.23
142	0.17
143	0.14
144	0.13
145	0.11
146	0.09
147	0.11
148	0.16
149	0.18
150	0.2
151	0.21
152	0.24
153	0.32
154	0.35
155	0.34
156	0.33
157	0.34
158	0.33
159	0.33
160	0.35
161	0.31
162	0.29
163	0.33
164	0.34
165	0.37
166	0.37
167	0.38
168	0.37
169	0.37
170	0.38
171	0.38
172	0.34
173	0.31
174	0.29
175	0.26
176	0.23
177	0.19
178	0.15
179	0.11
180	0.08
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.03
205	0.03
206	0.03
207	0.03
208	0.03
209	0.03
210	0.04
211	0.04
212	0.06
213	0.09
214	0.11
215	0.13
216	0.14
217	0.15
218	0.16
219	0.18
220	0.17
221	0.17
222	0.15
223	0.16
224	0.17
225	0.16
226	0.17
227	0.15
228	0.16
229	0.13
230	0.14
231	0.12
232	0.1
233	0.09
234	0.07
235	0.07
236	0.05
237	0.05
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.03
244	0.04
245	0.03
246	0.03
247	0.04
248	0.06
249	0.06
250	0.08
251	0.09
252	0.09
253	0.11
254	0.14
255	0.14
256	0.12
257	0.12
258	0.11
259	0.11
260	0.1
261	0.09
262	0.07
263	0.06
264	0.06
265	0.05
266	0.04
267	0.04
268	0.05
269	0.05
270	0.04
271	0.05
272	0.11
273	0.13
274	0.16
275	0.18
276	0.19
277	0.2
278	0.21
279	0.27
280	0.22
281	0.24
282	0.24
283	0.23
284	0.21
285	0.2
286	0.23
287	0.17
288	0.18
289	0.16
290	0.17
291	0.17
292	0.17
293	0.18
294	0.15
295	0.14
296	0.12
297	0.09
298	0.06
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.04
304	0.05
305	0.05
306	0.06
307	0.07
308	0.13
309	0.19
310	0.22
311	0.31
312	0.33
313	0.35
314	0.42
315	0.43
316	0.39
317	0.42
318	0.42
319	0.39
320	0.42
321	0.47
322	0.49
323	0.53
324	0.53
325	0.49
326	0.54
327	0.58
328	0.6
329	0.58
330	0.55
331	0.51
332	0.49
333	0.45
334	0.39
335	0.31
336	0.25
337	0.25
338	0.2
339	0.17
340	0.17
341	0.17
342	0.16
343	0.14
344	0.16
345	0.15
346	0.17
347	0.21
348	0.25
349	0.33
350	0.36
351	0.4
352	0.41
353	0.43
354	0.48
355	0.52
356	0.55
357	0.47
358	0.43
359	0.39
360	0.35
361	0.31
362	0.24
363	0.18
364	0.11
365	0.11
366	0.11
367	0.09
368	0.09
369	0.08
370	0.09
371	0.11
372	0.15
373	0.16
374	0.21
375	0.22
376	0.23
377	0.27
378	0.3
379	0.34
380	0.33
381	0.42
382	0.43
383	0.51
384	0.51
385	0.52
386	0.49
387	0.44
388	0.43
389	0.33
390	0.3
391	0.23
392	0.23
393	0.19
394	0.17
395	0.17
396	0.14
397	0.15
398	0.11
399	0.1
400	0.13
401	0.14
402	0.16
403	0.18
404	0.2
405	0.2
406	0.23
407	0.26
408	0.23
409	0.22
410	0.21
411	0.2
412	0.19
413	0.21
414	0.18
415	0.14
416	0.15
417	0.15
418	0.14
419	0.13
420	0.13
421	0.11
422	0.11
423	0.11
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.13
428	0.12
429	0.13
430	0.14
431	0.14
432	0.15
433	0.17
434	0.17
435	0.15
436	0.16
437	0.16
438	0.14
439	0.16
440	0.17
441	0.15
442	0.16
443	0.15
444	0.13
445	0.13
446	0.14
447	0.14
448	0.17
449	0.15
450	0.17
451	0.24
452	0.3
453	0.35
454	0.43
455	0.47
456	0.48
457	0.52
458	0.58
459	0.55
460	0.54
461	0.54
462	0.53
463	0.52
464	0.46
465	0.45
466	0.41
467	0.4
468	0.38
469	0.35
470	0.31
471	0.3
472	0.34
473	0.35
474	0.34
475	0.36
476	0.35
477	0.37
478	0.37
479	0.38
480	0.39
481	0.4
482	0.41
483	0.41
484	0.48
485	0.5
486	0.53
487	0.54
488	0.5
489	0.52
490	0.54

A0A397GN77

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer